seq1 = pF1KE0203.tfa, 903 bp
seq2 = pF1KE0203/gi568815583r_66236961.tfa (gi568815583r:66236961_66452947), 215987 bp

>pF1KE0203 903
>gi568815583r:66236961_66452947 (Chr15)

(complement)

1-133  (100001-100133)   100% ->
134-212  (100741-100819)   98% ->
213-288  (101348-101423)   100% ->
289-411  (103511-103633)   100% ->
412-475  (103825-103888)   100% ->
476-682  (111592-111798)   100% ->
683-903  (115767-115987)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTAGAACCACAGGAGAATGGCGTGATTGACCTACCAGATTATGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTAGAACCACAGGAGAATGGCGTGATTGACCTACCAGATTATGAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTAGAAGATGAAACTTTTCCTCCTTTCCCACCTCCAGCCTCTCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTAGAAGATGAAACTTTTCCTCCTTTCCCACCTCCAGCCTCTCCAGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACAAGATGGTGAAGGAACTGAGCCTGATGAAG         AGTCAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100101 GACAAGATGGTGAAGGAACTGAGCCTGATGAAGGTA...CAGAGTCAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATGGAGCACCTGTTCCTGTACCTCCAAAGAGAACAGTTAAAAGAAATAT
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100749 AATGGAGCACCTGTTCGTGTACCTCCAAAGAGAACAGTTAAAAGAAATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCCAAGCTGGATGCTCAGAG         ATTAATTTCAGAGAGAGGAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100799 ACCCAAGCTGGATGCTCAGAGGTA...CAGATTAATTTCAGAGAGAGGAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCCAGCCTTAAGGCATGTATTTGATAAGGCAAAATTCAAAGGTAAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101368 TTCCAGCCTTAAGGCATGTATTTGATAAGGCAAAATTCAAAGGTAAAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CATGAG         GCTGAAGACTTGAAGATGCTAATCAGACACATGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101418 CATGAGGTA...CAGGCTGAAGACTTGAAGATGCTAATCAGACACATGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCACTGGGCACATAGGCTATTCCCTAAACTGCAGTTTGAGGATTTTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103546 GCACTGGGCACATAGGCTATTCCCTAAACTGCAGTTTGAGGATTTTATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAGAGTTGAATACCTGGGAAGTAAAAAGGAAGTTCAG         ACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103596 ACAGAGTTGAATACCTGGGAAGTAAAAAGGAAGTTCAGGTA...CAGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGTTTAAAACGAATTCGACTTGATCTCCCTATTTTACATGAAGATTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103828 TGTTTAAAACGAATTCGACTTGATCTCCCTATTTTACATGAAGATTTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TAGCAATAATG         ATGAAGTTGCGGAGAATAATGAACATGATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103878 TAGCAATAATGGTA...CAGATGAAGTTGCGGAGAATAATGAACATGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCACTTCTACTGAATTAGATCCCTTTCTGACAAACTTATCTGAAAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111622 TCACTTCTACTGAATTAGATCCCTTTCTGACAAACTTATCTGAAAGTGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGTTTGCTTCTGAGTTAAGTAGAAGCCTAACAGAAGAGCAACAACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111672 ATGTTTGCTTCTGAGTTAAGTAGAAGCCTAACAGAAGAGCAACAACAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AATTGAGAGAAATAAACAACTGGCCTTGGAAAGAAGGCAGGCAAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111722 AATTGAGAGAAATAAACAACTGGCCTTGGAAAGAAGGCAGGCAAAGCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGAGTAATAGTCAGACCCTAGGAAATG         ATATGTTAATGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 111772 TGAGTAATAGTCAGACCCTAGGAAATGGTA...CAGATATGTTAATGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACACCCAGGGCACACACGGTTGAAGAGGTTAATACTGATGAGGATCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115781 ACACCCAGGGCACACACGGTTGAAGAGGTTAATACTGATGAGGATCAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGAGGAGTCAAATGGATTAAACGAAGACATTCTGGACAATCCATGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115831 GGAGGAGTCAAATGGATTAAACGAAGACATTCTGGACAATCCATGTAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATGCTATTGCCAATACTTTAAATGAAGAGGAAACACTGCTGGACCAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115881 ATGCTATTGCCAATACTTTAAATGAAGAGGAAACACTGCTGGACCAGTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTTAAAAATGTGCAACAGCAACTTGATGCTACATCCAGAAATATTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115931 TTTAAAAATGTGCAACAGCAACTTGATGCTACATCCAGAAATATTACTGA

    950     .
    897 AGCTAGA
        |||||||
 115981 AGCTAGA