seq1 = pF1KE0089.tfa, 2124 bp
seq2 = pF1KE0089/gi568815588f_124842494.tfa (gi568815588f:124842494_125084989), 242496 bp

>pF1KE0089 2124
>gi568815588f:124842494_125084989 (Chr10)

1-814  (100001-100814)   100% ->
815-1002  (124101-124288)   100% ->
1003-1156  (129472-129625)   100% ->
1157-1228  (131152-131223)   100% ->
1229-1427  (131707-131905)   100% ->
1428-1548  (139216-139336)   100% ->
1549-1678  (140682-140811)   100% ->
1679-1908  (140966-141195)   100% ->
1909-2124  (142281-142496)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGAACGTGGAATTAAGTGGGCTTGTGAATATTGTACGTATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGAACGTGGAATTAAGTGGGCTTGTGAATATTGTACGTATGAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGCCATCTGCAATCAAGTGTACTATGTGTCGTGCCCAAAGACCTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGCCATCTGCAATCAAGTGTACTATGTGTCGTGCCCAAAGACCTAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAACAATTATTACAGAAGATCCATTTAAAAGTGGTTCAAGTGATGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAACAATTATTACAGAAGATCCATTTAAAAGTGGTTCAAGTGATGTTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGAGATTGGGATCCTTCCAGCACCGAAGGAGGAAGTAGTCCTTTGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGAGATTGGGATCCTTCCAGCACCGAAGGAGGAAGTAGTCCTTTGATATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCCAGACTCTAGTGCAAGACCAAGGGTGAAATCTTCGTATAGCATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCCAGACTCTAGTGCAAGACCAAGGGTGAAATCTTCGTATAGCATGGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGCAAATAAGTGGTCATGCCACATGTGTACATATTTGAACTGGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGCAAATAAGTGGTCATGCCACATGTGTACATATTTGAACTGGCCAAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAATCAGATGTACCCAGTGCTTATCCCAACGTAGGACCAGGAGTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCAATCAGATGTACCCAGTGCTTATCCCAACGTAGGACCAGGAGTCCTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAATCTCCTCAGTCCTCAGGATCTGGCTCAAGACCAGTTGCTTTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAATCTCCTCAGTCCTCAGGATCTGGCTCAAGACCAGTTGCTTTTTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGATCCTTGTGAGGAATACAATGATAGAAATAAACTGAACACTAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGATCCTTGTGAGGAATACAATGATAGAAATAAACTGAACACTAGGACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGCACTGGACTTGCTCTGTTTGCACATATGAAAACTGGGCCAAGGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGCACTGGACTTGCTCTGTTTGCACATATGAAAACTGGGCCAAGGCTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAGATGTGTTGTTTGTGATCATCCCAGACCTAATAACATTGAAGCAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAGATGTGTTGTTTGTGATCATCCCAGACCTAATAACATTGAAGCAATAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AATTGGCAGAGACTGAAGAGGCTTCTTCAATAATAAATGAGCAAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AATTGGCAGAGACTGAAGAGGCTTCTTCAATAATAAATGAGCAAGACAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTCGATGGAGGGGAAGTTGCAGTAGTGGTAATAGCCAAAGGAGATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTCGATGGAGGGGAAGTTGCAGTAGTGGTAATAGCCAAAGGAGATCACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCCTGCTACGAAGCGGGACTCTGAAGTGAAAATGGATTTTCAGAGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCCTGCTACGAAGCGGGACTCTGAAGTGAAAATGGATTTTCAGAGGATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AATTGGCTGGTGCTGTGGGAAGCAAGGAGGAACTTGAAGTAGACTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AATTGGCTGGTGCTGTGGGAAGCAAGGAGGAACTTGAAGTAGACTTTAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAACTAAAGCAAATTAAAAACAGGATGAAAAAGACTGATTGGCTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAACTAAAGCAAATTAAAAACAGGATGAAAAAGACTGATTGGCTCTTCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAATGCTTGTGTGG         GGGTTGTAGAAGGTGATTTAGCTGCCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAATGCTTGTGTGGGTA...TAGGGGTTGTAGAAGGTGATTTAGCTGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TAGAAGCATACAAGTCATCAGGAGGAGACATTGCACGTCAGCTCACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124128 TAGAAGCATACAAGTCATCAGGAGGAGACATTGCACGTCAGCTCACCGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GATGAAGTACGCTTGCTGAATCGTCCTTCTGCCTTTGATGTTGGCTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124178 GATGAAGTACGCTTGCTGAATCGTCCTTCTGCCTTTGATGTTGGCTATAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TCTTGTACACTTGGCTATACGTTTTCAGAGGCAGGATATGCTAGCAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124228 TCTTGTACACTTGGCTATACGTTTTCAGAGGCAGGATATGCTAGCAATAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TGCTTACAGAG         GTGTCTCAACAAGCAGCAAAGTGTATTCCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 124278 TGCTTACAGAGGTA...AAGGTGTCTCAACAAGCAGCAAAGTGTATTCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GCAATGGTGTGTCCTGAACTGACAGAACAAATCCGGAGAGAGATAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129502 GCAATGGTGTGTCCTGAACTGACAGAACAAATCCGGAGAGAGATAGCTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTCTCTTCATCAGAGAAAGGGGGATTTTGCTTGCTATTTTCTGACTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129552 CTCTCTTCATCAGAGAAAGGGGGATTTTGCTTGCTATTTTCTGACTGACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TTGTAACATTTACATTGCCAGCAG         ATATTGAAGATTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 129602 TTGTAACATTTACATTGCCAGCAGGTA...TAGATATTGAAGATTTGCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CCAACAGTCCAAGAAAAATTATTTGATGAGGTGCTTGATAGAGACGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131169 CCAACAGTCCAAGAAAAATTATTTGATGAGGTGCTTGATAGAGACGTTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 AAAAG         AATTAGAAGAAGAATCTCCAATTATTAACTGGTCCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131219 AAAAGGTA...CAGAATTAGAAGAAGAATCTCCAATTATTAACTGGTCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TGGAATTGGCTACACGTTTGGACAGTCGACTGTATGCACTTTGGAACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131743 TGGAATTGGCTACACGTTTGGACAGTCGACTGTATGCACTTTGGAACCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 ACTGCAGGAGACTGCCTACTTGATTCAGTTCTACAAGCTACCTGGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131793 ACTGCAGGAGACTGCCTACTTGATTCAGTTCTACAAGCTACCTGGGGCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CTATGACAAGGACTCAGTGCTTCGGAAAGCCCTGCATGACAGCCTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131843 CTATGACAAGGACTCAGTGCTTCGGAAAGCCCTGCATGACAGCCTGCATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 ACTGTTCACATTG         GTTTTACACACGCTGGAAAGATTGGGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 131893 ACTGTTCACATTGGTG...TAGGTTTTACACACGCTGGAAAGATTGGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TCATGGTATTCTCAGAGCTTTGGTTTACATTTTTCCTTGAGAGAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139244 TCATGGTATTCTCAGAGCTTTGGTTTACATTTTTCCTTGAGAGAAGAACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 GTGGCAAGAAGACTGGGCATTTATACTCTCTCTTGCTAGTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 139294 GTGGCAAGAAGACTGGGCATTTATACTCTCTCTTGCTAGTCAGGTG...C

