seq1 = pF1KE0017.tfa, 1650 bp
seq2 = pF1KE0017/gi568815593r_56823131.tfa (gi568815593r:56823131_57047075), 223945 bp

>pF1KE0017 1650
>gi568815593r:56823131_57047075 (Chr5)

(complement)

8-34  (96422-96448)   100% ->
35-180  (100005-100150)   99% ->
181-315  (108059-108193)   100% ->
316-436  (109378-109498)   100% ->
437-522  (111325-111410)   100% ->
523-595  (111576-111648)   100% ->
596-747  (113678-113829)   100% ->
748-829  (116331-116412)   100% ->
830-924  (118215-118309)   100% ->
925-1052  (123034-123161)   100% ->
1053-1195  (123243-123385)   100% ->
1196-1650  (123491-123945)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      8 AGGCTTCTTTTGGAAGTTCGAGCCCAG         TTGGGTCTTTGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  96422 AGGCTTCTTTTGGAAGTTCGAGCCCAGGTT...CAGTTGGGTCTTTGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     49 TCTGAGGATCATGATTTTGACCCCACTGCTGAGATGTTGGTCCATGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 TCTGAGGATCATGATTTTGACCCCACTGCTGAGATGTTGGTCCATGACTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     99 TGATGATGAAAGAACTCTTGAAGAAGAGGAAATGATGGATGAGGGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 TGATGATGAAAGAACTCTTGAAGAAGAGGAAATGATGGATGAGGGTAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149 ACTTCAGTTCGGAAATTGAAGACTTAGAAAAG         GAAGGAACC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100119 ACTTCAGTTCAGAAATTGAAGACTTAGAAAAGGTA...CAGGAAGGAACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190 ATGCCTCTAGAAGATTTACTGGCATTCTATGGCTATGAACCTACAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108068 ATGCCTCTAGAAGATTTACTGGCATTCTATGGCTATGAACCTACAATTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    240 AGCAGTTGCAAATTCCAGTGCAAATAGTTCCCCAAGTGAACTGGCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108118 AGCAGTTGCAAATTCCAGTGCAAATAGTTCCCCAAGTGAACTGGCAGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290 AACTACCAGACATGACACTAGACAAA         GAGGAAATAGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108168 AACTACCAGACATGACACTAGACAAAGTA...CAGGAGGAAATAGCAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    331 GACCTGTTGTCAGGTGATGACGAGGAAACTCAGTCTTCTGCGGATGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109393 GACCTGTTGTCAGGTGATGACGAGGAAACTCAGTCTTCTGCGGATGATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381 GACGCCATCTGTGACTTCCCATGAAACTTCTGATTTCTTCCCTAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109443 GACGCCATCTGTGACTTCCCATGAAACTTCTGATTTCTTCCCTAGGCCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    431 TACGAT         CAAATACTGCATGTGATGGTGATAAGGAATCAGAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109493 TACGATGTA...AAGCAAATACTGCATGTGATGGTGATAAGGAATCAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    472 GTTGAAGATGTTGAAACAGACAGTGGTAATTCACCTGAAGATTTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111360 GTTGAAGATGTTGAAACAGACAGTGGTAATTCACCTGAAGATTTGAGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    522 G         GAAATAATGATTGGTTTACAATATCAGGCAGAGATTCCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111410 GGTA...TAGGAAATAATGATTGGTTTACAATATCAGGCAGAGATTCCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    563 CTTATCTTGGAGAGTACGATGGTAATGAGAAAG         TATATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 111616 CTTATCTTGGAGAGTACGATGGTAATGAGAAAGGTA...CAGTATATGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    604 AACGAAGACCAGTTACTTTGGTGTCCTGATGTGGTTTTGGAGAGCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113686 AACGAAGACCAGTTACTTTGGTGTCCTGATGTGGTTTTGGAGAGCAAAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    654 TAAGGAATACCTTGTTGAGACTTCATTAAGGACTGGCAGTGAAAAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113736 TAAGGAATACCTTGTTGAGACTTCATTAAGGACTGGCAGTGAAAAAATAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    704 TGGATAGGATTTCTGCAGGAACACACACAAGGGACAATGAACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 113786 TGGATAGGATTTCTGCAGGAACACACACAAGGGACAATGAACAGGTA...

