seq1 = pF1KE0345.tfa, 1707 bp
seq2 = pF1KE0345/gi568815576r_18416504.tfa (gi568815576r:18416504_18891222), 474719 bp

>pF1KE0345 1707
>gi568815576r:18416504_18891222 (Chr22)

(complement)

1-164  (100001-100164)   98% ->
165-295  (103344-103474)   96% ->
296-382  (103606-103692)   97% ->
383-575  (108892-109084)   98% ->
576-733  (109477-109634)   97% ->
734-883  (111684-111833)   98% ->
884-1020  (112357-112493)   99% ->
1021-1208  (115994-116181)   98% ->
1209-1336  (116414-116540)   96% ->
1337-1449  (116643-116755)   96% ->
1450-1563  (116837-116950)   98% ->
1564-1707  (117255-117398)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAAGAAGTTAGTGGTGCTGGGCCTGCTGGCCGTGGTCCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAAGAAGTTAGTGGTGCTGGGCCTGCTGGCCGTGGTCCTGGTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCATTGTCGGCCTCTGTCTCTGGCTGCCCTCAGCCTCCAAGGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100051 GGTCATTGTCGGCCTCTGTCTCTGGCTGCCCTCGGCCTCCAAGGAACCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAACCATGTGTACACCAGGGCTGCCGTGGCCGCGGATGCCAAGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAACCATGTGTACACCAGGGCTGCCGTGGCCGCGGATGCCAAGCAGTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGAAGATTGGGAG         GGATGCACTGCGGGACGGTGGCTCTGC
        | | ||||||||||>>>...>>>|||  ||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGAGATTGGGAGGTG...CAGGGACACACTGCGGGACGGTGGCTCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTGGATGCAGCCATTGCAGCCCTGTTGTGTGTGGGGCTCATGAATGCCC
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103371 AGTGGATGCAGCCATTGCAGCCCTGTTGTGTGTGGGGCTCATGAATGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACAGCATGGGCATCGGGGGTGGCCTCTTCCTCACCATCTACAACAGCACC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 103421 ACAGCATGGGCATCGGGGTTGGCCTCTTCCTCACCATCTACAACAGCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACAC         GAAAAGCTGAGGTCATCAACGCCCGCGAGGTGGCCCC
        || |>>>...>>>||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 103471 ACTCATG...TAGGAAAAGCTGAGGTCATCAATGCCCGCGAGGTGGCCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGGCTGGCCTTTGCCACCATGTTCAACAGCTCGGAGCAGTCCCAGAAGG
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 103643 CAGGCTGGCCTTTGCCAGCATGTTCAACAGCTCGGAGCAGTCCCAGAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383          GGGGGCTGTCGGTGGCGGTGCCTGGGGAGATCCGAGGCTAT
        >>>...>>>| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103693 GTA...CAGGAGGGCTGTCGGTGGCGGTGCCTGGGGAGATCCGAGGCTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGCTGGCACACCAGCGGCATGGGCGGCTGCCCTGGGCTCGCCTCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108933 GAGCTGGCACACCAGCGGCATGGGCGGCTGCCCTGGGCTCGCCTCTTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCCAGCATCCAGCTGGCCCGCCAGGGCTTTCCCGTGGGCAAGGGCTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 108983 GCCCAGCATCCAGCTGGCCCGCCAGGGCTTCCCCGTGGGCAAGGGCTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGGCAGCCCTGGAAAACAAGCGGACCGTCATCGAGCAGCAGCCTGTCTTG
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109033 CGGCAGTCCTGGAAAACAAGCGGACCGTCATCGAGCAGCAGCCTGTCTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TG         TGAGGTGTTCTGCCGGGATAGAAAGGTGCTTCGGGAGGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109083 TGGTA...CAGTGAGGTGTTCTGCCGGGATAGAAAGGTGCTTCGGGAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAGAGACTGACCCTGCCGCAGCTGGCTGACACCTACGAGACGCTGGCCA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
 109516 GGAGAGACTGACCCTGCCGCGGCTGGCTGACACCTACGAGATGCTGGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCGAGGGTGCCCAGGCCTTCTACAACGGCAGCCTCACGGCCCAGATTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 109566 TCGAGGGTGCCCAGGCCTTCTACAACGGCAGCCTCATGGCCCAGATTGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAGGACATCCAGGCGGCCG         GGGGCATTGTGACAGCTGAGGA
        ||||||||||||||||| |>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109616 AAGGACATCCAGGCGGCTGGTG...CAGGGGGCATTGTGACAGCTGAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTGAACAACTACCGTGCTGAGCTGATCGAGCACCCGCTGAACATCAGCC
