seq1 = pF1KB9904.tfa, 1767 bp
seq2 = pF1KB9904/gi568815579r_38736725.tfa (gi568815579r:38736725_38949966), 213242 bp

>pF1KB9904 1767
>gi568815579r:38736725_38949966 (Chr19)

(complement)

1-267  (100001-100267)   100% ->
268-386  (102533-102651)   100% ->
387-624  (103877-104114)   100% ->
625-712  (104232-104319)   100% ->
713-807  (105865-105959)   100% ->
808-880  (106053-106125)   100% ->
881-952  (109408-109479)   100% ->
953-1233  (109591-109871)   100% ->
1234-1355  (110952-111073)   100% ->
1356-1557  (111369-111570)   100% ->
1558-1615  (112316-112373)   100% ->
1616-1711  (112488-112583)   100% ->
1712-1767  (113187-113242)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGCGGAGGCTGCTGCCCCGGGCGGAGAAGCGGCGTCGGCGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGCGGAGGCTGCTGCCCCGGGCGGAGAAGCGGCGTCGGCGGCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGAGGCAGCAGCCGGACGAGCAGCGGAGGCGGTCGGGAGCGATGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGAGGCAGCAGCCGGACGAGCAGCGGAGGCGGTCGGGAGCGATGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATGGCGGCGGCGGGCGGCGGAGGCGGCGGTGGCCGCTACTACGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGATGGCGGCGGCGGGCGGCGGAGGCGGCGGTGGCCGCTACTACGGCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCAGTGAGGGCGGCCGGGCCCCTAAGCGGCTCAAGACTGACAACGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCAGTGAGGGCGGCCGGGCCCCTAAGCGGCTCAAGACTGACAACGCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACCAGCACGGAGGCGGCGGCGGTGGCGGTGGAGGAGCCGGGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGACCAGCACGGAGGCGGCGGCGGTGGCGGTGGAGGAGCCGGGGCGGCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGGCGGCGGCGGTGGG         GAGAACTACGATGACCCGCACAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGGCGGCGGCGGTGGGGTG...CAGGAGAACTACGATGACCCGCACAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCCCTGCCTCCCCAGTTGTCCACATCAGGGGCCTGATTGACGGTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102557 ACCCCTGCCTCCCCAGTTGTCCACATCAGGGGCCTGATTGACGGTGTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAAGCAGACCTTGTGGAGGCCTTGCAGGAGTTTGGACCCATCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102607 GGAAGCAGACCTTGTGGAGGCCTTGCAGGAGTTTGGACCCATCAGGTA..

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    387     CTATGTGGTGGTAATGCCTAAAAAGAGACAAGCACTGGTGGAGTTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102657 .CAGCTATGTGGTGGTAATGCCTAAAAAGAGACAAGCACTGGTGGAGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGATGTGTTGGGGGCTTGCAACGCAGTGAACTACGCAGCCGACAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103923 GAAGATGTGTTGGGGGCTTGCAACGCAGTGAACTACGCAGCCGACAACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AATATACATTGCTGGTCACCCAGCTTTTGTCAACTACTCTACCAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103973 AATATACATTGCTGGTCACCCAGCTTTTGTCAACTACTCTACCAGCCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGATCTCCCGCCCTGGGGACTCGGATGACTCCCGGAGCGTGAACAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104023 AGATCTCCCGCCCTGGGGACTCGGATGACTCCCGGAGCGTGAACAGTGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTTCTCTTTACCATCCTGAACCCCATTTATTCGATCACCACG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104073 CTTCTCTTTACCATCCTGAACCCCATTTATTCGATCACCACGGTA...CA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    625  GATGTTCTTTACACTATCTGTAATCCTTGTGGCCCTGTCCAGAGAATTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104231 GGATGTTCTTTACACTATCTGTAATCCTTGTGGCCCTGTCCAGAGAATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCATTTTCAGGAAGAATGGAGTTCAGGCGATGGTGGAAT         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 104281 TCATTTTCAGGAAGAATGGAGTTCAGGCGATGGTGGAATATC...CATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACTCAGTTCAAAGTGCCCAGCGGGCCAAGGCCTCTCTCAATGGGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105867 GACTCAGTTCAAAGTGCCCAGCGGGCCAAGGCCTCTCTCAATGGGGCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TATCTATTCTGGCTGTTGCACTCTGAAGATCGAATACGCAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105917 TATCTATTCTGGCTGTTGCACTCTGAAGATCGAATACGCAAAGGTA...C

