seq1 = pF1KE0214.tfa, 1383 bp
seq2 = pF1KE0214/gi568815585r_28601500.tfa (gi568815585r:28601500_28817998), 216499 bp

>pF1KE0214 1383
>gi568815585r:28601500_28817998 (Chr13)

(complement)

1-189  (100001-100189)   100% ->
190-1060  (104449-105319)   100% ->
1061-1144  (107156-107239)   100% ->
1145-1301  (113900-114056)   100% ->
1302-1383  (116418-116499)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGATTTTATTTGTAGAACCTGCCATTTTCCTTAGTGCATTTGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGATTTTATTTGTAGAACCTGCCATTTTCCTTAGTGCATTTGCTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACTTTGACCGGTCCACTGACAACGCAATATGTTTATCGGAGAATATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACTTTGACCGGTCCACTGACAACGCAATATGTTTATCGGAGAATATGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGAAACTGGCAACTACACTTTTTCATCTGATAGCAATATTTCTGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGAAACTGGCAACTACACTTTTTCATCTGATAGCAATATTTCTGAGTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAAAAAACAAAAGCAGCCCAATTTTTGCATTCCAGGAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100151 GAAAAAAACAAAAGCAGCCCAATTTTTGCATTCCAGGAGGTA...CAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTTCAGAAAAAAGTGTCACGTTTTAATCTGCAGATGGACATAAGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104451 AGTTCAGAAAAAAGTGTCACGTTTTAATCTGCAGATGGACATAAGTGGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAATTCCTGGTCTAGTGTCTACATTCATACTTTTGTCTATTAGTGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104501 TAATTCCTGGTCTAGTGTCTACATTCATACTTTTGTCTATTAGTGATCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACGGACGAAAATTCCCTATGATTTTGTCTTCCGTTGGTGCTCTTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104551 TACGGACGAAAATTCCCTATGATTTTGTCTTCCGTTGGTGCTCTTGCAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGCGTTTGGCTCTGTTTGCTTTGCTATTTTGCCTTTCCATTCCAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104601 CAGCGTTTGGCTCTGTTTGCTTTGCTATTTTGCCTTTCCATTCCAGCTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGATTGCATCTACCTTCATTGGTGCATTTTGTGGCAATTATACCACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104651 TGATTGCATCTACCTTCATTGGTGCATTTTGTGGCAATTATACCACATTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGGGGAGCTTGCTTTGCCTATATAGTTGATCAGTGTAAAGAACACAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104701 TGGGGAGCTTGCTTTGCCTATATAGTTGATCAGTGTAAAGAACACAAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AAAAACAATTCGAATAGCTATCATTGACTTTCTACTTGGACTTGTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104751 AAAAACAATTCGAATAGCTATCATTGACTTTCTACTTGGACTTGTTACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GACTAACAGGACTGTCATCTGGCTATTTTATTAGAGAGCTAGGTTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104801 GACTAACAGGACTGTCATCTGGCTATTTTATTAGAGAGCTAGGTTTTGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TGGTCGTTTCTAATTATTGCTGTGTCTCTTGCTGTTAATTTGATCTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104851 TGGTCGTTTCTAATTATTGCTGTGTCTCTTGCTGTTAATTTGATCTATAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TTTATTTTTTCTCGGAGATCCAGTGAAAGAGTGTTCATCTCAGAATGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104901 TTTATTTTTTCTCGGAGATCCAGTGAAAGAGTGTTCATCTCAGAATGTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTATGTCATGTAGTGAAGGCTTCAAAAACCTATTTTACCGAACTTACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104951 CTATGTCATGTAGTGAAGGCTTCAAAAACCTATTTTACCGAACTTACATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTTTTTAAGAATGCTTCTGGTAAGAGACGATTTTTGCTCTGTTTGTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105001 CTTTTTAAGAATGCTTCTGGTAAGAGACGATTTTTGCTCTGTTTGTTACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTTTACAGTAATCACTTATTTTTTTGTGGTAATTGGCATTGCCCCAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105051 TTTTACAGTAATCACTTATTTTTTTGTGGTAATTGGCATTGCCCCAATTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TTATCCTTTATGAATTGGATTCACCACTCTGCTGGAATGAAGTTTTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105101 TTATCCTTTATGAATTGGATTCACCACTCTGCTGGAATGAAGTTTTTATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGTTATGGATCAGCTTTGGGTAGTGCCTCTTTTTTGACTAGTTTCCTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105151 GGTTATGGATCAGCTTTGGGTAGTGCCTCTTTTTTGACTAGTTTCCTAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AATATGGCTTTTTTCTTATTGTATGGAAGATATTCATATGGCCTTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105201 AATATGGCTTTTTTCTTATTGTATGGAAGATATTCATATGGCCTTCATTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GGATTTTTACCACGATGACAGGAATGGCTATGACCGCGTTTGCCAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105251 GGATTTTTACCACGATGACAGGAATGGCTATGACCGCGTTTGCCAGTACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 ACACTGATGATGTTTTTAG         CCAGGGTGCCGTTCCTTTTCAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105301 ACACTGATGATGTTTTTAGGTG...CAGCCAGGGTGCCGTTCCTTTTCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TATTGTGCCATTCTCTGTTCTACGGTCCATGTTGTCAAAAGTGGTTCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107178 TATTGTGCCATTCTCTGTTCTACGGTCCATGTTGTCAAAAGTGGTTCGTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CGACTGAACAAG         GTACCCTGTTTGCTTGTATTGCTTTCTTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 107228 CGACTGAACAAGGTG...CAGGTACCCTGTTTGCTTGTATTGCTTTCTTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAAACACTTGGAGGAGTCACTGCAGTTTCTACTTTTAATGGAATTTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113929 GAAACACTTGGAGGAGTCACTGCAGTTTCTACTTTTAATGGAATTTACTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 AGCCACTGTTGCTTGGTACCCTGGCTTCACTTTCCTGCTGTCTGCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113979 AGCCACTGTTGCTTGGTACCCTGGCTTCACTTTCCTGCTGTCTGCTGGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TGTTACTACTTCCAGCCATCAGTCTATG         TGTTGTCAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 114029 TGTTACTACTTCCAGCCATCAGTCTATGGTA...TAGTGTTGTCAAGTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 ACCAGCTGGAATGAGGGAAGCTATGAACTTCTTATACAAGAAGAATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116431 ACCAGCTGGAATGAGGGAAGCTATGAACTTCTTATACAAGAAGAATCCAG

   1400     .    :    .
   1365 TGAAGATGCTTCAGACAGG
        |||||||||||||||||||
 116481 TGAAGATGCTTCAGACAGG