seq1 = pF1KE0244.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KE0244/gi568815591r_75324055.tfa (gi568815591r:75324055_75611113), 287059 bp

>pF1KE0244 402
>gi568815591r:75324055_75611113 (Chr7)

(complement)

1-35  (257511-257545)   100% ->
36-219  (259093-259278)   98% ->
220-308  (262329-262417)   98% ->
309-402  (267006-267099)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAA         TGATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 257511 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAAGTA...CAGTGATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-
 259099 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     91 TTT GATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCA
        |||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259149 TTTTGATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    140 GAGGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259199 GAGGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190 CATAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAG         AAACGTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 259249 CATAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAGGTA...CAGAAACGTGCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    231 CTTCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGTTCCTTGAGGGCTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 262340 CTTCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGTTTCTTGAGGGCTCCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281 CCATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACT         GACTCCTAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 262390 CCATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACTGTG...AAGGACTCCTAGAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322 ACCCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267019 ACCCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAG

    400     .    :    .    :    .    :
    372 CTCTGTCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 267069 CTCTGTCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA