seq1 = pF1KE0002.tfa, 1737 bp
seq2 = pF1KE0002/gi568815591r_100070233.tfa (gi568815591r:100070233_100277199), 206967 bp

>pF1KE0002 1737
>gi568815591r:100070233_100277199 (Chr7)

(complement)

1-166  (100001-100166)   100% ->
167-325  (100835-100993)   100% ->
326-648  (101306-101628)   100% ->
649-729  (102435-102515)   100% ->
730-892  (103203-103365)   99% ->
893-1023  (104983-105113)   100% ->
1024-1170  (105275-105421)   100% ->
1171-1310  (105522-105661)   100% ->
1311-1486  (105764-105939)   99% ->
1487-1737  (106717-106967)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGCGCTGCGACCTCTCCTGCTTCTGCTGCTGCCTCTGTGTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGCGCTGCGACCTCTCCTGCTTCTGCTGCTGCCTCTGTGTCCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCTGGTCCCGGACCCGGGAGCGAGGCAAAGGTCACCCGGAGTTGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCTGGTCCCGGACCCGGGAGCGAGGCAAAGGTCACCCGGAGTTGTGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACCCGGCAGGTGCTGGGGGCCCGGGGATATAGCTTAAACCTAATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACCCGGCAGGTGCTGGGGGCCCGGGGATATAGCTTAAACCTAATCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGCCCTGATCTCAG         GTGAGCACCTCCGGGTCTGTCCCCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGCCCTGATCTCAGGTG...CAGGTGAGCACCTCCGGGTCTGTCCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGTACACCTGCTGTTCCAGTGAGACAGAGCAGAGGCTGATCAGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100860 GGAGTACACCTGCTGTTCCAGTGAGACAGAGCAGAGGCTGATCAGGGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGAGGCCACCTTCCGAGGCCTGGTGGAGGACAGCGGCTCCTTTCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100910 CTGAGGCCACCTTCCGAGGCCTGGTGGAGGACAGCGGCTCCTTTCTGGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACACACTGGCTGCCAGGCACAGAAAATTTGATG         AGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100960 CACACACTGGCTGCCAGGCACAGAAAATTTGATGGTG...CAGAGTTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTGGAGATGCTCTCAGTAGCCCAGCACTCTCTGACCCAGCTCTTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101313 TCTGGAGATGCTCTCAGTAGCCCAGCACTCTCTGACCCAGCTCTTCTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTCCTACGGCCGCCTGTATGCCCAGCACGCCCTCATATTCAATGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101363 ACTCCTACGGCCGCCTGTATGCCCAGCACGCCCTCATATTCAATGGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTCTCTCGGCTGCGAGACTTCTATGGGGAATCTGGTGAGGGGTTGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101413 TTCTCTCGGCTGCGAGACTTCTATGGGGAATCTGGTGAGGGGTTGGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACCCTGGCGGATTTCTGGGCACAGCTCCTGGAGAGAGTGTTCCCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101463 CACCCTGGCGGATTTCTGGGCACAGCTCCTGGAGAGAGTGTTCCCGCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCACCCACAGTACAGCTTCCCCCCTGACTACCTGCTCTGCCTCTCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101513 TGCACCCACAGTACAGCTTCCCCCCTGACTACCTGCTCTGCCTCTCACGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TTGGCCTCATCTACCGATGGCTCTCTGCAGCCCTTTGGGGACTCACCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101563 TTGGCCTCATCTACCGATGGCTCTCTGCAGCCCTTTGGGGACTCACCCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCGCCTCCGCCTGCAG         ATAACCCGGACCCTGGTGGCTGCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101613 CCGCCTCCGCCTGCAGGTG...CAGATAACCCGGACCCTGGTGGCTGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GAGCCTTTGTGCAGGGCCTGGAGACTGGAAGAAATGTGGTCAGCGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102460 GAGCCTTTGTGCAGGGCCTGGAGACTGGAAGAAATGTGGTCAGCGAAGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTTAAG         GTGCCGGTGTCTGAAGGCTGCAGCCAGGCTCTGAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102510 CTTAAGGTT...CAGGTGCCGGTGTCTGAAGGCTGCAGCCAGGCTCTGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCGTCTCATCGGCTGTCCCCTGTGCCGGGGGGTCCCCTCACTTATGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103238 GCGTCTCATCGGCTGTCCCCTGTGCCGGGGGGTCCCCTCACTTATGCCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GCCAGGGCTTCTGCCTCAACGTGGTTCGTGGCTGTCTCAGCAGCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103288 GCCAGGGCTTCTGCCTCAACGTGGTTCGTGGCTGTCTCAGCAGCAGGGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTGGAGCCTGACTGGAGCAACTATCTGG         ATGGTCTCCTGAT
