seq1 = pF1KE0244.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KE0244/gi568815591r_75296127.tfa (gi568815591r:75296127_75344014), 47888 bp

>pF1KE0244 402
>gi568815591r:75296127_75344014 (Chr7)

(complement)

1-35  (18338-18372)   100% ->
36-219  (19961-20146)   98% ->
220-308  (23197-23285)   98% ->
309-402  (27874-27967)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAA         TGATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  18338 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAAGTA...CAGTGATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-
  19967 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     91 TTT GATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCA
        |||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20017 TTTTGATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    140 GAGGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20067 GAGGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190 CATAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAG         AAACGTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  20117 CATAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAGGTA...CAGAAACGTGCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    231 CTTCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGTTCCTTGAGGGCTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  23208 CTTCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGTTTCTTGAGGGCTCCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281 CCATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACT         GACTCCTAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  23258 CCATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACTGTG...AAGGACTCCTAGAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322 ACCCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  27887 ACCCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAG

    400     .    :    .    :    .    :
    372 CTCTGTCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
  27937 CTCTGTCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA