seq1 = pF1KE0484.tfa, 678 bp
seq2 = pF1KE0484/gi568815576r_17492677.tfa (gi568815576r:17492677_17719528), 226852 bp

>pF1KE0484 678
>gi568815576r:17492677_17719528 (Chr22)

(complement)

1-33  (90894-90926)   100% ->
34-99  (100003-100068)   100% ->
100-209  (106209-106318)   100% ->
210-276  (106651-106717)   100% ->
277-366  (118348-118437)   100% ->
367-435  (119434-119502)   100% ->
436-530  (121241-121335)   100% ->
531-618  (124913-125000)   100% ->
619-678  (126793-126852)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCTCAGCGATGCTGACGTGCAAAAGCAG         ATAAAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  90894 ATGGCTCTCAGCGATGCTGACGTGCAAAAGCAGGTG...TAGATAAAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TATGATGGCTTTCATTGAACAAGAAGCCAATGAGAAAGCAGAAGAAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100011 TATGATGGCTTTCATTGAACAAGAAGCCAATGAGAAAGCAGAAGAAATAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGCAAAG         GCAGAAGAAGAGTTCAACATAGAGAAAGGTCGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100061 ATGCAAAGGTG...TAGGCAGAAGAAGAGTTCAACATAGAGAAAGGTCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTTGTGCAAACCCAAAGACTAAAGATTATGGAATATTATGAGAAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106242 CTTGTGCAAACCCAAAGACTAAAGATTATGGAATATTATGAGAAGAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAACAGATTGAGCAGCAGAAGAAAAT         TCAGATGTCCAATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106292 GAAACAGATTGAGCAGCAGAAGAAAATGTA...CAGTCAGATGTCCAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGATGAATCAAGCGAGACTCAAAGTCCTCAGAGCAAGAGATGACCTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106665 TGATGAATCAAGCGAGACTCAAAGTCCTCAGAGCAAGAGATGACCTTATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACA         GACCTACTAAATGAAGCAAAACAGAGACTCAGCAAGGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106715 ACAGTG...TAGGACCTACTAAATGAAGCAAAACAGAGACTCAGCAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGTAAAAGATACAACCAGGTACCAAGTGCTGCTGGATGGACTGGTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118386 GGTAAAAGATACAACCAGGTACCAAGTGCTGCTGGATGGACTGGTTCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AG         GGTTTGTACCAGTTGCTGGAGCCCCGAATGATTGTTCGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118436 AGGTA...CAGGGTTTGTACCAGTTGCTGGAGCCCCGAATGATTGTTCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TGCAGGAAACAAGATTTCCCTCTGGTAAAG         GCTGCAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 119473 TGCAGGAAACAAGATTTCCCTCTGGTAAAGGTA...CAGGCTGCAGTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 GAAGGCAATTCCTATGTACAAAATTGCCACCAAAAACGATGTTGATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121252 GAAGGCAATTCCTATGTACAAAATTGCCACCAAAAACGATGTTGATGTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AAATTGACCAGGAGTCCTACCTGCCTGAAGACAT         AGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 121302 AAATTGACCAGGAGTCCTACCTGCCTGAAGACATGTA...CAGAGCTGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GGAGTTGAGATCTATAATGGAGATCGTAAAATAAAGGTTTCCAACACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124920 GGAGTTGAGATCTATAATGGAGATCGTAAAATAAAGGTTTCCAACACCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GGAAAGCCGGCTGGATCTCATAGCCCAGCAG         ATGATGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 124970 GGAAAGCCGGCTGGATCTCATAGCCCAGCAGGTG...CAGATGATGCCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 AAGTCCGGGGAGCCTTGTTTGGTGCAAATGCCAACAGGAAGTTTTTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126803 AAGTCCGGGGAGCCTTGTTTGGTGCAAATGCCAACAGGAAGTTTTTGGAC