seq1 = pF1KE0454.tfa, 882 bp
seq2 = pF1KE0454/gi568815586r_110353037.tfa (gi568815586r:110353037_110568203), 215167 bp

>pF1KE0454 882
>gi568815586r:110353037_110568203 (Chr12)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-187  (102990-103098)   100% ->
188-355  (108342-108509)   100% ->
356-480  (110570-110694)   100% ->
481-596  (112274-112389)   100% ->
597-693  (112522-112618)   100% ->
694-822  (114333-114461)   100% ->
823-882  (115108-115167)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTCGGTATGCGCAGCTGGTCATGGGCCCCGCGGGCAGCGGGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTCGGTATGCGCAGCTGGTCATGGGCCCCGCGGGCAGCGGGAAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGATCTGCGGGGACAAGGAGAGAAAA         AGCACCTACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 GAGGATCTGCGGGGACAAGGAGAGAAAAGTA...CAGAGCACCTACTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCACCATGGTCCAGCACTGTGAAGCCCTCAACCGGTCTGTCCAAGTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103003 CCACCATGGTCCAGCACTGTGAAGCCCTCAACCGGTCTGTCCAAGTTGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACCTGGATCCAGCAGCAGAACACTTCAACTACTCCGTGATGGCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103053 AACCTGGATCCAGCAGCAGAACACTTCAACTACTCCGTGATGGCTGGTA.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188      ACATCCGGGAACTGATCGAGGTGGATGATGTAATGGAGGATGATT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103103 ..CAGACATCCGGGAACTGATCGAGGTGGATGATGTAATGGAGGATGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTCTGCGATTCGGTCCCAACGGAGGATTGGTATTTTGCATGGAGTACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108387 CTCTGCGATTCGGTCCCAACGGAGGATTGGTATTTTGCATGGAGTACTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCAATAATTTTGACTGGCTGGAGAACTGTCTTGGCCATGTAGAGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108437 GCCAATAATTTTGACTGGCTGGAGAACTGTCTTGGCCATGTAGAGGACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTATATCCTTTTTGATTGTCCAG         GTCAGATTGAGTTGTACA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108487 CTATATCCTTTTTGATTGTCCAGGTG...TAGGTCAGATTGAGTTGTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTCACCTGCCTGTGATGAAACAGCTGGTCCAGCAGCTCGAGCAGTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110588 CTCACCTGCCTGTGATGAAACAGCTGGTCCAGCAGCTCGAGCAGTGGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCCGAGTCTGTGGAGTTTTTCTTGTTGATTCTCAGTTCATGGTGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110638 TTCCGAGTCTGTGGAGTTTTTCTTGTTGATTCTCAGTTCATGGTGGAGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATTCAAG         TTTATTTCTGGCATCTTGGCAGCCCTGAGTGCCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110688 ATTCAAGGTC...CAGTTTATTTCTGGCATCTTGGCAGCCCTGAGTGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGATCTCTCTAGAAATTCCGCAAGTCAACATCATGACAAAAATGGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112308 TGATCTCTCTAGAAATTCCGCAAGTCAACATCATGACAAAAATGGATCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGAGTAAAAAAGCAAAAAAGGAAATTGAGAA         ATTTTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 112358 CTGAGTAAAAAAGCAAAAAAGGAAATTGAGAAGTG...AAGATTTTTAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCCAGACATGTATTCTTTATTAGAAGATTCTACAAGTGACTTAAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112531 TCCAGACATGTATTCTTTATTAGAAGATTCTACAAGTGACTTAAGAAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAAAATTCAAGAAACTGACTAAAGCTATATGTGGACTG         ATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 112581 AAAAATTCAAGAAACTGACTAAAGCTATATGTGGACTGGTA...TAGATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GATGACTACAGCATGGTTCGATTTTTACCTTACGATCAGTCAGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114336 GATGACTACAGCATGGTTCGATTTTTACCTTACGATCAGTCAGATGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AAGCATGAACATTGTATTGCAGCATATTGATTTTGCCATTCAATATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114386 AAGCATGAACATTGTATTGCAGCATATTGATTTTGCCATTCAATATGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAGACCTAGAATTTAAAGAACCAAAG         GAACGTGAAGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 114436 AAGACCTAGAATTTAAAGAACCAAAGGTA...CAGGAACGTGAAGATGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    838 TCTTCCTCTATGTTTGACGAATATTTTCAAGAATGCCAGGATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115123 TCTTCCTCTATGTTTGACGAATATTTTCAAGAATGCCAGGATGAA