seq1 = pF1KB9883.tfa, 1869 bp
seq2 = pF1KB9883/gi568815597f_223293476.tfa (gi568815597f:223293476_223495344), 201869 bp

>pF1KB9883 1869
>gi568815597f:223293476_223495344 (Chr1)

1-1869  (100001-101869)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGCTTCAGCCACTTCTCCCAGCCGCCCTACCGGGATCTCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGCTTCAGCCACTTCTCCCAGCCGCCCTACCGGGATCTCTGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCCCCGCGGCCCGGCGGAGAACGAGAGTCCACGCAGCGGCTGGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCCCCGCGGCCCGGCGGAGAACGAGAGTCCACGCAGCGGCTGGGCGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGGTCCGGAGCCGACTCCACCGCGTGCTCCCGGGCCGGGACTCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAGGTCCGGAGCCGACTCCACCGCGTGCTCCCGGGCCGGGACTCCGGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGGAGAGCGAAGCTGGGGCGTGCTGGCTGCACCCGCACTGTTCGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGGAGAGCGAAGCTGGGGCGTGCTGGCTGCACCCGCACTGTTCGTTCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGCGGCCTCGCAGGCGCGGGTGCTCAGATTCACTGCGGGGCAGCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCGCGGCCTCGCAGGCGCGGGTGCTCAGATTCACTGCGGGGCAGCCGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTGAGCGATGTGGCCCGCAGGCCCCTGGAACGTTCCAGGAAGCACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTGAGCGATGTGGCCCGCAGGCCCCTGGAACGTTCCAGGAAGCACCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCCGCAGCAGGCGCCTGGAAGATGCCTGGGGAGAGACAGGAACCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCCGCAGCAGGCGCCTGGAAGATGCCTGGGGAGAGACAGGAACCAAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGCCCGGCTTGGCAGCCGCAGACCCAGCTGCCACCCCAGCGGCCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCGCCCGGCTTGGCAGCCGCAGACCCAGCTGCCACCCCAGCGGCCGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTGCCCGCATTACCCTCTGGCCCAGGGAGACTCGCCCCCGCCTTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTGCCCGCATTACCCTCTGGCCCAGGGAGACTCGCCCCCGCCTTGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGAGGAGCTGGCACTCCCCTGAGTGGCACATTCAGGGTAGAAAAGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGAGGAGCTGGCACTCCCCTGAGTGGCACATTCAGGGTAGAAAAGGCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGTGGAGACCAGTGGGCAGTGCCACTCGGCAGACATCTAGGTCGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGTGGAGACCAGTGGGCAGTGCCACTCGGCAGACATCTAGGTCGCTGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCCTTCCTCAGTTCCCTCGGAGCGGTCTTCTGTGCCCTCGCAAAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCCTTCCTCAGTTCCCTCGGAGCGGTCTTCTGTGCCCTCGCAAAAGTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGAGGCACTCAGCCTGCGTGTGCGCCCAGAAGAGAGACAGCAGCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGAGGCACTCAGCCTGCGTGTGCGCCCAGAAGAGAGACAGCAGCGACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTTGAGTCATTAGCCAGCCGGGACTCCCAGCCCTTGGCCTCCAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTTGAGTCATTAGCCAGCCGGGACTCCCAGCCCTTGGCCTCCAGCAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGATGCGGAGCCCGCACACCCAGGTCCTGAAGAGCAAGCTGGAAGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGATGCGGAGCCCGCACACCCAGGTCCTGAAGAGCAAGCTGGAAGAGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGGTGTCCTCCCAGGACCAGCAGATTGTGGCCCTGGTGCTGACCCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGGTGTCCTCCCAGGACCAGCAGATTGTGGCCCTGGTGCTGACCCGTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAGAAGGCCCAGAGGATACGGGAGCTGCAGCAGCAGGCGGCTAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAAGAAGGCCCAGAGGATACGGGAGCTGCAGCAGCAGGCGGCTAAGGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGGAGGAGCTGAAGCGCTCGGATCAGAAGGTCCAGATGACCCTGGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGGAGGAGCTGAAGCGCTCGGATCAGAAGGTCCAGATGACCCTGGAGCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGCGCCGGCTGCTGCTGCGGCAGAGCCAGGAGCAGTGGCAGGAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGCGCCGGCTGCTGCTGCGGCAGAGCCAGGAGCAGTGGCAGGAGAAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCAGCGCAAGACCCTCCAGAGCCCTGAGCAGCGCGGCCTGCGGCGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCAGCGCAAGACCCTCCAGAGCCCTGAGCAGCGCGGCCTGCGGCGGGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCCAGAGGAAGAACGTGCCCCCGGGGGAAAGCCGGTGGAAGGAGCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCCAGAGGAAGAACGTGCCCCCGGGGGAAAGCCGGTGGAAGGAGCAACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGGACCAGGAGAGCCCGCGCCAGGAGAAGCTGGAGAAGGCGCGCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGGACCAGGAGAGCCCGCGCCAGGAGAAGCTGGAGAAGGCGCGCGCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCAGAGCACCGAAAACAGTGCCAGGTGCGGCGCCTGCGGGAGCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCAGAGCACCGAAAACAGTGCCAGGTGCGGCGCCTGCGGGAGCAGGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGATGCTACGGAACCTCCGGGAGCAGCACAGCCTGCAGCTGCAGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGATGCTACGGAACCTCCGGGAGCAGCACAGCCTGCAGCTGCAGAGGAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CTGGTGGAAGCCTGTCGCAAGAGGCACCTACATGCCGTGGAGGGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CTGGTGGAAGCCTGTCGCAAGAGGCACCTACATGCCGTGGAGGGCCAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GAAGGTCCAGGACACCAACCTGAGCTCCCTCATCAATTACCAGGCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GAAGGTCCAGGACACCAACCTGAGCTCCCTCATCAATTACCAGGCCCGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGGTCCTCATGGACTGCCAGGCCAAGGCTGAGGAGCTCCTTAGGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGGTCCTCATGGACTGCCAGGCCAAGGCTGAGGAGCTCCTTAGGCAGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCCCTGGAACAAAGTTTCCAGCGGTCCCAGGAGATACACCAGGGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCCCTGGAACAAAGTTTCCAGCGGTCCCAGGAGATACACCAGGGCCTGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GAAGGAGCGGCAACGCGAGCTGAGGGAGAAGGCCCAGAAGGAGGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GAAGGAGCGGCAACGCGAGCTGAGGGAGAAGGCCCAGAAGGAGGAAGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGTTGCAGCAGGCCAGGTGGCGCGCAGGGGAGTCAGAGGAACAGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGTTGCAGCAGGCCAGGTGGCGCGCAGGGGAGTCAGAGGAACAGAGGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ATGCGCAAAAGAATTCTGGTGGAGCTGGCGGATGAGAAGATCCGACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ATGCGCAAAAGAATTCTGGTGGAGCTGGCGGATGAGAAGATCCGACAGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CAGGAGTCACGTGCACAAGACCACTAGGGACAAGGTGCAGCACCTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CAGGAGTCACGTGCACAAGACCACTAGGGACAAGGTGCAGCACCTCCGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGCTCAACCACCTGAGGGAGAAAAACCACCACATCCTGAAACTGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AGCTCAACCACCTGAGGGAGAAAAACCACCACATCCTGAAACTGAAAGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GAGAAGGAGGAAAAGTGTCACATTGAGGGCATCAAGGAGGCCATTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GAGAAGGAGGAAAAGTGTCACATTGAGGGCATCAAGGAGGCCATTAAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 AAAGGAGCAGAGGGTGCAGCACATTTCCCAAGGGAAAGACCCAAACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 AAAGGAGCAGAGGGTGCAGCACATTTCCCAAGGGAAAGACCCAAACTTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AGGAGTTCCAGAAGCTCCCTCAGGCCTCCAGGAGAGAGGAGAGAGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AGGAGTTCCAGAAGCTCCCTCAGGCCTCCAGGAGAGAGGAGAGAGCGCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CCCAACAGCTCCCTTGATCAGATGGTACTAGAGGCCCAGCTCCGTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CCCAACAGCTCCCTTGATCAGATGGTACTAGAGGCCCAGCTCCGTGCCTG

   1850     .    :    .
   1851 TCAGCAGAACAGGGGTTAC
        |||||||||||||||||||
 101851 TCAGCAGAACAGGGGTTAC