seq1 = pF1KE0134.tfa, 642 bp
seq2 = pF1KE0134/gi568815593f_168516352.tfa (gi568815593f:168516352_168716993), 200642 bp

>pF1KE0134 642
>gi568815593f:168516352_168716993 (Chr5)

1-642  (100001-100642)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGCCGCCCCGCCCGTTGTTACCGGTATTGTAAGAACAAGCCGTA
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCGCCGCCCCGCCTGTTGTTACCGGTATTGTAAGAACAAGCCGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCAAAGTCTCGCTTCTGCCGAGGTGTCCCTGATGCCAAGATTCGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCAAAGTCTCGCTTCTGCCGAGGTGTCCCTGATGCCAAGATTCGCATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGACCTGGGGCGGAAAAAGGCAAAAGTGGATGAGTTTCCGCTTTGTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100101 TTGACCTGGGGCGGAAAAAGGCAAAAGTGGATGAGTTTCCACTTTGTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACATGGTGTCAGATGAATATGAGCAGCTGTCCTCTGAAGCCCTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACATGGTGTCAGATGAATATGAGCAGCTGTCCTCTGAAGCCCTGGAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCCCGAATTTGTGCCAATAAGTACATGGTAAAAAGTTGTGGCAAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCCCGAATTTGTGCCAATAAGTACATGGTAAAAAGTTGTGGCAAAGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCCATATCCGGGTGCGGCTCCACCCCTTCCACGTCATCCGCATCAAC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTCCATATCCGGGTGCGGCTCCACTCCTTCCACGTCATCCGCATCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGATGTTGTCCTGTGCTGGGGCTGACAGGCTCCAAACAGGCATGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGATGTTGTCCTGTGCTGGGGCTGACAGGCTCCAAACAGGCATGCGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCCTTTGGAAAGCCCCAGGGCACTGTGGCCAGGGTTCACATTGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
 100351 TGCCTTTGGAAAGCCCCAGGGCACTTTGGCCAGGGTTCACACTGGCCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTATCATGTCCATCCGCACCAAGCTGCAGAACAAGGAGCATGTGATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTATCATGTCCATCCGCACCAAGCTGCAGAACAAGGAGCATGTGATTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCCTGCGCAGGGCCAAGTTCAAGTTTCCTGGCCGCCAGAAGATCCACAT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCCTGGGCAGGGCCAAGTTCAAGTTTCCTGGCCGCCAGAAGATCCACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCAAAGAAGTGGGGCTTCACCAAGTTCAATGCTGATGAATTTGAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCAAAGAAGTGGGGCTTCACCAAGTTCAATGCTGATGAATTTGAAGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGTGGCTGAAAAGCGGCTCATCCCAGATGGCTGTGGGGTCAAGTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGTGGCTGAAAAGCGGCTCATCCCAGATGGCTGTGGGGTCAAGTACATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCAGTCGTGGCCCTCTGGACAAGTGGCGGGCCCTGCACTCA
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCAATCGTGGCCCTCTGGACAAGTGGCGGGCCCTGCACTCA