seq1 = pF1KE0111.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KE0111/gi568815582r_67563164.tfa (gi568815582r:67563164_67766442), 203279 bp

>pF1KE0111 1038
>gi568815582r:67563164_67766442 (Chr16)

(complement)

1-85  (100001-100085)   100% ->
86-280  (100178-100372)   100% ->
281-453  (101275-101447)   100% ->
454-579  (102381-102506)   100% ->
580-743  (102623-102786)   100% ->
744-880  (102887-103023)   100% ->
881-1038  (103122-103279)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCGAGGGCCCGTCCCGCATCTCGGGGCCCATCCCCCCAGACCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGCGAGGGCCCGTCCCGCATCTCGGGGCCCATCCCCCCAGACCCGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTGTCCTGACAACTACAGGCGGCCGACCTCGG         CTCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 GCTCTGTCCTGACAACTACAGGCGGCCGACCTCGGGTG...CAGCTCAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGCGCCTCGAGGGAAACGCGCTGAAGCTGGACTTGCTGACTTCCGACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100184 GGCGCCTCGAGGGAAACGCGCTGAAGCTGGACTTGCTGACTTCCGACCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCCTGGACACCACCGCTCCCCGTGGCCCCTGCATCGGTCCCGGTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100234 GCCCTGGACACCACCGCTCCCCGTGGCCCCTGCATCGGTCCCGGTGCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAGATCCTGGAGCGCGGCCAGCGCGGCGTCGGGGACGTGCTGTTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100284 AGAGATCCTGGAGCGCGGCCAGCGCGGCGTCGGGGACGTGCTGTTGCAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCGAGGGGATCTCCCTAGGTCCTGGGGCCTCTCTCAAGA         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100334 TCGAGGGGATCTCCCTAGGTCCTGGGGCCTCTCTCAAGAGTA...CAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGGACCCTAAGGACCATGAGAAGGAGAACCTGAGGCGGATCAGGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101277 AAGGACCCTAAGGACCATGAGAAGGAGAACCTGAGGCGGATCAGGGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCAGAAGCGCTTCAGAGAACAGGAGCGCAGCCGGGAGCAGGGCCAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101327 TCAGAAGCGCTTCAGAGAACAGGAGCGCAGCCGGGAGCAGGGCCAGCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCCCCTGAAAGCTCTGTGGCGCTCACCCAAGTACGACAAGGTGGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101377 GGCCCCTGAAAGCTCTGTGGCGCTCACCCAAGTACGACAAGGTGGAGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGGGTCAAGGCCCAGCTCCAG         GAGCCTGGCCCTGCCTCTGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101427 CGGGTCAAGGCCCAGCTCCAGGTA...CAGGAGCCTGGCCCTGCCTCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GACAGAGTCTGCCCACTTCCTGCGGGCGCACTCCCGCTGCGGCCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 GACAGAGTCTGCCCACTTCCTGCGGGCGCACTCCCGCTGCGGCCCTGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCCACCACCCCATGTATCTAGTCCCCAGCCAACCCCACCAGGTCCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 TCCCACCACCCCATGTATCTAGTCCCCAGCCAACCCCACCAGGTCCCGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCTAAG         GAGCCAGGCCTGGGGGTGGACTTCATTCGTCACAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102501 GCTAAGGTG...CAGGAGCCAGGCCTGGGGGTGGACTTCATTCGTCACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCACGAGCTGCCAAGAGAGCCCCCCGGAGGCATTCCTGCTCACTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102658 TGCACGAGCTGCCAAGAGAGCCCCCCGGAGGCATTCCTGCTCACTGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCTGGCACAAGTGCTAGAGCAGCAGCGGCAGGCCCAGGAGCACTACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102708 TCCTGGCACAAGTGCTAGAGCAGCAGCGGCAGGCCCAGGAGCACTACAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCACGCAGAAGGGCCATGTGCCACATTA         CTTGTTGGAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102758 GCCACGCAGAAGGGCCATGTGCCACATTAGTA...CAGCTTGTTGGAGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAGGGACCTGTGGCGGCGGGAGGCCGAGGCCCGCAAGCAGAGCCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102899 CAGGGACCTGTGGCGGCGGGAGGCCGAGGCCCGCAAGCAGAGCCAGCCGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACCCTGCCATGCCCCCAGGCCACACGCGCATGCCTGAGAACCAGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102949 ACCCTGCCATGCCCCCAGGCCACACGCGCATGCCTGAGAACCAGCGGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAAACACTGACCAAGCTGCTCCAGA         GCCAGAGCCAGCTGCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102999 GAAACACTGACCAAGCTGCTCCAGAGTG...TAGGCCAGAGCCAGCTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCGTGAGCTGGTACTGCTGCCTGCTGGGGCAGACTCACTGAGAGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103138 GCGTGAGCTGGTACTGCTGCCTGCTGGGGCAGACTCACTGAGAGCCCAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCCACCGTGCTGAGCTGGACCGGAAGCTGGTGCAGGTAGAGGAGGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103188 GCCACCGTGCTGAGCTGGACCGGAAGCTGGTGCAGGTAGAGGAGGCCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AAGATCTTTTCTCGGCCCAAAGTCTTCGTGAAGATGGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103238 AAGATCTTTTCTCGGCCCAAAGTCTTCGTGAAGATGGACGAC