seq1 = pF1KE0384.tfa, 1467 bp
seq2 = pF1KE0384/gi568815576r_38722612.tfa (gi568815576r:38722612_38943825), 221214 bp

>pF1KE0384 1467
>gi568815576r:38722612_38943825 (Chr22)

(complement)

1-591  (100001-100591)   100% ->
592-817  (115314-115539)   100% ->
818-1065  (117079-117326)   100% ->
1066-1245  (120564-120743)   100% ->
1246-1467  (120993-121214)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGCGTTCCTCGGTGCCGTCATCTGCATCATCGCCAGCGTGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGCGTTCCTCGGTGCCGTCATCTGCATCATCGCCAGCGTGCCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGCCAGCCCGGCGCGGGCGCTGCCCGGCGGCGCCGACAATGCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGCCAGCCCGGCGCGGGCGCTGCCCGGCGGCGCCGACAATGCTTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGCCTCGGGCGCCGCCGCGTCCCCGGGCCCGCAGCGGAGCCTGAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGCCTCGGGCGCCGCCGCGTCCCCGGGCCCGCAGCGGAGCCTGAGCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCACGGCGCGGGCGGTTCAGCCGGGCCCCCCGCGCTGCCCGGGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCACGGCGCGGGCGGTTCAGCCGGGCCCCCCGCGCTGCCCGGGGCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCGGCCAGCGCGCACCCGCTGCCGCCCGGGCCCCTGTTCAGCCGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCGGCCAGCGCGCACCCGCTGCCGCCCGGGCCCCTGTTCAGCCGCTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTGCACGCCGCTGGCTGCTGCCTGCCCGTCGGGGGCCCAGCAGGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTGCACGCCGCTGGCTGCTGCCTGCCCGTCGGGGGCCCAGCAGGGGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGCGGGCGCTGCGCCGGGCGAGCGCGAAGAGCTGCTGCTGCTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGGCGGGCGCTGCGCCGGGCGAGCGCGAAGAGCTGCTGCTGCTGCAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACGGCCGAGCAGCTGCGCCAGACGGCGCTGCAGCAGGAGGCGCGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACGGCCGAGCAGCTGCGCCAGACGGCGCTGCAGCAGGAGGCGCGCATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCGCCGACCAGGACACCATCCGTGAGCTCACCGGCAAGCTGGGCCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCGCCGACCAGGACACCATCCGTGAGCTCACCGGCAAGCTGGGCCGCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGAGCGGCCTGCCGCGCGGCCTCCAGGGCGCCGGGCCCCGCCGCGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGAGCGGCCTGCCGCGCGGCCTCCAGGGCGCCGGGCCCCGCCGCGACAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATGGCCGACGGGCCCTGGGACTCGCCTGCGCTCATTCTGGAGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATGGCCGACGGGCCCTGGGACTCGCCTGCGCTCATTCTGGAGCTGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACGCCGTGCGCGCCCTGCGGGACCGCATCGACCGCCTGGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100551 ACGCCGTGCGCGCCCTGCGGGACCGCATCGACCGCCTGGAGGTG...CAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGGAGCTTCCAGCCCGTGTGAACCTCTCAGCTGCCCCAGCCCCAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115314 CAGGAGCTTCCAGCCCGTGTGAACCTCTCAGCTGCCCCAGCCCCAGTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGCTGTGCCCACCGGCCTACACTCCAAGATGGACCAGCTGGAGGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115364 TGCTGTGCCCACCGGCCTACACTCCAAGATGGACCAGCTGGAGGGGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCTGGCCCAGGTGCTGGCACTGGAGAAGGAGCGTGTGGCCCTCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115414 TGCTGGCCCAGGTGCTGGCACTGGAGAAGGAGCGTGTGGCCCTCAGCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGCAGCCGCCGGCAGAGGCAGGAAGTGGAAAAGGAGTTGGACGTCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115464 AGCAGCCGCCGGCAGAGGCAGGAAGTGGAAAAGGAGTTGGACGTCCTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGGTCGTGTGGCTGAGCTGGAGCACG         GGTCCTCAGCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 115514 GGGTCGTGTGGCTGAGCTGGAGCACGGTG...CAGGGTCCTCAGCCTACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GTCCTCCAGATGCCTTCAAGATCAGCATCCCCATCCGTAACAACTACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117094 GTCCTCCAGATGCCTTCAAGATCAGCATCCCCATCCGTAACAACTACATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TACGCCCGCGTGCGGAAGGCTCTGCCCGAGCTCTACGCATTCACCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117144 TACGCCCGCGTGCGGAAGGCTCTGCCCGAGCTCTACGCATTCACCGCCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CATGTGGCTGCGGTCCAGGTCCAGCGGCACCGGCCAGGGCACCCCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117194 CATGTGGCTGCGGTCCAGGTCCAGCGGCACCGGCCAGGGCACCCCCTTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CCTACTCAGTGCCCGGGCAGGCCAACGAGATTGTACTGCTAGAGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117244 CCTACTCAGTGCCCGGGCAGGCCAACGAGATTGTACTGCTAGAGGCGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CATGAGCCCATGGAGCTGCTGATCAACGACAAG         GTGGCCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 117294 CATGAGCCCATGGAGCTGCTGATCAACGACAAGGTA...CAGGTGGCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GCTGCCCCTGAGCCTGAAGGACAATGGCTGGCACCACATCTGCATCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120572 GCTGCCCCTGAGCCTGAAGGACAATGGCTGGCACCACATCTGCATCGCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GGACCACAAGGGATGGCCTATGGTCTGCCTACCAGGACGGGGAGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120622 GGACCACAAGGGATGGCCTATGGTCTGCCTACCAGGACGGGGAGCTGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GGCTCCGGTGAGAACCTGGCTGCCTGGCACCCCATCAAGCCTCATGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120672 GGCTCCGGTGAGAACCTGGCTGCCTGGCACCCCATCAAGCCTCATGGGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CCTTATCTTGGGCCAGGAGCAG         GATACCCTGGGTGGCCGGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 120722 CCTTATCTTGGGCCAGGAGCAGGTA...CAGGATACCCTGGGTGGCCGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TTGATGCCACCCAGGCCTTTGTCGGTGACATTGCCCAGTTTAACCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121012 TTGATGCCACCCAGGCCTTTGTCGGTGACATTGCCCAGTTTAACCTGTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GACCACGCCCTGACACCAGCCCAGGTCCTGGGCATTGCCAACTGCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121062 GACCACGCCCTGACACCAGCCCAGGTCCTGGGCATTGCCAACTGCACTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GCCACTGCTGGGCAACGTCCTTCCCTGGGAAGACAAGTTGGTGGAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121112 GCCACTGCTGGGCAACGTCCTTCCCTGGGAAGACAAGTTGGTGGAGGCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 TTGGGGGTGCAACAAAGGCTGCCTTCGATGTCTGCAAGGGGAGGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121162 TTGGGGGTGCAACAAAGGCTGCCTTCGATGTCTGCAAGGGGAGGGCCAAG

   1500 
   1465 GCA
        |||
 121212 GCA