seq1 = pF1KE0353.tfa, 1629 bp
seq2 = pF1KE0353/gi568815592f_89794469.tfa (gi568815592f:89794469_89996097), 201629 bp

>pF1KE0353 1629
>gi568815592f:89794469_89996097 (Chr6)

1-1629  (100001-101629)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGACTGGAACTTATTGGGTGGCATCCTAGAGGAAGTTCACTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGACTGGAACTTATTGGGTGGCATCCTAGAGGAAGTTCACTCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAACCATAGTGGGGAAAATCTGGCTGACCATCCTCTTCATCTTCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAACCATAGTGGGGAAAATCTGGCTGACCATCCTCTTCATCTTCCGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGGTACTTCGTGTGGCTGCTGAGGATGTCTGGGATGATGAACAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTGGTACTTCGTGTGGCTGCTGAGGATGTCTGGGATGATGAACAGTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCATTTGCCTGCAACACCCGGCAGCCAGGTTGCAACAATATCTGTTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCATTTGCCTGCAACACCCGGCAGCCAGGTTGCAACAATATCTGTTATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGATGCATTCCCTATCTCTTTGATCAGGTTCTGGGTTTTACAGATCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGATGCATTCCCTATCTCTTTGATCAGGTTCTGGGTTTTACAGATCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGTGTCTTCTCCTTCTTTGGTCTATATGGGCCATGCACTTTATAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGTGTCTTCTCCTTCTTTGGTCTATATGGGCCATGCACTTTATAGGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGGGCCTTTGAGAAAGACAGGCAGAGGAAAAAGTCACACCTTAGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGGGCCTTTGAGAAAGACAGGCAGAGGAAAAAGTCACACCTTAGAGCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGAGAATCCAGATCTTGACTTGGAGGAGCAGCAAAGAATAGATAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGAGAATCCAGATCTTGACTTGGAGGAGCAGCAAAGAATAGATAGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AACTGAGGAGGTTAGAGGAGCAGAAGAGGATCCATAAAGTCCCTCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AACTGAGGAGGTTAGAGGAGCAGAAGAGGATCCATAAAGTCCCTCTGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGATGTCTGCTGCGTACTTATGTCTTACACATCTTGACCAGATCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGATGTCTGCTGCGTACTTATGTCTTACACATCTTGACCAGATCTGTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAAGTAGGATTCATGATAGGCCAATATATTCTCTATGGGTTTCAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAAGTAGGATTCATGATAGGCCAATATATTCTCTATGGGTTTCAAATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCCCCTTTACAAATGCACTCAACCTCCTTGCCCCAATGCGGTGGATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCCCCTTTACAAATGCACTCAACCTCCTTGCCCCAATGCGGTGGATTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTGTATCCAGGCCCACTGAGAAGACAATTTTCATGCTTTTTATGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTGTATCCAGGCCCACTGAGAAGACAATTTTCATGCTTTTTATGCACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATTGCAGCCATTTCCTTGTTACTCAATATACTGGAAATATTTCATCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATTGCAGCCATTTCCTTGTTACTCAATATACTGGAAATATTTCATCTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCATCAGAAAAATTATGAGGACACTTTATAAGAAATCCAGCAGTGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCATCAGAAAAATTATGAGGACACTTTATAAGAAATCCAGCAGTGAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATTGAGGATGAAACAGGCCCTCCATTCCATTTGAAGAAATATTCTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATTGAGGATGAAACAGGCCCTCCATTCCATTTGAAGAAATATTCTGTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCAGCAGTGTATGATTTGCTCTTCATTGCCTGAAAGAATCTCTCCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCAGCAGTGTATGATTTGCTCTTCATTGCCTGAAAGAATCTCTCCACTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAGCTAACAATCAACAGCAAGTCATTCGAGTTAATGTGCCAAAGTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAGCTAACAATCAACAGCAAGTCATTCGAGTTAATGTGCCAAAGTCTAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCATGTGGCAAATCCCACAGCCAAGGCAACTTGAAGTAGACCCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCATGTGGCAAATCCCACAGCCAAGGCAACTTGAAGTAGACCCTTCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGGGAAAAAGGACTGGTCTGAGAAGGATCAGCATAGCGGACAGCTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGGGAAAAAGGACTGGTCTGAGAAGGATCAGCATAGCGGACAGCTCCATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTCACAGCCCGTGTCCCTGGGCTGGCAGTGCTGGAAATCAGCACCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTCACAGCCCGTGTCCCTGGGCTGGCAGTGCTGGAAATCAGCACCTGGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGCAATCAGACCATTCCTCATTTGGCCTGCAGAATACAATGTCTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGCAATCAGACCATTCCTCATTTGGCCTGCAGAATACAATGTCTCAGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTGGCTAGGTACAACTACGGCTCCTAGAAACTGTCCATCCTTTGCAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTGGCTAGGTACAACTACGGCTCCTAGAAACTGTCCATCCTTTGCAGTAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GAACCTGGGAGCAGTCCCAGGACCCAGAACCCTCAGGTGAGCCTCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GAACCTGGGAGCAGTCCCAGGACCCAGAACCCTCAGGTGAGCCTCTCACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GATCTTCATAGTCACTGCAGAGACAGTGAAGGCAGCATGAGAGAGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GATCTTCATAGTCACTGCAGAGACAGTGAAGGCAGCATGAGAGAGAGTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGTCTGGATAGACAGATCTCGCCCAGGCAGTCGCAAGGCCAGCTTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGTCTGGATAGACAGATCTCGCCCAGGCAGTCGCAAGGCCAGCTTTCTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCAGATTGTTGTCTGAAAAGCGACATCTGCACAGTGACTCAGGAAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCAGATTGTTGTCTGAAAAGCGACATCTGCACAGTGACTCAGGAAGCTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGTTCTCGGAATAGCTCCTGCTTGGATTTTCCTCACTGGGAAAACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGTTCTCGGAATAGCTCCTGCTTGGATTTTCCTCACTGGGAAAACAGCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTCACCTCTGCCTTCAGTCACTGGGCACAGAACATCAATGGTAAGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CTCACCTCTGCCTTCAGTCACTGGGCACAGAACATCAATGGTAAGACAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CAGCCCTACCGATCATGGAACTATCACAAGAGCTGTTCCATTCTGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CAGCCCTACCGATCATGGAACTATCACAAGAGCTGTTCCATTCTGGATGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TTTCTTTTTCCTTTCTTTCTTCCTGGGGTGTGTATGTATGTTTGTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TTTCTTTTTCCTTTCTTTCTTCCTGGGGTGTGTATGTATGTTTGTGTTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CAGAGAGGCAGATGGAGGGGGAGATTATTTATGGAGAGATAAAATTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CAGAGAGGCAGATGGAGGGGGAGATTATTTATGGAGAGATAAAATTATTC

   1600     .    :    .    :    .
   1601 ATTCGATACATTCAGTTAAATTCAATTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ATTCGATACATTCAGTTAAATTCAATTCA