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    808   CCTACACGCTTGAATGTGTTCAAGAATGATCAGGATACTTGGGACTAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106051 AGCCTACACGCTTGAATGTGTTCAAGAATGATCAGGATACTTGGGACTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACAAACCCCAATCTCAGTGGACAAG         GTGACCCTGGCAGCAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106101 ACAAACCCCAATCTCAGTGGACAAGGTA...CAGGTGACCCTGGCAGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCCCAACAAACGCCAGAGGCAGCCCCCTCTCCTGGGAGATCACCCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109424 CCCCAACAAACGCCAGAGGCAGCCCCCTCTCCTGGGAGATCACCCCGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AATATG         GAGGGCCCCACGGTGGGTACCACAGCCATTACCAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109474 AATATGGTG...CAGGAGGGCCCCACGGTGGGTACCACAGCCATTACCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GATGAGGGCTACGGGCCCCCCCCACCTCACTACGAAGGGAGAAGGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109626 GATGAGGGCTACGGGCCCCCCCCACCTCACTACGAAGGGAGAAGGATGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TCCACCAGTGGGGGGTCACCGTCGGGGCCCAAGTCGCTACGGCCCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109676 TCCACCAGTGGGGGGTCACCGTCGGGGCCCAAGTCGCTACGGCCCCCAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGGGCACCCCCCACCCCCTCCCCCACCACCCGAGTATGGCCCTCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109726 ATGGGCACCCCCCACCCCCTCCCCCACCACCCGAGTATGGCCCTCACGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GACAGCCCTGTGCTCATGGTCTATGGCTTGGATCAATCTAAGATGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109776 GACAGCCCTGTGCTCATGGTCTATGGCTTGGATCAATCTAAGATGAACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGACCGAGTCTTCAATGTCTTCTGCTTATATGGCAATGTGGAGAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 109826 TGACCGAGTCTTCAATGTCTTCTGCTTATATGGCAATGTGGAGAAGGTG.

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234      GTGAAATTCATGAAAAGCAAGCCGGGGGCCGCCATGGTGGAGATG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109876 ..AAGGTGAAATTCATGAAAAGCAAGCCGGGGGCCGCCATGGTGGAGATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCTGATGGCTACGCTGTAGACCGGGCCATTACCCACCTCAACAACAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110997 GCTGATGGCTACGCTGTAGACCGGGCCATTACCCACCTCAACAACAACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CATGTTTGGGCAGAAGCTGAATGTCTG         TGTCTCCAAGCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 111047 CATGTTTGGGCAGAAGCTGAATGTCTGGTA...CAGTGTCTCCAAGCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CAGCCATCATGCCTGGTCAGTCATACGGGTTGGAAGACGGGTCTTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111383 CAGCCATCATGCCTGGTCAGTCATACGGGTTGGAAGACGGGTCTTGCAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TACAAAGACTTCAGTGAATCCCGGAACAATCGGTTCTCCACCCCAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111433 TACAAAGACTTCAGTGAATCCCGGAACAATCGGTTCTCCACCCCAGAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGCAGCCAAGAACCGCATCCAGCACCCCAGCAACGTGCTGCACTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111483 GGCAGCCAAGAACCGCATCCAGCACCCCAGCAACGTGCTGCACTTCTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 ACGCCCCGCTGGAGGTGACCGAGGAGAACTTCTTTGAG         ATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111533 ACGCCCCGCTGGAGGTGACCGAGGAGAACTTCTTTGAGGTG...CAGATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TGCGATGAGCTGGGAGTGAAGCGGCCATCTTCTGTGAAAGTATTCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112319 TGCGATGAGCTGGGAGTGAAGCGGCCATCTTCTGTGAAAGTATTCTCAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CAAAA         GTGAGCGCAGCTCCTCTGGACTGCTGGAGTGGGAAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112369 CAAAAGTG...CAGGTGAGCGCAGCTCCTCTGGACTGCTGGAGTGGGAAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CCAAGAGCGATGCCCTGGAGACTCTGGGCTTCCTGAACCATTACCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112524 CCAAGAGCGATGCCCTGGAGACTCTGGGCTTCCTGAACCATTACCAGATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AAAAACCCAA         ATGGTCCATACCCTTACACTCTGAAGTTGTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 112574 AAAAACCCAAGTG...CAGATGGTCCATACCCTTACACTCTGAAGTTGTG

   1850     .    :    .    :    .
   1743 TTTCTCCACTGCTCAGCACGCCTCC
        |||||||||||||||||||||||||
 113218 TTTCTCCACTGCTCAGCACGCCTCC