seq1 = pF1KE0426.tfa, 1149 bp
seq2 = pF1KE0426/gi568815587f_86707644.tfa (gi568815587f:86707644_86908792), 201149 bp

>pF1KE0426 1149
>gi568815587f:86707644_86908792 (Chr11)

1-1149  (100001-101149)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGGATTCCAGGGCTCCTCTTCCTTCTCTTCTTTCTGCTCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGGATTCCAGGGCTCCTCTTCCTTCTCTTCTTTCTGCTCTGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTGGGCAAGTGAGCCCTTACAGTGCCCCCTGGAAACCCACTTGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTGGGCAAGTGAGCCCTTACAGTGCCCCCTGGAAACCCACTTGGCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATACCGCCTCCCTGTCGTCTTGCCCCAGTCTACCCTCAATTTAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATACCGCCTCCCTGTCGTCTTGCCCCAGTCTACCCTCAATTTAGCCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCAGACTTTGGAGCCGAAGCCAAATTAGAAGTATCTTCTTCATGTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCAGACTTTGGAGCCGAAGCCAAATTAGAAGTATCTTCTTCATGTGGACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGTGTCATAAGGGAACTCCACTGCCCACTTACGAAGAGGCCAAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGTGTCATAAGGGAACTCCACTGCCCACTTACGAAGAGGCCAAGCAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCTGTCTTATGAAACGCTCTATGCCAATGGCAGCCGCACAGAGACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCTGTCTTATGAAACGCTCTATGCCAATGGCAGCCGCACAGAGACGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGGGCATCTACATCCTCAGCAGTAGTGGAGATGGGGCCCAACACCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGGGCATCTACATCCTCAGCAGTAGTGGAGATGGGGCCCAACACCGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCAGGGTCTTCAGGAAAGTCTCGAAGGAAGCGGCAGATTTATGGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCAGGGTCTTCAGGAAAGTCTCGAAGGAAGCGGCAGATTTATGGCTATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACAGCAGGTTCAGCATTTTTGGGAAGGACTTCCTGCTCAACTACCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACAGCAGGTTCAGCATTTTTGGGAAGGACTTCCTGCTCAACTACCCTTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCAACATCAGTGAAGTTATCCACGGGCTGCACCGGCACCCTGGTGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCAACATCAGTGAAGTTATCCACGGGCTGCACCGGCACCCTGGTGGCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAGCATGTCCTCACAGCTGCCCACTGCATACACGATGGAAAAACCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAGCATGTCCTCACAGCTGCCCACTGCATACACGATGGAAAAACCTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAAAGGAACCCAGAAGCTTCGAGTGGGCTTCCTAAAGCCCAAGTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGAAAGGAACCCAGAAGCTTCGAGTGGGCTTCCTAAAGCCCAAGTTTAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATGGTGGTCGAGGGGCCAACGACTCCACTTCAGCCATGCCCGAGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATGGTGGTCGAGGGGCCAACGACTCCACTTCAGCCATGCCCGAGCAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAAATTTCAGTGGATCCGGGTGAAACGCACCCATGTGCCCAAGGGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAAATTTCAGTGGATCCGGGTGAAACGCACCCATGTGCCCAAGGGTTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAAGGGCAATGCCAATGACATCGGCATGGATTATGATTATGCCCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAAGGGCAATGCCAATGACATCGGCATGGATTATGATTATGCCCTCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAACTCAAAAAGCCCCACAAGAGAAAATTTATGAAGATTGGGGTGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAACTCAAAAAGCCCCACAAGAGAAAATTTATGAAGATTGGGGTGAGCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCCTGCTAAGCAGCTGCCAGGGGGCAGAATTCACTTCTCTGGTTATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCCTGCTAAGCAGCTGCCAGGGGGCAGAATTCACTTCTCTGGTTATGACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGACCGACCAGGCAATTTGGTGTATCGCTTCTGTGACGTCAAAGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGACCGACCAGGCAATTTGGTGTATCGCTTCTGTGACGTCAAAGACGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCTATGACTTGCTCTACCAGCAATGCGATGCCCAGCCAGGGGCCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCTATGACTTGCTCTACCAGCAATGCGATGCCCAGCCAGGGGCCAGCGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTCTGGGGTCTATGTGAGGATGTGGAAGAGACAGCAGCAGAAGTGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTCTGGGGTCTATGTGAGGATGTGGAAGAGACAGCAGCAGAAGTGGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GAAAAATTATTGGCATTTTTTCAGGGCACCAGTGGGTGGACATGAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GAAAAATTATTGGCATTTTTTCAGGGCACCAGTGGGTGGACATGAATGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TCCCCACAGGATTTCAACGTGGCTGTCAGAATCACTCCTCTCAAATATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TCCCCACAGGATTTCAACGTGGCTGTCAGAATCACTCCTCTCAAATATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1101 CCAGATTTGCTATTGGATTAAAGGAAACTACCTGGATTGTAGGGAGGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCAGATTTGCTATTGGATTAAAGGAAACTACCTGGATTGTAGGGAGGGG