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111706 CCTGAACAACTACTGTGCTGAGCTGATCGAGCACCCGCTGAACATCAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGGAGACGTGGTGCTGTACATGCCCAGTGCGCCGCTCAGCGGGCCCGTG
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 111756 TGGGAGACGCGGTGCTGTACATGCCCAGTGCGCGGCTCAGCGGGCCCGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGGCCCTCATCCTCAACATCCTCAAAG         GGTACAACTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 111806 CTGGCCCTCATCCTCAACATCCTCAAAGGTG...CAGGGTACAACTTCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCGGGAGAGCGTGGAGAGCCCCGAGCAGAAGGGCCTGACGTACCACCGCA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 112370 CCGGGAGAGCGTGGAGACCCCCGAGCAGAAGGGCCTGACGTACCACCGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCGTAGAGGCTTTCCGGTTTGCCTACGCCAAGAGGACCCTGCTTGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112420 TCGTAGAGGCTTTCCGGTTTGCCTACGCCAAGAGGACCCTGCTTGGGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCCAAGTTTGTGGATGTGACTGAG         GTGGTCCGCAACATGAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112470 CCCAAGTTTGTGGATGTGACTGAGGTA...CAGGTGGTCCGCAACATGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTCCGAGTTCTTCGCTGCCCAGCTCCGGGCCCAGATCTCTGACGACACCA
        ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
 116011 CTCTGAGTTCTTCGCTGCCCAGCTCCGGTCCCAGATCTCTGACCACACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTCACCCGATCTCCTACTACAAGCCCGAGTTCTACACGCCGGATGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116061 CTCACCCGATCTCCTACTACAAGCCCGAGTTCTACACGCCGGATGACGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGCACTGCTCACCTGTCTGTCGTCGCAGAGGACGGCAGTGCTGTGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116111 GGCACTGCTCACCTGTCTGTCGTCGCAGAGGACGGCAGTGCTGTGTCCGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CACCAGCACCATCAACCTCTA         CTTTGGCTCCAAGGTCCGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| |||
 116161 CACCAGCACCATCAACCTCTAGTA...TAGCTTTGGCTCCAAGGTCTGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CCCCGGTCAGCGGGATCCTGTTCAATAATGAAATGGACGACTTCAGCTCT
        |||||||||| |||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||
 116434 CCCCGGTCAGTGGGATCCTGTTCAATAATG AATGGACGACTTCAGCTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CCCAGCATCACCAACGAGTTTGGGGTACCCCCCTCACCTGCCAATTTCAT
        |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 116483 CCCAGCATCACCAATGAGTTTGGGGCACCCCCCTCACCTGCCAATTTCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CCAGCCAG         GGAAGCAGCCGCTCTCGTCCATGTGCCCGACGA
        ||||||||>>>...>>>||||||||||||||| |||||||||||||||||
 116533 CCAGCCAGGTA...CAGGGAAGCAGCCGCTCTTGTCCATGTGCCCGACGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TCATGGTGGGCCAGGACGGCCAGGTCCGGATGGTGGTGGGAGCTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116676 TCATGGTGGGCCAGGACGGCCAGGTCCGGATGGTGGTGGGAGCTGCTGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GGCACACAGATCACCACGGCCACTGCACTG         GCCATCATCTA
        ||||| ||||||||||| | ||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 116726 GGCACGCAGATCACCACAGACACTGCACTGGTA...CAGGCCATCATCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CAACCTCTGGTTCGGCTATGACGTGAAGCGGGCCGTGGAGGAGCCCCGGC
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 116848 CAACCTCTGGTTCGGCTATGACGTGAAGAGGGCCGTGGAGGAGCCCCGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TGCACAACCAGCTTCTGCCCAACGTCACGACAGTGGAGAGAAACATTGAC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116898 TGCACAACAAGCTTCTGCCCAACGTCACGACAGTGGAGAGAAACATTGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CAG         GCAGTGACTGCAGCCCTGGAGACCCGGCACCATCACAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116948 CAGGTG...CAGGCAGTGACTGCAGCCCTGGAGACCCGGCACCATCACAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CCAGATCGCGTCCACCTTCATCGCTGTGGTGCAAGCCATCGTCCGCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117293 CCAGATCGCGTCCACCTTCATCGCTGTGGTGCAAGCCATCGTCCGCACGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CTGGTGGCTGGGCAGCTGCCTCGGACTCCAGGAAAGGCGGGGAGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 
 117343 CTGGTGGCTGGGCAGCTGCCTCGGACTCCAGGAAAGGCGGGGAACCTGCT

   1800     .
   1702 GGCTAC
        ||||||
 117393 GGCTAC