seq1 = pF1KE0071.tfa, 2169 bp
seq2 = pF1KE0071/gi568815592r_170182986.tfa (gi568815592r:170182986_170390139), 207154 bp

>pF1KE0071 2169
>gi568815592r:170182986_170390139 (Chr6)

(complement)

1-54  (100001-100054)   100% ->
55-351  (100332-100628)   100% ->
352-412  (101351-101411)   100% ->
413-670  (101644-101901)   100% ->
671-731  (103842-103902)   100% ->
732-862  (104441-104571)   100% ->
863-1032  (104717-104886)   100% ->
1033-1249  (105005-105221)   100% ->
1250-2048  (106111-106909)   100% ->
2049-2169  (107035-107154)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAGTCGGTGCGCGCTGGCCCTGGCGGTGCTCTCGGCCTTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAGTCGGTGCGCGCTGGCCCTGGCGGTGCTCTCGGCCTTGCTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCAG         GTCTGGAGCTCTGGGGTGTTCGAACTGAAGCTGCAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCAGGTA...CAGGTCTGGAGCTCTGGGGTGTTCGAACTGAAGCTGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTTCGTCAACAAGAAGGGGCTGCTGGGGAACCGCAACTGCTGCCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100369 AGTTCGTCAACAAGAAGGGGCTGCTGGGGAACCGCAACTGCTGCCGCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCGCGGGGCCACCGCCGTGCGCCTGCCGGACCTTCTTCCGCGTGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100419 GGCGCGGGGCCACCGCCGTGCGCCTGCCGGACCTTCTTCCGCGTGTGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGCACTACCAGGCCAGCGTGTCCCCCGAGCCGCCCTGCACCTACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100469 CAAGCACTACCAGGCCAGCGTGTCCCCCGAGCCGCCCTGCACCTACGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCGCCGTCACCCCCGTGCTGGGCGTCGACTCCTTCAGTCTGCCCGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100519 GCGCCGTCACCCCCGTGCTGGGCGTCGACTCCTTCAGTCTGCCCGACGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGGGCGCCGACTCCGCGTTCAGCAACCCCATCCGCTTCCCCTTCGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100569 GGGGGCGCCGACTCCGCGTTCAGCAACCCCATCCGCTTCCCCTTCGGCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CACCTGGCCG         GGCACCTTCTCTCTGATTATTGAAGCTCTCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100619 CACCTGGCCGGTG...CAGGGCACCTTCTCTCTGATTATTGAAGCTCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACACAGATTCTCCTGATGACCTCGCAACAG         AAAACCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101382 ACACAGATTCTCCTGATGACCTCGCAACAGGTA...TAGAAAACCCAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGACTCATCAGCCGCCTGGCCACCCAGAGGCACCTGACGGTGGGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101655 AGACTCATCAGCCGCCTGGCCACCCAGAGGCACCTGACGGTGGGCGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTGGTCCCAGGACCTGCACAGCAGCGGCCGCACGGACCTCAAGTACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101705 GTGGTCCCAGGACCTGCACAGCAGCGGCCGCACGGACCTCAAGTACTCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACCGCTTCGTGTGTGACGAACACTACTACGGAGAGGGCTGCTCCGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101755 ACCGCTTCGTGTGTGACGAACACTACTACGGAGAGGGCTGCTCCGTTTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGCCGTCCCCGGGACGATGCCTTCGGCCACTTCACCTGTGGGGAGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101805 TGCCGTCCCCGGGACGATGCCTTCGGCCACTTCACCTGTGGGGAGCGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGAGAAAGTGTGCAACCCTGGCTGGAAAGGGCCCTACTGCACAGAGC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101855 GGAGAAAGTGTGCAACCCTGGCTGGAAAGGGCCCTACTGCACAGAGCGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    671       CGATCTGCCTGCCTGGATGTGATGAGCAGCATGGATTTTGTGAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101905 ...TAGCGATCTGCCTGCCTGGATGTGATGAGCAGCATGGATTTTGTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAACCAGGGGAATGCAA         GTGCAGAGTGGGCTGGCAGGGCCG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103886 AAACCAGGGGAATGCAAGTA...AAGGTGCAGAGTGGGCTGGCAGGGCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTACTGTGACGAGTGTATCCGCTATCCAGGCTGTCTCCATGGCACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104465 GTACTGTGACGAGTGTATCCGCTATCCAGGCTGTCTCCATGGCACCTGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGCAGCCCTGGCAGTGCAACTGCCAGGAAGGCTGGGGGGGCCTTTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104515 AGCAGCCCTGGCAGTGCAACTGCCAGGAAGGCTGGGGGGGCCTTTTCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AACCAGG         ACCTGAACTACTGCACACACCATAAGCCCTGCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104565 AACCAGGGTA...CAGACCTGAACTACTGCACACACCATAAGCCCTGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GAATGGAGCCACCTGCACCAACACGGGCCAGGGGAGCTACACTTGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104751 GAATGGAGCCACCTGCACCAACACGGGCCAGGGGAGCTACACTTGCTCTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCCGGCCTGGGTACACAGGTGCCACCTGCGAGCTGGGGATTGACGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104801 GCCGGCCTGGGTACACAGGTGCCACCTGCGAGCTGGGGATTGACGAGTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GACCCCAGCCCTTGTAAGAACGGAGGGAGCTGCACG         GATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104851 GACCCCAGCCCTTGTAAGAACGGAGGGAGCTGCACGGTG...TAGGATCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CGAGAACAGCTACTCCTGTACCTGCCCACCCGGCTTCTACGGCAAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105010 CGAGAACAGCTACTCCTGTACCTGCCCACCCGGCTTCTACGGCAAAATCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GTGAATTGAGTGCCATGACCTGTGCGGACGGCCCTTGCTTTAACGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105060 GTGAATTGAGTGCCATGACCTGTGCGGACGGCCCTTGCTTTAACGGGGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CGGTGCTCAGACAGCCCCGATGGAGGGTACAGCTGCCGCTGCCCCGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105110 CGGTGCTCAGACAGCCCCGATGGAGGGTACAGCTGCCGCTGCCCCGTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CTACTCCGGCTTCAACTGTGAGAAGAAAATTGACTACTGCAGCTCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105160 CTACTCCGGCTTCAACTGTGAGAAGAAAATTGACTACTGCAGCTCTTCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CCTGTTCTAATG         GTGCCAAGTGTGTGGACCTCGGTGATGCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 105210 CCTGTTCTAATGGTA...CAGGTGCCAAGTGTGTGGACCTCGGTGATGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TACCTGTGCCGCTGCCAGGCCGGCTTCTCGGGGAGGCACTGTGACGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106140 TACCTGTGCCGCTGCCAGGCCGGCTTCTCGGGGAGGCACTGTGACGACAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CGTGGACGACTGCGCCTCCTCCCCGTGCGCCAACGGGGGCACCTGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106190 CGTGGACGACTGCGCCTCCTCCCCGTGCGCCAACGGGGGCACCTGCCGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ATGGCGTGAACGACTTCTCCTGCACCTGCCCGCCTGGCTACACGGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106240 ATGGCGTGAACGACTTCTCCTGCACCTGCCCGCCTGGCTACACGGGCAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AACTGCAGTGCCCCCGTCAGCAGGTGCGAGCACGCACCCTGCCACAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106290 AACTGCAGTGCCCCCGTCAGCAGGTGCGAGCACGCACCCTGCCACAATGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GGCCACCTGCCACGAGAGGGGCCACCGCTATGTGTGCGAGTGTGCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106340 GGCCACCTGCCACGAGAGGGGCCACCGCTATGTGTGCGAGTGTGCCCGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GCTACGGGGGTCCCAACTGCCAGTTCCTGCTCCCCGAGCTGCCCCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106390 GCTACGGGGGTCCCAACTGCCAGTTCCTGCTCCCCGAGCTGCCCCCGGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CCAGCGGTGGTGGACCTCACTGAGAAGCTAGAGGGCCAGGGCGGGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106440 CCAGCGGTGGTGGACCTCACTGAGAAGCTAGAGGGCCAGGGCGGGCCATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CCCCTGGGTGGCCGTGTGCGCCGGGGTCATCCTTGTCCTCATGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106490 CCCCTGGGTGGCCGTGTGCGCCGGGGTCATCCTTGTCCTCATGCTGCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 TGGGCTGTGCCGCTGTGGTGGTCTGCGTCCGGCTGAGGCTGCAGAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106540 TGGGCTGTGCCGCTGTGGTGGTCTGCGTCCGGCTGAGGCTGCAGAAGCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 CGGCCCCCAGCCGACCCCTGCCGGGGGGAGACGGAGACCATGAACAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106590 CGGCCCCCAGCCGACCCCTGCCGGGGGGAGACGGAGACCATGAACAACCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 GGCCAACTGCCAGCGTGAGAAGGACATCTCAGTCAGCATCATCGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106640 GGCCAACTGCCAGCGTGAGAAGGACATCTCAGTCAGCATCATCGGGGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 CGCAGATCAAGAACACCAACAAGAAGGCGGACTTCCACGGGGACCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106690 CGCAGATCAAGAACACCAACAAGAAGGCGGACTTCCACGGGGACCACAGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GCCGACAAGAATGGCTTCAAGGCCCGCTACCCAGCGGTGGACTATAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106740 GCCGACAAGAATGGCTTCAAGGCCCGCTACCCAGCGGTGGACTATAACCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 CGTGCAGGACCTCAAGGGTGACGACACCGCCGTCAGGGACGCGCACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106790 CGTGCAGGACCTCAAGGGTGACGACACCGCCGTCAGGGACGCGCACAGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 AGCGTGACACCAAGTGCCAGCCCCAGGGCTCCTCAGGGGAGGAGAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106840 AGCGTGACACCAAGTGCCAGCCCCAGGGCTCCTCAGGGGAGGAGAAGGGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 ACCCCGACCACACTCAGGGG         TGGAGAAGCATCTGAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106890 ACCCCGACCACACTCAGGGGGTG...TAGTGGAGAAGCATCTGAAAGAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 AAGGCCGGACTCGGGCTGTTCAACTTCAAAAGACACCAAGTACCAGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107056 AAGGCCGGACTCGGGCTGTTCAACTTCAAAAGACACCAAGTACCAGTCGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 TGTACGTCATATCCGAGGAGAAGGATGAGTGCGTCATAGCAACTGAGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-
 107106 TGTACGTCATATCCGAGGAGAAGGATGAGTGCGTCATAGCAACTGAGGT