seq1 = pF1KE0281.tfa, 702 bp
seq2 = pF1KE0281/gi568815578r_860360.tfa (gi568815578r:860360_1102164), 241805 bp

>pF1KE0281 702
>gi568815578r:860360_1102164 (Chr20)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-268  (134027-134215)   100% ->
269-409  (134851-134991)   100% ->
410-595  (138045-138230)   100% ->
596-702  (141699-141805)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGGCGCCACTCTGCCTGCTCCTGCTCGTCGCCCACGCCGTGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGGCGCCACTCTGCCTGCTCCTGCTCGTCGCCCACGCCGTGGACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCGCCCTGAACCGAAGGAAGAAGCAAG         TGGGCACTGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 GCTCGCCCTGAACCGAAGGAAGAAGCAAGGTA...CAGTGGGCACTGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGGGGGCAACTGCACAGGCTGTATCATCTGCTCAGAGGAGAACGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134039 TGGGGGGCAACTGCACAGGCTGTATCATCTGCTCAGAGGAGAACGGCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCACCTGCCAGCAGAGGCTCTTCCTGTTCATCCGCCGGGAAGGCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134089 TCCACCTGCCAGCAGAGGCTCTTCCTGTTCATCCGCCGGGAAGGCATCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGTACGGCAAGTGCCTGCACGACTGTCCCCCTGGGTACTTCGGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134139 CCAGTACGGCAAGTGCCTGCACGACTGTCCCCCTGGGTACTTCGGCATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCGGCCAGGAGGTCAACAGGTGCAAAA         AATGTGGGGCCACT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 134189 GCGGCCAGGAGGTCAACAGGTGCAAAAGTA...CAGAATGTGGGGCCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTGAGAGCTGCTTCAGCCAGGACTTCTGCATCCGGTGCAAGAGGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134865 TGTGAGAGCTGCTTCAGCCAGGACTTCTGCATCCGGTGCAAGAGGCAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTACTTGTACAAGGGGAAGTGTCTGCCCACCTGCCCGCCGGGCACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134915 TTACTTGTACAAGGGGAAGTGTCTGCCCACCTGCCCGCCGGGCACTTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCACCAGAACACACGGGAGTGCCAGG         GGGAGTGTGAACTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 134965 CCCACCAGAACACACGGGAGTGCCAGGGTG...CAGGGGAGTGTGAACTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGTCCCTGGGGCGGCTGGAGCCCCTGCACACACAATGGAAAGACCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138059 GGTCCCTGGGGCGGCTGGAGCCCCTGCACACACAATGGAAAGACCTGCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCGGCTTGGGGCCTGGAGAGCCGGGTACGAGAGGCTGGCCGGGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138109 CTCGGCTTGGGGCCTGGAGAGCCGGGTACGAGAGGCTGGCCGGGCTGGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGAGGAGGCAGCCACCTGCCAGGTGCTTTCTGAGTCAAGGAAATGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138159 ATGAGGAGGCAGCCACCTGCCAGGTGCTTTCTGAGTCAAGGAAATGTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATCCAGAGGCCCTGCCCAGGAG         AGAGGAGCCCCGGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 138209 ATCCAGAGGCCCTGCCCAGGAGGTG...CAGAGAGGAGCCCCGGCCAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAAGGGCAGGAAGGACCGGCGCCCACGCAAGGACAGGAAGCTGGACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141718 GAAGGGCAGGAAGGACCGGCGCCCACGCAAGGACAGGAAGCTGGACCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .
    665 GGCTGGACGTGAGGCCGCGCCAGCCCGGCCTGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141768 GGCTGGACGTGAGGCCGCGCCAGCCCGGCCTGCAGCCC