seq1 = pF1KB9950.tfa, 2025 bp
seq2 = pF1KB9950/gi568815575f_15408354.tfa (gi568815575f:15408354_15656144), 247791 bp

>pF1KB9950 2025
>gi568815575f:15408354_15656144 (ChrX)

1-138  (100001-100138)   100% ->
139-243  (100976-101080)   100% ->
244-325  (103084-103165)   100% ->
326-445  (107759-107878)   100% ->
446-510  (109576-109640)   100% ->
511-752  (113993-114234)   100% ->
753-830  (116935-117012)   100% ->
831-884  (117689-117742)   100% ->
885-939  (121620-121674)   100% ->
940-1019  (122975-123054)   100% ->
1020-1147  (125859-125986)   100% ->
1148-1222  (128000-128074)   100% ->
1223-1394  (128781-128952)   100% ->
1395-1611  (133629-133845)   100% ->
1612-1676  (134718-134782)   100% ->
1677-1795  (138450-138568)   100% ->
1796-1953  (141487-141644)   100% ->
1954-2025  (147720-147791)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATACAAAATCTATTCTAGAAGAACTTCTTCTCAAAAGATCACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATACAAAATCTATTCTAGAAGAACTTCTTCTCAAAAGATCACAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAGAAGAAAATGTCACCAAATAATTACAAAGAACGGCTTTTTGTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAGAAGAAAATGTCACCAAATAATTACAAAGAACGGCTTTTTGTTTTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAAACAAACCTTTCCTACTATGAATATGACAAAATG         AAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100101 CCAAAACAAACCTTTCCTACTATGAATATGACAAAATGGTG...CAGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGGGCAGCAGAAAAGGATCCATTGAAATTAAGAAAATCAGATGTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100979 AGGGGCAGCAGAAAAGGATCCATTGAAATTAAGAAAATCAGATGTGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAAGTAAATCTCGAGGAGCAGACGCCTGTAGAGAGACAGTACCCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101029 GAAAGTAAATCTCGAGGAGCAGACGCCTGTAGAGAGACAGTACCCATTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AG         ATTGTCTATAAAGATGGGCTTCTCTATGTCTATGCATCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101079 AGGTA...CAGATTGTCTATAAAGATGGGCTTCTCTATGTCTATGCATCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATGAAGAGAGCCGAAGTCAGTGGTTGAAAGCATTACAAAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103123 AATGAAGAGAGCCGAAGTCAGTGGTTGAAAGCATTACAAAAAGGTA...C