        ||||||||||||||| ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103338 CTGGAGCCTGACTGGGGCAACTATCTGGGTG...AAGATGGTCTCCTGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCTGGCTGATAAGCTCCAGGGCCCCTTTTCCTTTGAGCTGACGGCCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104996 CCTGGCTGATAAGCTCCAGGGCCCCTTTTCCTTTGAGCTGACGGCCGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCATTGGGGTGAAGATCTCGGAGGGTTTGATGTACCTGCAGGAAAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105046 CCATTGGGGTGAAGATCTCGGAGGGTTTGATGTACCTGCAGGAAAACAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GCGAAGGTGTCCGCCCAG         GTGTTTCAGGAGTGCGGCCCCCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 105096 GCGAAGGTGTCCGCCCAGGTA...CAGGTGTTTCAGGAGTGCGGCCCCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CGACCCGGTGCCTGCCCGCAACCGTCGAGCCCCGCCGCCCCGGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105298 CGACCCGGTGCCTGCCCGCAACCGTCGAGCCCCGCCGCCCCGGGAAGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CGGGCCGGCTGTGGTCGATGGTGACCGAGGAGGAGCGGCCCACGACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105348 CGGGCCGGCTGTGGTCGATGGTGACCGAGGAGGAGCGGCCCACGACGGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GCAGGCACCAACCTGCACCGGCTG         GTGTGGGAGCTCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105398 GCAGGCACCAACCTGCACCGGCTGGTG...CAGGTGTGGGAGCTCCGCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCGTCTGGCCCGGATGCGGGGCTTCTGGGCCCGGCTGTCCCTGACGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105539 GCGTCTGGCCCGGATGCGGGGCTTCTGGGCCCGGCTGTCCCTGACGGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GCGGAGACTCTCGCATGGCAGCGGACGCCTCGCTGGAGGCGGCGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105589 GCGGAGACTCTCGCATGGCAGCGGACGCCTCGCTGGAGGCGGCGCCCTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TGGACCGGAGCCGGGCGGGGCCG         GTACTTGCCGCCAGTGGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105639 TGGACCGGAGCCGGGCGGGGCCGGTG...CAGGTACTTGCCGCCAGTGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CGGGGGCTCCCCGGCCGAGCAGGTCAACAACCCCGAGCTCAAGGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105782 CGGGGGCTCCCCGGCCGAGCAGGTCAACAACCCCGAGCTCAAGGTGGACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCTCGGGCCCCGATGTCCCGACACGGCGGCGTCGACTACAGCTCCGGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 105832 CCTCGGGCCCCGATGTCCCGACACGGCGGCGTCGGCTACAGCTCCGGGCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GCCACGGCCAGAATGAAAACGGCCGCACTGGGACACGACCTGGACGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105882 GCCACGGCCAGAATGAAAACGGCCGCACTGGGACACGACCTGGACGGGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GGACGCGG         ATGAGGATGCCAGCGGCTCTGGAGGGGGACAGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105932 GGACGCGGGTG...CAGATGAGGATGCCAGCGGCTCTGGAGGGGGACAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AGTATGCAGATGACTGGATGGCTGGGGCTGTGGCTCCCCCAGCCCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106750 AGTATGCAGATGACTGGATGGCTGGGGCTGTGGCTCCCCCAGCCCGGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CCTCGGCCTCCATACCCTCCTAGAAGGGATGGTTCTGGGGGCAAAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106800 CCTCGGCCTCCATACCCTCCTAGAAGGGATGGTTCTGGGGGCAAAGGAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AGGTGGCAGTGCCCGCTACAACCAGGGCCGGAGCAGGAGTGGGGGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106850 AGGTGGCAGTGCCCGCTACAACCAGGGCCGGAGCAGGAGTGGGGGGGCAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 CTATTGGTTTTCACACCCAAACCATCCTCATTCTCTCCCTCTCAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106900 CTATTGGTTTTCACACCCAAACCATCCTCATTCTCTCCCTCTCAGCCCTG

   1800     .    :    .
   1720 GCCCTGCTTGGACCTCGA
        ||||||||||||||||||
 106950 GCCCTGCTTGGACCTCGA