seq1 = pF1KE0154.tfa, 894 bp
seq2 = pF1KE0154/gi568815593f_157631441.tfa (gi568815593f:157631441_157839479), 208039 bp

>pF1KE0154 894
>gi568815593f:157631441_157839479 (Chr5)

1-191  (100001-100191)   100% ->
192-368  (101428-101604)   100% ->
369-538  (103136-103305)   100% ->
539-627  (104406-104494)   100% ->
628-735  (106447-106554)   100% ->
736-894  (107881-108039)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGGCGCCTGTAAAGTTAAGGTTCACGATTCCTTGGCCACCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGGCGCCTGTAAAGTTAAGGTTCACGATTCCTTGGCCACCATTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCACTCTGAGACGGTACCTGAGATTGGGGGCGACCATGGCAAAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCACTCTGAGACGGTACCTGAGATTGGGGGCGACCATGGCAAAAAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTTCGAGTACGTGAGGGACTTCGAGGCTGACGACACCTGCCTGGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTTCGAGTACGTGAGGGACTTCGAGGCTGACGACACCTGCCTGGCACAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCTGGGTGGTAGTGCGGCTGGACGGCCGGAATTTCCATCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100151 TGCTGGGTGGTAGTGCGGCTGGACGGCCGGAATTTCCATCGGTG...AAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTTGCTGAGAAGCACAACTTTGCAAAACCCAATGACAGCCGTGCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101428 GTTTGCTGAGAAGCACAACTTTGCAAAACCCAATGACAGCCGTGCTCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCTGATGACCAAATGTGCGCAGACTGTGATGGAAGAACTAGAGGATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101478 AGCTGATGACCAAATGTGCGCAGACTGTGATGGAAGAACTAGAGGATATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGATCGCGTATGGACAGAGTGATGAGTACAGCTTTGTGTTCAAGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101528 GTGATCGCGTATGGACAGAGTGATGAGTACAGCTTTGTGTTCAAGCGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AACCAATTGGTTTAAAAGAAGAGCCAG         TAAGTTCATGACTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101578 AACCAATTGGTTTAAAAGAAGAGCCAGGTA...AAGTAAGTTCATGACTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACGTGGCCTCCCAGTTTGCCTCCAGCTATGTGTTTTATTGGCGGGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103150 ACGTGGCCTCCCAGTTTGCCTCCAGCTATGTGTTTTATTGGCGGGATTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTGAGGACCAGCCCCTTCTGTATCCCCCAGGCTTTGACGGAAGAGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103200 TTTGAGGACCAGCCCCTTCTGTATCCCCCAGGCTTTGACGGAAGAGTCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGTGTATCCCAGCAACCAGACTTTAAAGGACTACCTCAGCTGGCGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103250 GGTGTATCCCAGCAACCAGACTTTAAAGGACTACCTCAGCTGGCGACAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CAGATT         GTCACATCAATAATCTTTATAATACAGTTTTCTGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103300 CAGATTGTG...CAGGTCACATCAATAATCTTTATAATACAGTTTTCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCACTTATACAACAATCTGGACTAACACCAGTACAAGCCCAAGGGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104441 GCACTTATACAACAATCTGGACTAACACCAGTACAAGCCCAAGGGAGATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ACAG         GGAACTCTTGCAGCAGACAAGAATGAGATTTTGTTTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104491 ACAGGTA...CAGGGAACTCTTGCAGCAGACAAGAATGAGATTTTGTTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTGAATTCAACATCAACTATAATAATGAGCTGCCGATGTATAGGAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106484 CTGAATTCAACATCAACTATAATAATGAGCTGCCGATGTATAGGAAAGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACTGTGTTGATATGGCAGAAG         GTGGATGAAGTGATGACAAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106534 ACTGTGTTGATATGGCAGAAGGTA...TAGGTGGATGAAGTGATGACAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGAAATTAAGCTGCCAACAGAAATGGAAGGAAAAAAGATGGCAGTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107901 AGAAATTAAGCTGCCAACAGAAATGGAAGGAAAAAAGATGGCAGTGACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGACCAGGACAAAGCCAGTGCCCTTGCACTGCGATATCATCGGGGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107951 GGACCAGGACAAAGCCAGTGCCCTTGCACTGCGATATCATCGGGGATGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .
    856 TTCTGGAAGGAACATCCAGAGATTCTAGATGAAGACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108001 TTCTGGAAGGAACATCCAGAGATTCTAGATGAAGACAGC