seq1 = pF1KE0244.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KE0244/gi568815591f_74797652.tfa (gi568815591f:74797652_75005671), 208020 bp

>pF1KE0244 402
>gi568815591f:74797652_75005671 (Chr7)

1-35  (98547-98581)   94% ->
36-219  (100001-100184)   100% ->
220-308  (103236-103324)   98% ->
309-402  (107927-108020)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAA         TGATGT
        ||||||||||||||||||||||||  |||||||||>>>...>>>||||||
  98547 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTTAAAGGCTTAAGTA...CAGTGATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100007 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100057 TTGATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100107 GGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAG         AAACGTGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100157 TAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAGGTA...CAGAAACGTGCCTGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGTTCCTTGAGGGCTCCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 103249 TCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGTTTCTTGAGGGCTCCCCAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACT         GACTCCTAGAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 103299 ATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACTGTG...AAGGACTCCTAGAAGTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107942 CCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAGCT

    400     .    :    .    :    .
    374 CTGTCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 107992 CTGTCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA