seq1 = pF1KB9962.tfa, 2076 bp
seq2 = pF1KB9962/gi568815588r_14808411.tfa (gi568815588r:14808411_15054010), 245600 bp

>pF1KB9962 2076
>gi568815588r:14808411_15054010 (Chr10)

(complement)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-161  (104924-104975)   100% ->
162-246  (108822-108906)   100% ->
247-306  (114142-114201)   100% ->
307-362  (117418-117473)   100% ->
363-464  (118447-118548)   100% ->
465-537  (119236-119308)   100% ->
538-678  (119491-119631)   99% ->
679-780  (121056-121157)   100% ->
781-917  (125859-125995)   100% ->
918-972  (127114-127168)   100% ->
973-1061  (130942-131030)   100% ->
1062-1156  (134179-134273)   100% ->
1157-2076  (144681-145600)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTCTTTCGAGGGGCAGATGGCCGAGTATCCAACTATCTCCATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTCTTTCGAGGGGCAGATGGCCGAGTATCCAACTATCTCCATAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCTTCGATAGGGAGAACCTGAGGGCCCGCGCCTACTTCCTGTCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCTTCGATAGGGAGAACCTGAGGGCCCGCGCCTACTTCCTGTCCCACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACAAAG         ATCACATGAAAGGATTAAGAGCCCCTACCTTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCACAAAGGTG...TAGATCACATGAAAGGATTAAGAGCCCCTACCTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAAGAAGGTTGGAGTGCAG         CTTGAAGGTTTATCTATACTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104956 AAAAGAAGGTTGGAGTGCAGGTA...CAGCTTGAAGGTTTATCTATACTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTCACCTGTGACTAAGGAGTTGTTGTTAACGAGCCCGAAATACAGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108843 TTCACCTGTGACTAAGGAGTTGTTGTTAACGAGCCCGAAATACAGATTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAAGAAACGAATT         ATATCTATTGAAATCGAGACTCCTACC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 108893 GGAAGAAACGAATTGTA...TAGATATCTATTGAAATCGAGACTCCTACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CAGATATCTTTAGTGGATGAAGCATCAGGAGAG         AAGGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 114169 CAGATATCTTTAGTGGATGAAGCATCAGGAGAGGTA...TAGAAGGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GATTGTTGTGACTCTCTTACCAGCTGGTCACTGTCCGGGATCAGTTAT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 117426 GATTGTTGTGACTCTCTTACCAGCTGGTCACTGTCCGGGATCAGTTATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    363        GTTTTTATTTCAGGGCAATAATGGAACTGTCCTGTACACAGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117476 A...CAGGTTTTTATTTCAGGGCAATAATGGAACTGTCCTGTACACAGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GACTTCAGATTGGCGCAAGGAGAAGCTGCTAGAATGGAGCTTCTGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118490 GACTTCAGATTGGCGCAAGGAGAAGCTGCTAGAATGGAGCTTCTGCACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CGGGGGCAG         AGTCAAAGACATCCAAAGTGTATATTTGGATA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 118540 CGGGGGCAGGTA...CAGAGTCAAAGACATCCAAAGTGTATATTTGGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 CTACGTTCTGTGATCCAAGATTTTACCAAATTCCAAGTCGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 119268 CTACGTTCTGTGATCCAAGATTTTACCAAATTCCAAGTCGGGTA...TAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GAGGAGTGTTTAAGTGGAGTCTTAGAGCTGGTCCGAAGCTGGATCACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119491 GAGGAGTGTTTAAGTGGAGTCTTAGAGCTGGTCCGAAGCTGGATCACTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GAGCCCGTACCATGTTGTGTGGCTGAACTGCAAAGCGGCTTATGGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119541 GAGCCCGTACCATGTTGTGTGGCTGAACTGCAAAGCGGCTTATGGCTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AATATTTGTTCACCAACCTTAGTGAAGAATTAGGAGTCCAG         
        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 119591 AATATCTGTTCACCAACCTTAGTGAAGAATTAGGAGTCCAGGTA...TAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GTTCATGTGAATAAGCTAGACATGTTTAGGAACATGCCTGAGATCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121056 GTTCATGTGAATAAGCTAGACATGTTTAGGAACATGCCTGAGATCCTTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TCATCTCACAACAGACCGCAACACTCAGATCCATGCATGCCGGCATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121106 TCATCTCACAACAGACCGCAACACTCAGATCCATGCATGCCGGCATCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AG         GCAGAGGAATATTTTCAGTGGAGCAAATTACCCTGTGGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121156 AGGTA...TAGGCAGAGGAATATTTTCAGTGGAGCAAATTACCCTGTGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 ATTACTTCCAGAAATAGAATTCCACTCCACATAATCAGCATTAAGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125898 ATTACTTCCAGAAATAGAATTCCACTCCACATAATCAGCATTAAGCCATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CACCATGTGGTTTGGAGAAAGGAGCAGAAAAACAAATGTAATTGTGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 125948 CACCATGTGGTTTGGAGAAAGGAGCAGAAAAACAAATGTAATTGTGAGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    918        GACTGGAGAGAGTTCATACAGAGCTTGTTTTTCTTTTCACTCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125998 A...TAGGACTGGAGAGAGTTCATACAGAGCTTGTTTTTCTTTTCACTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 TCCTACAGTGAG         ATTAAAGATTTCTTGAGCTACCTCTGTCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 127157 TCCTACAGTGAGGTA...TAGATTAAAGATTTCTTGAGCTACCTCTGTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 TGTGAACGCATATCCAAATGTCATTCCAGTTGGCACAACTATGGATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130971 TGTGAACGCATATCCAAATGTCATTCCAGTTGGCACAACTATGGATAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TTGTCGAAAT         CTTAAAGCCTTTATGCCGGTCTTCCCAAAGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 131021 TTGTCGAAATGTG...CAGCTTAAAGCCTTTATGCCGGTCTTCCCAAAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 ACGGAGCCAAAGTATAAACCACTGGGAAAACTGAAGAGAGCTAGAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134210 ACGGAGCCAAAGTATAAACCACTGGGAAAACTGAAGAGAGCTAGAACAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 TCACCGAGACTCAG         AGGAGGAAGATGACTATCTCTTTGATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 134260 TCACCGAGACTCAGGTA...CAGAGGAGGAAGATGACTATCTCTTTGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 ATCCTCTGCCAATACCTTTAAGGCACAAAGTTCCATACCCGGAAACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144708 ATCCTCTGCCAATACCTTTAAGGCACAAAGTTCCATACCCGGAAACTTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 CACCCTGAGGTATTTTCAATGACTGCAGTATCAGAAAAGCAGCCTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144758 CACCCTGAGGTATTTTCAATGACTGCAGTATCAGAAAAGCAGCCTGAAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 ACTGAGACAAACCCCAGGATGCTGCAGAGCAGAGTGTATGCAGAGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144808 ACTGAGACAAACCCCAGGATGCTGCAGAGCAGAGTGTATGCAGAGCTCTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 GTTTCACAAACTTTGTAGATTGTGAAGAATCCAACAGTGAAAGTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144858 GTTTCACAAACTTTGTAGATTGTGAAGAATCCAACAGTGAAAGTGAAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GAAGTAGGAATCCCAGCTTCACTGCAAGGAGATCTGGGCTCTGTACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144908 GAAGTAGGAATCCCAGCTTCACTGCAAGGAGATCTGGGCTCTGTACTTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CCTGCAAAAGGCTGATGGGGATGTACCCCAGTGGGAAGTATTCTTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144958 CCTGCAAAAGGCTGATGGGGATGTACCCCAGTGGGAAGTATTCTTTAAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GAAATGATGAAATCACAGATGAGAGTTTGGAAAACTTCCCTTCCTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145008 GAAATGATGAAATCACAGATGAGAGTTTGGAAAACTTCCCTTCCTCCACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GTGGCAGGGGGATCTCAGTCACCAAAGCTTTTCAGTGACTCTGATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145058 GTGGCAGGGGGATCTCAGTCACCAAAGCTTTTCAGTGACTCTGATGGAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 ATCAACTCACATCTCCTCCCAGAATTCTTCCCAGTCAACACACATAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145108 ATCAACTCACATCTCCTCCCAGAATTCTTCCCAGTCAACACACATAACAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AACAAGGAAGTCAAGGCTGGGACAGCCAATCTGATACTGTTTTGTTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145158 AACAAGGAAGTCAAGGCTGGGACAGCCAATCTGATACTGTTTTGTTATCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TCCCAAGAGAGAAACAGTGGGGATATTACTTCCTTGGACAAAGCTGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145208 TCCCAAGAGAGAAACAGTGGGGATATTACTTCCTTGGACAAAGCTGACTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CAGACCAACAATCAAAGAGAATATTCCTGCCTCTCTCATGGAACAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145258 CAGACCAACAATCAAAGAGAATATTCCTGCCTCTCTCATGGAACAAAATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TAATTTGCCCAAAGGATACTTACTCTGATTTGAAAAGCAGAGATAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145308 TAATTTGCCCAAAGGATACTTACTCTGATTTGAAAAGCAGAGATAAAGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GTGACAATAGTTCCTAGTACTGGAGAACCAACTACTCTAAGCAGTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145358 GTGACAATAGTTCCTAGTACTGGAGAACCAACTACTCTAAGCAGTGAGAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 ACATATACCCGAGGAAAAAAGTTTGCTAAATCTTAGCACAAATGCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145408 ACATATACCCGAGGAAAAAAGTTTGCTAAATCTTAGCACAAATGCAGATT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CCCAGAGCTCTTCTGATTTTGAAGTTCCCTCAACTCCAGAAGCTGAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145458 CCCAGAGCTCTTCTGATTTTGAAGTTCCCTCAACTCCAGAAGCTGAGTTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CCTAAACGAGAGCATTTACAATATTTATATGAGAAGCTGGCAACTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145508 CCTAAACGAGAGCATTTACAATATTTATATGAGAAGCTGGCAACTGGTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GAGTATAGCAGTCAAAAAAAGAAAATGCTCACTCTTAGATACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145558 GAGTATAGCAGTCAAAAAAAGAAAATGCTCACTCTTAGATACC