seq1 = pF1KE0218.tfa, 534 bp
seq2 = pF1KE0218/gi568815591f_116426523.tfa (gi568815591f:116426523_116659284), 232762 bp

>pF1KE0218 534
>gi568815591f:116426523_116659284 (Chr7)

1-30  (98541-98570)   100% ->
31-195  (100003-100167)   100% ->
196-534  (132424-132762)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGGGGGCAAATACGTAGACTCGGAG         GGACATCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  98541 ATGTCTGGGGGCAAATACGTAGACTCGGAGGTA...CAGGGACATCTCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CACCGTTCCCATCCGGGAACAGGGCAACATCTACAAGCCCAACAACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100014 CACCGTTCCCATCCGGGAACAGGGCAACATCTACAAGCCCAACAACAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATGGCAGACGAGCTGAGCGAGAAGCAAGTGTACGACGCGCACACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100064 CCATGGCAGACGAGCTGAGCGAGAAGCAAGTGTACGACGCGCACACCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGATCGACCTGGTCAACCGCGACCCTAAACACCTCAACGATGACGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100114 GAGATCGACCTGGTCAACCGCGACCCTAAACACCTCAACGATGACGTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAG         ATTGACTTTGAAGATGTGATTGCAGAACCAGAAGGGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100164 CAAGGTA...TAGATTGACTTTGAAGATGTGATTGCAGAACCAGAAGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CACACAGTTTTGACGGCATTTGGAAGGCCAGCTTCACCACCTTCACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132461 CACACAGTTTTGACGGCATTTGGAAGGCCAGCTTCACCACCTTCACTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACGAAATACTGGTTTTACCGCTTGCTGTCTGCCCTCTTTGGCATCCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132511 ACGAAATACTGGTTTTACCGCTTGCTGTCTGCCCTCTTTGGCATCCCGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCACTCATCTGGGGCATTTACTTCGCCATTCTCTCTTTCCTGCACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132561 GGCACTCATCTGGGGCATTTACTTCGCCATTCTCTCTTTCCTGCACATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGCAGTTGTACCATGCATTAAGAGCTTCCTGATTGAGATTCAGTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132611 GGGCAGTTGTACCATGCATTAAGAGCTTCCTGATTGAGATTCAGTGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCCGTGTCTATTCCATCTACGTCCACACCGTCTGTGACCCACTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132661 AGCCGTGTCTATTCCATCTACGTCCACACCGTCTGTGACCCACTCTTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCTGTTGGGAAAATATTCAGCAATGTCCGCATCAACTTGCAGAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132711 AGCTGTTGGGAAAATATTCAGCAATGTCCGCATCAACTTGCAGAAAGAAA

    550 
    533 TA
        ||
 132761 TA