seq1 = pF1KE0249.tfa, 252 bp
seq2 = pF1KE0249/gi568815592f_24257640.tfa (gi568815592f:24257640_24457891), 200252 bp

>pF1KE0249 252
>gi568815592f:24257640_24457891 (Chr6)

1-252  (100001-100252)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGACGACGCGGCGCCCCGCGTAGAAGGGGTCCCCGTTGCGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGACGACGCGGCGCCCCGCGTAGAAGGGGTCCCCGTTGCGGTACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGCACGCTCTTCACGACGGGCTGAGACAGGTGGCTGGACCTGGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGCACGCTCTTCACGACGGGCTGAGACAGGTGGCTGGACCTGGCGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCCGCTCATCTTCCCCGCTGGCCGCCGCCTCAGCTCGCTGCTTCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGCCGCTCATCTTCCCCGCTGGCCGCCGCCTCAGCTCGCTGCTTCGCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGGAGGCACCTCCGCTGTCCCAGCGGCCTCACCGCACCCAGGGCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGGAGGCACCTCCGCTGTCCCAGCGGCCTCACCGCACCCAGGGCGCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATCGCCTCCTGAAACGAACGAGAAACTGACGAATCCACAGGTGAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATCGCCTCCTGAAACGAACGAGAAACTGACGAATCCACAGGTGAAAGAGA

    250 
    251 AG
        ||
 100251 AG