seq1 = pF1KE0527.tfa, 732 bp
seq2 = pF1KE0527/gi568815576f_23880198.tfa (gi568815576f:23880198_24083603), 203406 bp

>pF1KE0527 732
>gi568815576f:23880198_24083603 (Chr22)

(complement)

1-112  (122473-122584)   100% ->
113-200  (123223-123310)   100% ->
201-351  (124903-125053)   100% ->
352-525  (125146-125319)   100% ->
526-732  (125672-125878)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCTAGAGCTGTTTCTTGACCTGGTGTCCCAGCCCAGCCGCGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122473 ATGGGCCTAGAGCTGTTTCTTGACCTGGTGTCCCAGCCCAGCCGCGCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACATCTTCGCCAAGAAGAATGGCATCCCCTTAGAGCTGCGCACCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122523 CTACATCTTCGCCAAGAAGAATGGCATCCCCTTAGAGCTGCGCACCGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATTTGGTCAAAG         GGCAGCACAAGAGCAAGGAGTTCTTGCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 122573 ATTTGGTCAAAGGTG...CAGGGCAGCACAAGAGCAAGGAGTTCTTGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCAACAGCCTGGGGAAACTGCCGACGCTCAAGGATGGTGATTTCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123252 ATCAACAGCCTGGGGAAACTGCCGACGCTCAAGGATGGTGATTTCATCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACCGAAAG         CTCGGCCATCCTGATTTACCTGAGCTGTAAGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 123302 GACCGAAAGGTG...CAGCTCGGCCATCCTGATTTACCTGAGCTGTAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCAGACGCCGGACCACTGGTATCCATCTGACCTGCAGGCTCGTGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124935 ACCAGACGCCGGACCACTGGTATCCATCTGACCTGCAGGCTCGTGCCCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTCATGAGTACCTGGGCTGGCATGCCGACTGCATCCGTGGCACCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124985 GTTCATGAGTACCTGGGCTGGCATGCCGACTGCATCCGTGGCACCTTTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TATACCCCTGTGGGTCCAG         GTGTTGGGGCCACTCATTGGGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 125035 TATACCCCTGTGGGTCCAGGTG...CAGGTGTTGGGGCCACTCATTGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCCAGGTGCCCGAGGAGAAGGTGGAACGCAACAGGACTGCCATGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125168 TCCAGGTGCCCGAGGAGAAGGTGGAACGCAACAGGACTGCCATGGACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCCTGCAATGGCTGGAGGACAAGTTCCTGGGGGACAGGCCCTTCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125218 GCCCTGCAATGGCTGGAGGACAAGTTCCTGGGGGACAGGCCCTTCCTCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGCCAGCAGGTGACACTGGCTGATCTCATGGCCCTGGAGGAGCTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125268 TGGCCAGCAGGTGACACTGGCTGATCTCATGGCCCTGGAGGAGCTGATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AG         CCGGTGGCTCTCGGCTATGAACTGTTTGAGGGACGGCCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125318 AGGTG...CAGCCGGTGGCTCTCGGCTATGAACTGTTTGAGGGACGGCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGACTGGCAGCATGGCGTGGACGAGTGGAGGCTTTCCTGGGTGCTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125711 CGACTGGCAGCATGGCGTGGACGAGTGGAGGCTTTCCTGGGTGCTGAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ATGCCAGGAGGCCCACAGCATCATCTTGAGCATCCTGGAACAGGCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125761 ATGCCAGGAGGCCCACAGCATCATCTTGAGCATCCTGGAACAGGCGGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAAAACCCTCCCAACACCCTCACCAGAGGCCTATCAGGCTATGCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125811 AGAAAACCCTCCCAACACCCTCACCAGAGGCCTATCAGGCTATGCTGCTT

    750     .    :    .
    715 CGAATCGCCAGGATCCCC
        ||||||||||||||||||
 125861 CGAATCGCCAGGATCCCC