seq1 = pF1KE0168.tfa, 399 bp
seq2 = pF1KE0168/gi568815575r_43849802.tfa (gi568815575r:43849802_44058645), 208844 bp

>pF1KE0168 399
>gi568815575r:43849802_44058645 (ChrX)

(complement)

1-174  (100001-100174)   100% ->
175-399  (108620-108844)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAAAACATGTACTAGCTGCATCCTTTTCTATGCTCTCCCTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGAAAACATGTACTAGCTGCATCCTTTTCTATGCTCTCCCTGCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATAATGGGAGATACAGACAGTAAAACGGACAGCTCATTCATAATGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATAATGGGAGATACAGACAGTAAAACGGACAGCTCATTCATAATGGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACCCTCGACGCTGCATGAGGCACCACTATGTGGATTCTATCAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACCCTCGACGCTGCATGAGGCACCACTATGTGGATTCTATCAGTCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCATTGTACAAGTGTAGCTCAAAG         ATGGTGCTCCTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100151 CCATTGTACAAGTGTAGCTCAAAGGTA...CAGATGGTGCTCCTGGCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTGCGAGGGGCACTGCAGCCAGGCGTCACGCTCCGAGCCTTTGGTGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108637 GTGCGAGGGGCACTGCAGCCAGGCGTCACGCTCCGAGCCTTTGGTGTCGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAGCACTGTCCTCAAGCAACCCTTCCGTTCCTCCTGTCACTGCTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108687 TCAGCACTGTCCTCAAGCAACCCTTCCGTTCCTCCTGTCACTGCTGCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCCAGACTTCCAAGCTGAAGGCACTGCGGCTGCGATGCTCAGGGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108737 CCCCAGACTTCCAAGCTGAAGGCACTGCGGCTGCGATGCTCAGGGGGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCGACTCACTGCCACCTACCGGTACATCCTCTCCTGTCACTGCGAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108787 GCGACTCACTGCCACCTACCGGTACATCCTCTCCTGTCACTGCGAGGAAT

    400     .
    392 GCAATTCC
        ||||||||
 108837 GCAATTCC