seq1 = pF1KE0209.tfa, 909 bp
seq2 = pF1KE0209/gi568815578r_58895652.tfa (gi568815578r:58895652_59107128), 211477 bp

>pF1KE0209 909
>gi568815578r:58895652_59107128 (Chr20)

(complement)

1-143  (100001-100143)   100% ->
144-307  (100644-100807)   100% ->
308-487  (105485-105664)   100% ->
488-638  (109376-109526)   99% ->
639-801  (110328-110490)   100% ->
802-909  (111370-111477)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAGGCGCGGGCCAGGGTGGCGGCCGCTTCTGCTGCTCGTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAGGCGCGGGCCAGGGTGGCGGCCGCTTCTGCTGCTCGTGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGGCGCGGCGCAGGGCGGCCTCTACTTCCGCCGGGGACAGACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGGCGCGGCGCAGGGCGGCCTCTACTTCCGCCGGGGACAGACCTGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCGGCCTCTGCGGGGGGACGGGCTGGCTCCGCTGGGGCGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100101 ACCGGCCTCTGCGGGGGGACGGGCTGGCTCCGCTGGGGCGCAGGTG...C

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    144   CACATACCCCCGGCCTCATGAGTACCTGTCCCCAGCGGATCTGCCCAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100642 AGCACATACCCCCGGCCTCATGAGTACCTGTCCCCAGCGGATCTGCCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGCTGGGACTGGCGCAATGTGGATGGTGTCAACTATGCCAGCATCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100692 GAGCTGGGACTGGCGCAATGTGGATGGTGTCAACTATGCCAGCATCACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGAACCAGCACATCCCCCAATACTGCGGCTCCTGCTGGGCCCACGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100742 GGAACCAGCACATCCCCCAATACTGCGGCTCCTGCTGGGCCCACGCCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCAGCGCTATGGCGG         ATCGGATCAACATCAAGAGGAAGGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100792 ACCAGCGCTATGGCGGGTG...CAGATCGGATCAACATCAAGAGGAAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCGTGGCCCTCCACCCTCCTGTCCGTGCAGAACGTCATCGACTGCGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105510 AGCGTGGCCCTCCACCCTCCTGTCCGTGCAGAACGTCATCGACTGCGGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACGCTGGCTCCTGTGAAGGGGGTAATGACCTGTCCGTGTGGGACTACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105560 ACGCTGGCTCCTGTGAAGGGGGTAATGACCTGTCCGTGTGGGACTACGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACCAGCACGGCATCCCTGACGAGACCTGCAACAACTACCAGGCCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105610 CACCAGCACGGCATCCCTGACGAGACCTGCAACAACTACCAGGCCAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCAGG         AGTGTGACAAGTTTAACCAATGTGGGACATGCAATG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105660 CCAGGGTA...CAGAGTGTGACAAGTTTAACCAATGTGGGACATGCAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AATTCAAAGAGTGCCACGCCATCCGGAACTACACCCTCTGGAGGGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109412 AATTCAAAGAGTGCCACGCCATCCGGAACTACACCCTCTGGAGGGTGGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACTACGGCTCCCTCTCTGGGAGGGAGAAGATGATGGCAGAAATCTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 109462 GACTACGGCTCCCTCTCTGGGAGGGAGAAGATGATGGCAGAAATCTATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAATGGTCCCATCAG         CTGTGGAATAATGGCAACAGAAAGAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109512 AAATGGTCCCATCAGGTG...CAGCTGTGGAATAATGGCAACAGAAAGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGCTAACTACACCGGAGGCATCTATGCCGAATACCAGGACACCACATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110354 TGGCTAACTACACCGGAGGCATCTATGCCGAATACCAGGACACCACATAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATAAACCATGTCGTTTCTGTGGCTGGGTGGGGCATCAGTGATGGGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110404 ATAAACCATGTCGTTTCTGTGGCTGGGTGGGGCATCAGTGATGGGACTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GTACTGGATTGTCCGGAATTCATGGGGTGAACCATGG         GGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 110454 GTACTGGATTGTCCGGAATTCATGGGGTGAACCATGGGTA...CAGGGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGAGAGGCTGGCTGAGGATCGTGACCAGCACCTATAAGGATGGGAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111374 AGAGAGGCTGGCTGAGGATCGTGACCAGCACCTATAAGGATGGGAAGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCCAGATACAACCTTGCCATCGAGGAGCACTGTACATTTGGGGACCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111424 GCCAGATACAACCTTGCCATCGAGGAGCACTGTACATTTGGGGACCCCAT

    950 
    906 CGTT
        ||||
 111474 CGTT