seq1 = pF1KE0244.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KE0244/gi568815591f_76424518.tfa (gi568815591f:76424518_77123687), 699170 bp

>pF1KE0244 402
>gi568815591f:76424518_77123687 (Chr7)

1-35  (589447-589481)   100% ->
36-219  (591155-591338)   100% ->
220-308  (594392-594480)   97% ->
309-402  (599077-599170)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAA         TGATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 589447 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAAGTA...CAGTGATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 591161 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 591211 TTGATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 591261 GGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAG         AAACGTGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 591311 TAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAGGTA...CAGAAACGTGCCTGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAG TTCCTTGAGGGCTCCCCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||-|||-||||||||||||||||
 594405 TCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGCTTC TTGAGGGCTCCCCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282 CATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACT         GACTCCTAGAAGTA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 594454 CATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACTGTG...AAGGACTCCTAGAAGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323 CCCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 599091 CCCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAGC

    400     .    :    .    :    .    :
    373 TCTGTCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA
        ||  ||||||||||||||||||||||||||
 599141 TCCATCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA