seq1 = pF1KB9918.tfa, 1737 bp
seq2 = pF1KB9918/gi568815592r_90416504.tfa (gi568815592r:90416504_90686883), 270380 bp

>pF1KB9918 1737
>gi568815592r:90416504_90686883 (Chr6)

(complement)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-231  (115077-115187)   100% ->
232-297  (118261-118326)   100% ->
298-343  (125217-125262)   100% ->
344-482  (126670-126808)   100% ->
483-607  (130260-130384)   100% ->
608-736  (133298-133426)   100% ->
737-867  (134705-134835)   100% ->
868-949  (136335-136416)   100% ->
950-1080  (138707-138837)   100% ->
1081-1210  (139497-139626)   100% ->
1211-1275  (150483-150547)   100% ->
1276-1381  (163101-163206)   100% ->
1382-1443  (167565-167626)   100% ->
1444-1559  (168322-168437)   100% ->
1560-1737  (170203-170380)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTACAGCCTCTGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTTCGGCCGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTACAGCCTCTGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTTCGGCCGGTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGATCGAAGCCCCTTCCCAGGTCCTCAACTTTGAAGAGATCGACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGATCGAAGCCCCTTCCCAGGTCCTCAACTTTGAAGAGATCGACTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGATCGAGGTGGAAGAG         GTTGTTGGAAGAGGAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTG...CAGGTTGTTGGAAGAGGAGCCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAGTTGTTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTTGCTATTAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115098 GGAGTTGTTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTTGCTATTAAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATAGAAAGTGAATCTGAGAGGAAAGCGTTTATTGTAGAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 115148 AATAGAAAGTGAATCTGAGAGGAAAGCGTTTATTGTAGAGGTA...CAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCGGCAGTTATCCCGTGTGAACCATCCTAATATTGTAAAGCTTTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118262 TTCGGCAGTTATCCCGTGTGAACCATCCTAATATTGTAAAGCTTTATGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCTGCTTGAATCCA         GTGTGTCTTGTGATGGAATATGCTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 118312 GCCTGCTTGAATCCAGTA...TAGGTGTGTCTTGTGATGGAATATGCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGGGGGCTCTTTATATAATG         TGCTGCATGGTGCTGAACCAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 125243 AGGGGGCTCTTTATATAATGGTG...CAGTGCTGCATGGTGCTGAACCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGCCATATTATACTGCTGCCCACGCAATGAGTTGGTGTTTACAGTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126691 TGCCATATTATACTGCTGCCCACGCAATGAGTTGGTGTTTACAGTGTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAAGGAGTGGCTTATCTTCACAGCATGCAACCCAAAGCGCTAATTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126741 CAAGGAGTGGCTTATCTTCACAGCATGCAACCCAAAGCGCTAATTCACAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGACCTGAAACCACCAAA         CTTACTGCTGGTTGCAGGGGGGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 126791 GGACCTGAAACCACCAAAGTA...CAGCTTACTGCTGGTTGCAGGGGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CAGTTCTAAAAATTTGTGATTTTGGTACAGCCTGTGACATTCAGACACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130283 CAGTTCTAAAAATTTGTGATTTTGGTACAGCCTGTGACATTCAGACACAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGACCAATAACAAGGGGAGTGCTGCTTGGATGGCACCTGAAGTTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130333 ATGACCAATAACAAGGGGAGTGCTGCTTGGATGGCACCTGAAGTTTTTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AG         GTAGTAATTACAGTGAAAAATGTGACGTCTTCAGCTGGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130383 AGGTA...TAGGTAGTAATTACAGTGAAAAATGTGACGTCTTCAGCTGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GTATTATTCTTTGGGAAGTGATAACGCGTCGGAAACCCTTTGATGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133337 GTATTATTCTTTGGGAAGTGATAACGCGTCGGAAACCCTTTGATGAGATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGTGGCCCAGCTTTCCGAATCATGTGGGCTGTTCATAATG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 133387 GGTGGCCCAGCTTTCCGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGTT...TAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TACTCGACCACCACTGATAAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134706 TACTCGACCACCACTGATAAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGACTCGTTGTTGGTCTAAAGATCCTTCCCAGCGCCCTTCAATGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134756 TGACTCGTTGTTGGTCTAAAGATCCTTCCCAGCGCCCTTCAATGGAGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGG         TACTTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 134806 ATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGGTA...TAGTACTTTCCAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGCAGATGAGCCATTACAGTATCCTTGTCAGTATTCAGATGAAGGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136346 AGCAGATGAGCCATTACAGTATCCTTGTCAGTATTCAGATGAAGGACAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCAACTCTGCCACCAGTACAG         GCTCATTCATGGACATTGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 136396 GCAACTCTGCCACCAGTACAGGTA...TAGGCTCATTCATGGACATTGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TCTACAAATACGAGTAACAAAAGTGACACTAATATGGAGCAAGTTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138727 TCTACAAATACGAGTAACAAAAGTGACACTAATATGGAGCAAGTTCCTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CACAAATGATACTATTAAGCGCTTAGAATCAAAATTGTTGAAAAATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138777 CACAAATGATACTATTAAGCGCTTAGAATCAAAATTGTTGAAAAATCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CAAAGCAACAG         AGTGAATCTGGACGTTTAAGCTTGGGAGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 138827 CAAAGCAACAGGTT...CAGAGTGAATCTGGACGTTTAAGCTTGGGAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TCCCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCAACCTCTGAGGGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139527 TCCCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCAACCTCTGAGGGCAAGAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GATGAGTGCTGACATGTCTGAAATAGAAGCTAGGATCGCCGCAACCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139577 GATGAGTGCTGACATGTCTGAAATAGAAGCTAGGATCGCCGCAACCACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211          GCAACGGACAGCCAAGACGTAGATCCATCCAAGACTTGACT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139627 GTA...AAGGCAACGGACAGCCAAGACGTAGATCCATCCAAGACTTGACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GTAACTGGAACAGAACCTGGTCAG         GTGAGCAGTAGGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 150524 GTAACTGGAACAGAACCTGGTCAGGTA...TAGGTGAGCAGTAGGTCATC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CAGTCCCAGTGTCAGAATGATTACTACCTCAGGACCAACCTCAGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163118 CAGTCCCAGTGTCAGAATGATTACTACCTCAGGACCAACCTCAGAAAAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 CAACTCGAAGTCATCCATGGACCCCTGATGATTCCACAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 163168 CAACTCGAAGTCATCCATGGACCCCTGATGATTCCACAGGTG...CAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 ACCAATGGATCAGATAACTCCATCCCAATGGCTTATCTTACACTGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167567 ACCAATGGATCAGATAACTCCATCCCAATGGCTTATCTTACACTGGATCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CCAACTACAG         CCTCTAGCACCGTGCCCAAACTCCAAAGAAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 167617 CCAACTACAGGTA...CAGCCTCTAGCACCGTGCCCAAACTCCAAAGAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 CTATGGCAGTGTTTGAACAGCATTGTAAAATGGCACAAGAATATATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168353 CTATGGCAGTGTTTGAACAGCATTGTAAAATGGCACAAGAATATATGAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 GTTCAAACAGAAATTGCATTGTTATTACAGAGAAA         GCAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 168403 GTTCAAACAGAAATTGCATTGTTATTACAGAGAAAGTA...TAGGCAAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 ACTAGTTGCAGAACTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170209 ACTAGTTGCAGAACTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 GCCTGGTACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170259 GCCTGGTACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 ACTTACTACCAGCAATGCAAAAAACAACTAGAGGTCATCAGAAGTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170309 ACTTACTACCAGCAATGCAAAAAACAACTAGAGGTCATCAGAAGTCAGCA

   1850     .    :    .    :
   1716 GCAGAAACGACAAGGCACTTCA
        ||||||||||||||||||||||
 170359 GCAGAAACGACAAGGCACTTCA