seq1 = pF1KE0163.tfa, 339 bp
seq2 = pF1KE0163/gi568815591f_139241385.tfa (gi568815591f:139241385_139445701), 204317 bp

>pF1KE0163 339
>gi568815591f:139241385_139445701 (Chr7)

1-138  (100001-100138)   99% ->
139-339  (104117-104317)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCTTAGGGTCCCCGGCGCACACTTTTCGAGGACTTCTGCGGGA
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCTTAGGGTCCCCGTCGCACACTTTTCGAGGACTTCTGCGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGCGCTACCTGAGCGCGGCCACCGGCCGACCCTATCGCGACACCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTGCGCTACCTGAGCGCGGCCACCGGCCGACCCTATCGCGACACCGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTATCGGTACCTTGTGAAGGCTTTCCGTGCACATCGG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100101 CCTATCGGTACCTTGTGAAGGCTTTCCGTGCACATCGGGTA...TAGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCAGTGAAAAGTTGTGCAGAGCCCAACATGAGCTTCATTTCCAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104120 ACCAGTGAAAAGTTGTGCAGAGCCCAACATGAGCTTCATTTCCAAGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACCTATCTCTGCCTCCTGCGTAGCATCCGGAAACATGTGGCCCTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104170 CACCTATCTCTGCCTCCTGCGTAGCATCCGGAAACATGTGGCCCTACATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAATTTCATGGCAAGGGTGAGCGCTCGGTGGAGGAGTCTGCTGGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104220 AGGAATTTCATGGCAAGGGTGAGCGCTCGGTGGAGGAGTCTGCTGGCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    292 GTGGGTCTCAAGTTGCCCCATCAGCCTGGAGGGAAGGGCTGGGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104270 GTGGGTCTCAAGTTGCCCCATCAGCCTGGAGGGAAGGGCTGGGAGCCA