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1549   CCTGGAGCAAGCTTGGAGCAGACGCACATTTTTGTACTGGCACATATT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140680 AGCCTGGAGCAAGCTTGGAGCAGACGCACATTTTTGTACTGGCACATATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CTTAGACGACCAATTATAGTTTATGGAGTAAAATATTACAAGAGTTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140730 CTTAGACGACCAATTATAGTTTATGGAGTAAAATATTACAAGAGTTTCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GGGAGAAACTTTAGGATATACTCGGTTTCAAG         GTGTTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 140780 GGGAGAAACTTTAGGATATACTCGGTTTCAAGGTA...CAGGTGTTTATC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 TGCCTTTGTTGTGGGAACAGAGTTTTTGTTGGAAAAGTCCGATTGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140975 TGCCTTTGTTGTGGGAACAGAGTTTTTGTTGGAAAAGTCCGATTGCTCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GGTTATACGAGGGGCCACTTCTCTGCTTTGGTTGCCATGGAAAATGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141025 GGTTATACGAGGGGCCACTTCTCTGCTTTGGTTGCCATGGAAAATGATGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 CTATGGCAACCGAGGTGCTGGTGCTAATCTCAATACCGATGATGATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141075 CTATGGCAACCGAGGTGCTGGTGCTAATCTCAATACCGATGATGATGTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 CCATCACATTTTTGCCTCTGGTTGACAGTGAAAGGAAGCTACTCCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141125 CCATCACATTTTTGCCTCTGGTTGACAGTGAAAGGAAGCTACTCCATGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 CACTTCCTTTCTGCTCAGGAG         CTAGGTAATGAGGAACAGCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 141175 CACTTCCTTTCTGCTCAGGAGGTA...AAGCTAGGTAATGAGGAACAGCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 AGAAAAACTGCTCAGGGAGTGGCTGGACTGCTGTGTGACGGAGGGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142301 AGAAAAACTGCTCAGGGAGTGGCTGGACTGCTGTGTGACGGAGGGGGGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 TTCTGGTTGCCATGCAGAAGAGTTCTCGGCGGCGAAATCACCCCCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142351 TTCTGGTTGCCATGCAGAAGAGTTCTCGGCGGCGAAATCACCCCCTGGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 ACTCAGATGGTAGAAAAATGGCTTGACCGCTACCGACAGATCCGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142401 ACTCAGATGGTAGAAAAATGGCTTGACCGCTACCGACAGATCCGGCCGTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2079 TACATCCCTGTCTGATGGAGAGGAAGATGAGGATGATGAAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142451 TACATCCCTGTCTGATGGAGAGGAAGATGAGGATGATGAAGATGAA