seq1 = pF1KE0238.tfa, 486 bp
seq2 = pF1KE0238/gi568815587r_63452967.tfa (gi568815587r:63452967_63660194), 207228 bp

>pF1KE0238 486
>gi568815587r:63452967_63660194 (Chr11)

(complement)

4-118  (99998-100110)   97% ->
119-387  (101535-101803)   100% ->
388-486  (107130-107228)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      4 GCTTTGGCCAGACCAAGACCGAGACTTGGAGACCTGATTGAGATTTCTCG
        || --|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 GCA  GGCCAGACCAAGACCGAGACTTGGAGACCTGATTGAGATTTCTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     54 CTTTGGCTATGCACACTGGGCCATCTACGTGGGAGATGGCTATGTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100046 CTTTGGCTATGCACACTGGGCCATCTACGTGGGAGATGGCTATGTGGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    104 ATCTGGCTCCGGCAA         GTGAAATTGCTGGAGCTGGTGCGGCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100096 ATCTGGCTCCGGCAAGTA...CAGGTGAAATTGCTGGAGCTGGTGCGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145 AGTGTCCTGTCTGCCCTGACCAACAAAGCCATAGTGAAGAAGGAACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101561 AGTGTCCTGTCTGCCCTGACCAACAAAGCCATAGTGAAGAAGGAACTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195 GTCTGTGGTGGCTGGGGGAGACAACTACAGGGTCAATAACAAGCACGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101611 GTCTGTGGTGGCTGGGGGAGACAACTACAGGGTCAATAACAAGCACGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 ACAGATACACACCACTGCCTTCCAACAAAATCGTCAAGCGGGCAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101661 ACAGATACACACCACTGCCTTCCAACAAAATCGTCAAGCGGGCAGAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 TTGGTGGGGCAGGAGTTGCCTTATTCGCTGACCAGTGACAACTGCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101711 TTGGTGGGGCAGGAGTTGCCTTATTCGCTGACCAGTGACAACTGCGAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345 CTTCGTGAACCATCTGCGCTATGGCGTCTCCCGCAGTGACCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101761 CTTCGTGAACCATCTGCGCTATGGCGTCTCCCGCAGTGACCAGGTG...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    388   GTCACTGGTGCAGTCACGACAGTAGGTGTGGCAGCAGGCCTGCTGGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107128 AGGTCACTGGTGCAGTCACGACAGTAGGTGTGGCAGCAGGCCTGCTGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    436 GCCGCAAGCCTTGTGGGGATCCTGCTGGCCAGAAGCAAGCGGGAAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107178 GCCGCAAGCCTTGTGGGGATCCTGCTGGCCAGAAGCAAGCGGGAAAGGCA

    500 
    486 A
        |
 107228 A