seq1 = pF1KE0469.tfa, 624 bp
seq2 = pF1KE0469/gi568815582f_2730248.tfa (gi568815582f:2730248_2932156), 201909 bp

>pF1KE0469 624
>gi568815582f:2730248_2932156 (Chr16)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-160  (100168-100246)   100% ->
161-263  (100447-100549)   100% ->
264-624  (101549-101909)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGCCCAGGGGGCCCAGGAGAGTATAAAGGCGATGTGGAGGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGCCCAGGGGGCCCAGGAGAGTATAAAGGCGATGTGGAGGGTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCACAACCAGACGCCCAGTCACAGGCGAG         AGCCCTGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 CGGCACAACCAGACGCCCAGTCACAGGCGAGGTA...CAGAGCCCTGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCACCGGCCAGAGGCCATGCTGCTGCTGCTCACGCTTGCCCTCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100178 TGCACCGGCCAGAGGCCATGCTGCTGCTGCTCACGCTTGCCCTCCTGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCCCCACCTGGGCAGGGA         AGATGTATGGCCCTGGAGGAGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100228 GGCCCCACCTGGGCAGGGAGTA...CAGAGATGTATGGCCCTGGAGGAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAGTATTTCAGCACCACTGAAGACTACGACCATGAAATCACAGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100469 CAAGTATTTCAGCACCACTGAAGACTACGACCATGAAATCACAGGGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGTGTCTGTAGGTCTTCTCCTGGTGAAAAG         TGTCCAGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100519 GGGTGTCTGTAGGTCTTCTCCTGGTGAAAAGGTG...CAGTGTCCAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAACTTGGAGACTCCTGGGACGTGAAACTGGGAGCCTTAGGTGGGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101559 AAACTTGGAGACTCCTGGGACGTGAAACTGGGAGCCTTAGGTGGGAATAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCAGGAAGTCACCCTGCAGCCAGGCGAATACATCACAAAAGTCTTTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101609 CCAGGAAGTCACCCTGCAGCCAGGCGAATACATCACAAAAGTCTTTGTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTTCCAAGCTTTCCTCCGGGGTATGGTCATGTACACCAGCAAGGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101659 CCTTCCAAGCTTTCCTCCGGGGTATGGTCATGTACACCAGCAAGGACCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATTTCTATTTTGGGAAGCTTGATGGCCAGATCTCCTCTGCCTACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101709 TATTTCTATTTTGGGAAGCTTGATGGCCAGATCTCCTCTGCCTACCCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCAAGAGGGGCAGGTGCTGGTGGGCATCTATGGCCAGTATCAACTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101759 CCAAGAGGGGCAGGTGCTGGTGGGCATCTATGGCCAGTATCAACTCCTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCATCAAGAGCATTGGCTTTGAATGGAATTATCCACTAGAGGAGCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101809 GCATCAAGAGCATTGGCTTTGAATGGAATTATCCACTAGAGGAGCCGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACTGAGCCACCAGTTAATCTCACATACTCAGCAAACTCACCCGTGGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101859 ACTGAGCCACCAGTTAATCTCACATACTCAGCAAACTCACCCGTGGGTCG

    650 
    624 C
        |
 101909 C