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    326   AGATAAGGGGTAACCCCCACCTGCTGGTCAAGTACCATAGTGGGTTCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107757 AGAGATAAGGGGTAACCCCCACCTGCTGGTCAAGTACCATAGTGGGTTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCGTGGACGGGAAGTTCCTGTGTTGCCAGCAGAGCTGTAAAGCAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107807 TCGTGGACGGGAAGTTCCTGTGTTGCCAGCAGAGCTGTAAAGCAGCCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGATGTACCCTCTGGGAAGCAT         ATGCTAATCTGCATACTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 107857 GGATGTACCCTCTGGGAAGCATGTA...CAGATGCTAATCTGCATACTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGTCAATGAAGAGAAACACAGAGTTCCCACCTTCCCAGACAGAGTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 109595 AGTCAATGAAGAGAAACACAGAGTTCCCACCTTCCCAGACAGAGTGGTA.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    511      CTGAAGATACCTCGGGCAGTTCCTGTTCTCAAAATGGATGCACCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109645 ..AAGCTGAAGATACCTCGGGCAGTTCCTGTTCTCAAAATGGATGCACCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCTTCAAGTACCACTCTAGCCCAATATGACAACGAATCAAAGAAAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114038 TCTTCAAGTACCACTCTAGCCCAATATGACAACGAATCAAAGAAAAACTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGGCTCCCAGCCACCATCTTCAAGTACCAGTCTAGCGCAATATGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114088 TGGCTCCCAGCCACCATCTTCAAGTACCAGTCTAGCGCAATATGACAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACTCAAAGAAAATCTATGGCTCCCAGCCAAACTTCAACATGCAGTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114138 ACTCAAAGAAAATCTATGGCTCCCAGCCAAACTTCAACATGCAGTATATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCAAGGGAAGACTTCCCTGACTGGTGGCAAGTAAGAAAACTGAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 114188 CCAAGGGAAGACTTCCCTGACTGGTGGCAAGTAAGAAAACTGAAAAGGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    753       TAGCAGCAGCAGTGAAGATGTTGCAAGCAGTAACCAAAAAGAAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114238 ...CAGTAGCAGCAGCAGTGAAGATGTTGCAAGCAGTAACCAAAAAGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GAAATGTGAATCACACCACCTCAAAGATTTCATG         GGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 116979 GAAATGTGAATCACACCACCTCAAAGATTTCATGGTA...AAGGGAATTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCTGAGTCAAGTTCATCTGAAGAAGAGGAAAACCTGGATGATTATGA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 117696 CCTGAGTCAAGTTCATCTGAAGAAGAGGAAAACCTGGATGATTATGAGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    885       CTGGTTTGCTGGTAACATCTCCAGATCACAATCTGAACAGTTAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117746 ...CAGCTGGTTTGCTGGTAACATCTCCAGATCACAATCTGAACAGTTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCAGACAAAAG         GGAAAAGAAGGAGCATTTATGGTTAGAAAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 121664 TCAGACAAAAGGTA...CAGGGAAAAGAAGGAGCATTTATGGTTAGAAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TCGAGCCAAGTGGGAATGTACACAGTGTCCTTATTTAGTAAGGCTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123005 TCGAGCCAAGTGGGAATGTACACAGTGTCCTTATTTAGTAAGGCTGTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020          TGATAAAAAAGGAACTGTCAAACATTACCACGTGCATACAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123055 GTA...TAGTGATAAAAAAGGAACTGTCAAACATTACCACGTGCATACAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ATGCTGAGAACAAATTATACCTGGCAGAAAACTACTGTTTTGATTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125900 ATGCTGAGAACAAATTATACCTGGCAGAAAACTACTGTTTTGATTCCATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CCAAAGCTTATTCATTATCATCAACACAATTCAGCAG         GCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 125950 CCAAAGCTTATTCATTATCATCAACACAATTCAGCAGGTA...CAGGCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GATCACACGGCTCCGCCACCCTGTGTCAACAAAGGCCAACAAGGTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128004 GATCACACGGCTCCGCCACCCTGTGTCAACAAAGGCCAACAAGGTCCCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ACTCTGTGTCCCTGGGAAATG         GAATCTGGGAACTGAAAAGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128054 ACTCTGTGTCCCTGGGAAATGGTA...TAGGAATCTGGGAACTGAAAAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GAAGAGATTACCTTGTTGAAGGAGCTGGGAAGTGGCCAGTTTGGAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128801 GAAGAGATTACCTTGTTGAAGGAGCTGGGAAGTGGCCAGTTTGGAGTGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CCAGCTGGGCAAGTGGAAGGGGCAGTATGATGTTGCTGTTAAGATGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128851 CCAGCTGGGCAAGTGGAAGGGGCAGTATGATGTTGCTGTTAAGATGATCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AGGAGGGCTCCATGTCAGAAGATGAATTCTTTCAGGAGGCCCAGACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128901 AGGAGGGCTCCATGTCAGAAGATGAATTCTTTCAGGAGGCCCAGACTATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AT         GAAACTCAGCCATCCCAAGCTGGTTAAATTCTATGGAGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128951 ATGTA...CAGGAAACTCAGCCATCCCAAGCTGGTTAAATTCTATGGAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 GTGTTCAAAGGAATACCCCATATACATAGTGACTGAATATATAAGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133668 GTGTTCAAAGGAATACCCCATATACATAGTGACTGAATATATAAGCAATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GCTGCTTGCTGAATTACCTGAGGAGTCACGGAAAAGGACTTGAACCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133718 GCTGCTTGCTGAATTACCTGAGGAGTCACGGAAAAGGACTTGAACCTTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 CAGCTCTTAGAAATGTGCTACGATGTCTGTGAAGGCATGGCCTTCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133768 CAGCTCTTAGAAATGTGCTACGATGTCTGTGAAGGCATGGCCTTCTTGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GAGTCACCAATTCATACACCGGGACTTG         GCTGCTCGTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 133818 GAGTCACCAATTCATACACCGGGACTTGGTA...AAGGCTGCTCGTAACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 GCTTGGTGGACAGAGATCTCTGTGTGAAAGTATCTGACTTTGGAATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134731 GCTTGGTGGACAGAGATCTCTGTGTGAAAGTATCTGACTTTGGAATGACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 AG         GTATGTTCTTGATGACCAGTATGTCAGTTCAGTCGGAAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134781 AGGTA...CAGGTATGTTCTTGATGACCAGTATGTCAGTTCAGTCGGAAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 AAAGTTTCCAGTCAAGTGGTCAGCTCCAGAGGTGTTTCATTACTTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138489 AAAGTTTCCAGTCAAGTGGTCAGCTCCAGAGGTGTTTCATTACTTCAAAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 ACAGCAGCAAGTCAGACGTATGGGCATTTG         GGATCCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 138539 ACAGCAGCAAGTCAGACGTATGGGCATTTGGTA...CAGGGATCCTGATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 TGGGAGGTGTTCAGCCTGGGGAAGCAGCCCTATGACTTGTATGACAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141498 TGGGAGGTGTTCAGCCTGGGGAAGCAGCCCTATGACTTGTATGACAACTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 CCAGGTGGTTCTGAAGGTCTCCCAGGGCCACAGGCTTTACCGGCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141548 CCAGGTGGTTCTGAAGGTCTCCCAGGGCCACAGGCTTTACCGGCCCCACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TGGCATCGGACACCATCTACCAGATCATGTACAGCTGCTGGCACGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 141598 TGGCATCGGACACCATCTACCAGATCATGTACAGCTGCTGGCACGAGGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1954       CTTCCAGAAAAGCGTCCCACATTTCAGCAACTCCTGTCTTCCAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141648 ...TAGCTTCCAGAAAAGCGTCCCACATTTCAGCAACTCCTGTCTTCCAT

   2150     .    :    .    :    .
   1998 TGAACCACTTCGGGAAAAAGACAAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 147764 TGAACCACTTCGGGAAAAAGACAAGCAT