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    748    GCATTATATGAACTTCTCAAGTGTAACCACAATATAAAGGAAGCAAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116328 CAGGCATTATATGAACTTCTCAAGTGTAACCACAATATAAAGGAAGCAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    795 CGAAAGATACTGCTGCAATGGAAAGGCCTCTCAAG         AAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 116378 CGAAAGATACTGCTGCAATGGAAAGGCCTCTCAAGGTA...TAGAAGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    836 TGACTGCATGGACGGAAGAAGAATGCCGAAGCTTTGAACATGCACTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118221 TGACTGCATGGACGGAAGAAGAATGCCGAAGCTTTGAACATGCACTCATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    886 CTTTTTGGAAAAGATTTTCATCTTATACAGAAGAATAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 118271 CTTTTTGGAAAAGATTTTCATCTTATACAGAAGAATAAGGTA...TAGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    927 GAGAACTAGGACAGTTGCTGAGTGTGTAGCATTCTACTATATGTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123036 GAGAACTAGGACAGTTGCTGAGTGTGTAGCATTCTACTATATGTGGAAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    977 AATCTGAACGTTATGATTACTTTGCTCAACAGACAAGATTTGGGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123086 AATCTGAACGTTATGATTACTTTGCTCAACAGACAAGATTTGGGAAAAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1027 AGATATAACCATCACCCTGGAGTTAC         GGACTATATGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 123136 AGATATAACCATCACCCTGGAGTTACGTA...CAGGGACTATATGGATCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1068 TTTAGTAGATGAAACAGAAGCTTTGGGTGGGACGGTAAATGCTTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123258 TTTAGTAGATGAAACAGAAGCTTTGGGTGGGACGGTAAATGCTTCAGCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1118 TAACTTCTAACCGGCCTGAGCCTATTCCTGATCAACAGCTAAACATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123308 TAACTTCTAACCGGCCTGAGCCTATTCCTGATCAACAGCTAAACATTCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1168 AACTCCTTCACTGCCAGTGACTTGACAG         CTTTGACCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 123358 AACTCCTTCACTGCCAGTGACTTGACAGGTA...TAGCTTTGACCAACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1209 TGTAGCAACCGTCTGCGACCCCACAGATGTGAATTGTTTGGATGATAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123504 TGTAGCAACCGTCTGCGACCCCACAGATGTGAATTGTTTGGATGATAGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1259 TTCCTCCACTGGGCAACACACCCCGTGGACAAGTTAATCATGTGCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123554 TTCCTCCACTGGGCAACACACCCCGTGGACAAGTTAATCATGTGCCTGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1309 GTAACAGAAGAGTTACTCACCCTGCCCAGCAATGGGGAAAGTGATTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123604 GTAACAGAAGAGTTACTCACCCTGCCCAGCAATGGGGAAAGTGATTGTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1359 TAATTTATTTGAGACTGGATTTTATCACTCGGAGCTAAACCCTATGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123654 TAATTTATTTGAGACTGGATTTTATCACTCGGAGCTAAACCCTATGAACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1409 TGTGCAGTGAAGAGTCAGAGAGACCAGCAAAAAGATTGAAAATGGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123704 TGTGCAGTGAAGAGTCAGAGAGACCAGCAAAAAGATTGAAAATGGGCATT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1459 GCAGTCCCTGAATCCTTTATGAATGAAGTTTCTGTAAATAACCTGGGTGT
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123754 GCCGTCCCTGAATCCTTTATGAATGAAGTTTCTGTAAATAACCTGGGTGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1509 GGACTTTGAAAATCACACACATCACATCACCAGTGCCAAAATGGCTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123804 GGACTTTGAAAATCACACACATCACATCACCAGTGCCAAAATGGCTGTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1559 CTGTGGCTGACTTTGGCAGTCTCTCTGCCAACGAGACCAATGGTTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123854 CTGTGGCTGACTTTGGCAGTCTCTCTGCCAACGAGACCAATGGTTTCATC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :
   1609 AGTGCCCATGCTCTGCATCAGCACGCGGCCCTACACTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123904 AGTGCCCATGCTCTGCATCAGCACGCGGCCCTACACTCTGAG