seq1 = pF1KE0461.tfa, 645 bp
seq2 = pF1KE0461/gi568815589r_121081399.tfa (gi568815589r:121081399_121293412), 212014 bp

>pF1KE0461 645
>gi568815589r:121081399_121293412 (Chr9)

(complement)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-106  (101189-101242)   100% ->
107-284  (102682-102859)   100% ->
285-351  (106394-106460)   100% ->
352-439  (110015-110102)   100% ->
440-470  (110453-110483)   100% ->
471-645  (111840-112014)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAACTGCACCATACAACTACTCTTACATCTTTAAATATATTATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAACTGCACCATACAACTACTCTTACATCTTTAAATATATTATTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TG         GGGACATGGGAGTAGGAAAATCTTGCTTGCTTCATCAAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGTA...CAGGGGACATGGGAGTAGGAAAATCTTGCTTGCTTCATCAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTACAGAAAAAAAAT         TTATGGCTGATTGTCCTCACACAATT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101228 TTACAGAAAAAAAATGTA...CAGTTATGGCTGATTGTCCTCACACAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GGTGTTGAATTTGGTACAAGAATAATCGAAGTTAGTGGCCAAAAAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102708 GGTGTTGAATTTGGTACAAGAATAATCGAAGTTAGTGGCCAAAAAATAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACTGCAGATTTGGGATACGGCAGGACAGGAGCGATTTAGGGCTGTTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102758 ACTGCAGATTTGGGATACGGCAGGACAGGAGCGATTTAGGGCTGTTACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAGCTACTACAGAGGAGCTGCGGGAGCTCTTATGGTCTATGATATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102808 GGAGCTACTACAGAGGAGCTGCGGGAGCTCTTATGGTCTATGATATCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AG         AAGAAGTACATATAACCACTTAAGCAGCTGGTTGACAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102858 AGGTA...CAGAAGAAGTACATATAACCACTTAAGCAGCTGGTTGACAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGCAAGGAATCTCACCAATCCAAATACT         GTAATAATTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 106433 TGCAAGGAATCTCACCAATCCAAATACTGTA...TAGGTAATAATTCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TAGGAAATAAAGCAGATTTGGAGGCACAGAGAGATGTTACATATGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110028 TAGGAAATAAAGCAGATTTGGAGGCACAGAGAGATGTTACATATGAAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCCAAACAGTTTGCTGAAGAAAATG         GCTTATTGTTCCTCGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 110078 GCCAAACAGTTTGCTGAAGAAAATGGTG...TAGGCTTATTGTTCCTCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AGCGAGTGCAAAAAC         GGGAGAGAATGTAGAAGATGCCTTCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 110469 AGCGAGTGCAAAAACGTA...TAGGGGAGAGAATGTAGAAGATGCCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTGAGGCTGCCAAGAAAATCTATCAGAACATTCAGGATGGAAGCTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111866 TTGAGGCTGCCAAGAAAATCTATCAGAACATTCAGGATGGAAGCTTGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CTGAATGCTGCTGAGTCTGGTGTACAACACAAACCTTCAGCCCCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111916 CTGAATGCTGCTGAGTCTGGTGTACAACACAAACCTTCAGCCCCGCAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    597 AGGCCGGCTAACCAGTGAACCCCAACCCCAGAGAGAAGGCTGTGGCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111966 AGGCCGGCTAACCAGTGAACCCCAACCCCAGAGAGAAGGCTGTGGCTGC