seq1 = pF1KE0529.tfa, 642 bp
seq2 = pF1KE0529/gi568815576f_38368234.tfa (gi568815576f:38368234_38582533), 214300 bp

>pF1KE0529 642
>gi568815576f:38368234_38582533 (Chr22)

1-91  (100001-100091)   100% ->
92-192  (106290-106390)   100% ->
193-351  (111360-111518)   100% ->
352-604  (112979-113231)   100% ->
605-642  (114263-114300)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGTGTTCCGAATCCTCGGCGACCTGAGCCACCTCCTGGCCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACGTGTTCCGAATCCTCGGCGACCTGAGCCACCTCCTGGCCATGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGCTGCTGGGGAAGATCTGGAGGTCCAAGTGCTGCAAGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100051 CTTGCTGCTGGGGAAGATCTGGAGGTCCAAGTGCTGCAAGGGTG...CAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCATCTCTGGGAAGAGCCAGATCCTGTTTGCTCTCGTCTTCACCACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106290 GCATCTCTGGGAAGAGCCAGATCCTGTTTGCTCTCGTCTTCACCACCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACCTGGACCTGTTCACCAACTTCATCTCCATCTACAACACAGTAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106340 TACCTGGACCTGTTCACCAACTTCATCTCCATCTACAACACAGTAATGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 G         GTGGTTTTTCTCCTCTGTGCCTATGTTACAGTGTACATGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106390 GGTG...TAGGTGGTTTTTCTCCTCTGTGCCTATGTTACAGTGTACATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TATATGGGAAATTCCGTAAAACTTTTGACAGTGAGAATGACACATTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111400 TATATGGGAAATTCCGTAAAACTTTTGACAGTGAGAATGACACATTCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGAGTTTCTTCTGGTCCCAGTCATTGGCCTTTCCTTCCTTGAAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111450 CTGGAGTTTCTTCTGGTCCCAGTCATTGGCCTTTCCTTCCTTGAAAACTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGTTTCACTCTGCTGGAG         ATCCTCTGGACTTTCTCTATCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 111500 CAGTTTCACTCTGCTGGAGGTA...CAGATCCTCTGGACTTTCTCTATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCTGGAATCAGTGGCTATCCTGCCCCAGCTCTTCATGATCAGCAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113001 ATCTGGAATCAGTGGCTATCCTGCCCCAGCTCTTCATGATCAGCAAGACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGAGAGGCTGAGACCATAACTACTCACTACCTGTTCTTTCTGGGTCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113051 GGAGAGGCTGAGACCATAACTACTCACTACCTGTTCTTTCTGGGTCTGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCGGGCACTCTACCTGGCTAACTGGATCAGGCGGTACCAGACTGAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113101 CCGGGCACTCTACCTGGCTAACTGGATCAGGCGGTACCAGACTGAGAATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCTATGACCAAATTGCAGTCGTGTCTGGAGTAGTACAAACCATCTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113151 TCTATGACCAAATTGCAGTCGTGTCTGGAGTAGTACAAACCATCTTCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGTGACTTCTTCTACTTGTATGTGACCAAAG         TCCTTAAGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 113201 TGTGACTTCTTCTACTTGTATGTGACCAAAGGTA...CAGTCCTTAAGGG

    650     .    :    .    :    .
    615 AAAGAAGTTAAGTCTTCCAATGCCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 114273 AAAGAAGTTAAGTCTTCCAATGCCAATC