seq1 = pF1KB9881.tfa, 1797 bp
seq2 = pF1KB9881/gi568815578r_3684687.tfa (gi568815578r:3684687_3886483), 201797 bp

>pF1KB9881 1797
>gi568815578r:3684687_3886483 (Chr20)

(complement)

1-1797  (100001-101797)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCCCAAGAGGCGACAGCTGACGTTCCGGGAGAAGTCACGGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCCCAAGAGGCGACAGCTGACGTTCCGGGAGAAGTCACGGATCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGAGGTGGAGGAGAATCCGGACCTGCGCAAGGGCGAGATCGCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGAGGTGGAGGAGAATCCGGACCTGCGCAAGGGCGAGATCGCGCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCAACATCCCGCCGTCCACGCTGAGCACGATCCTGAAGAACAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTCAACATCCCGCCGTCCACGCTGAGCACGATCCTGAAGAACAAGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCATCCTGGCGTCGGAGCGCAAGTACGGGGTGGCCTCCACCTGCCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCATCCTGGCGTCGGAGCGCAAGTACGGGGTGGCCTCCACCTGCCGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACCAACAAGCTGTCTCCCTACGACAAGCTCGAGGGCTTGCTCATCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACCAACAAGCTGTCTCCCTACGACAAGCTCGAGGGCTTGCTCATCGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGTTCCAGCAGATCCGCGCCGCCGGCCTGCCGGTCAAGGGCATCATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGTTCCAGCAGATCCGCGCCGCCGGCCTGCCGGTCAAGGGCATCATCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGGAGAAGGCGCTGCGCATAGCCGAGGAGCTGGGCATGGACGACTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGGAGAAGGCGCTGCGCATAGCCGAGGAGCTGGGCATGGACGACTTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCCTCCAACGGCTGGCTGGACCGCTTCCGCCGGCGCCACGGCGTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCCTCCAACGGCTGGCTGGACCGCTTCCGCCGGCGCCACGGCGTGGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTGCAGCGGCGTGGCCCGCGCCCGCGCGCGAAACGCTGCCCCCCGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTGCAGCGGCGTGGCCCGCGCCCGCGCGCGAAACGCTGCCCCCCGCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCGGCGGCGCCTGCCAGTCCGGCCGCGGTGCCCTCGGAGGGCAGTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCGGCGGCGCCTGCCAGTCCGGCCGCGGTGCCCTCGGAGGGCAGTGGCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGCACTACTGGTTGGCGCGCTCGGGAGGAGCAGCCGCCGTCGGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAGCACTACTGGTTGGCGCGCTCGGGAGGAGCAGCCGCCGTCGGTGGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGGCTACGCCTCGCAGGACGTGTTCAGCGCCACCGAGACCAGTCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGGCTACGCCTCGCAGGACGTGTTCAGCGCCACCGAGACCAGTCTATGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TACGACTTCCTGCCCGACCAGGCCGCGGGGCTGTGCGGAGGCGACGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TACGACTTCCTGCCCGACCAGGCCGCGGGGCTGTGCGGAGGCGACGGACG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCCGCGTCAAGCCACCCAGCGCCTGAGCGTCCTGCTATGCGCCAATGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCCGCGTCAAGCCACCCAGCGCCTGAGCGTCCTGCTATGCGCCAATGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACGGCAGCGAGAAGCTGCCCCCGCTGGTGGCCGGCAAGTCGGCCAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACGGCAGCGAGAAGCTGCCCCCGCTGGTGGCCGGCAAGTCGGCCAAGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGCGCAGGCCAAGCCGGCCTGCCCTGCGACTACACCGCCAACTCCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGCGCAGGCCAAGCCGGCCTGCCCTGCGACTACACCGCCAACTCCAAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGTGTCACCACCCAGGCCCTGGCCAAGTACTTGAAGGCCTTGGACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGTGTCACCACCCAGGCCCTGGCCAAGTACTTGAAGGCCTTGGACACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GAATGGCTGCAGAGTCTCGCCGGGTCCTGCTGTTGGCCGGCCGCTTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GAATGGCTGCAGAGTCTCGCCGGGTCCTGCTGTTGGCCGGCCGCTTGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCCAGTCCTTGGACACCTCGGGCCTGCGGCATGTGCAGCTGGCCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCCAGTCCTTGGACACCTCGGGCCTGCGGCATGTGCAGCTGGCCTTCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCCTCCCGGCACCGTGCATCCGCTGGAGAGGGGAGTGGTCCAGCAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCCTCCCGGCACCGTGCATCCGCTGGAGAGGGGAGTGGTCCAGCAGGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGGCCACTACCGCCAGGCCATGCTGCTCAAGGCCATGGCCGCGCTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGGCCACTACCGCCAGGCCATGCTGCTCAAGGCCATGGCCGCGCTAGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGCCAGGATCCCTCAGGCCTGCAGCTGGGTCTCACGGAGGCCCTGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGCCAGGATCCCTCAGGCCTGCAGCTGGGTCTCACGGAGGCCCTGCACTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGTGGCTGCCGCCTGGCAGGCAGTGGAGCCTTCGGACATAGCCGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGTGGCTGCCGCCTGGCAGGCAGTGGAGCCTTCGGACATAGCCGCCTGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTCGTGAGGCTGGCTTTGGGGGTGGCCCTAATGCCACCATCACCACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTCGTGAGGCTGGCTTTGGGGGTGGCCCTAATGCCACCATCACCACTTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CTCAAGAGTGAGGGAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CTCAAGAGTGAGGGAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGAAGAGGGTGAAGGAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGGGGAGGAGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGAAGAGGGTGAAGGAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGGGGAGGAGGAGGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGGAAGGGGGGGAAGGAGAGGAATTGGGGGAGGAAGAGGAGGTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGGAAGGGGGGGAAGGAGAGGAATTGGGGGAGGAAGAGGAGGTGGAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GAGGGTGATGTTGATAGTGATGAAGAAGAGGAGGAAGATGAGGAGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GAGGGTGATGTTGATAGTGATGAAGAAGAGGAGGAAGATGAGGAGAGCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTCGGAGGGCTTGGAGGCTGAGGACTGGGCCCAGGGAGTAGTGGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CTCGGAGGGCTTGGAGGCTGAGGACTGGGCCCAGGGAGTAGTGGAGGCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GTGGCAGCTTCGGGGCTTATGGTGCCCAGGAGGAAGCCCAGTGCCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GTGGCAGCTTCGGGGCTTATGGTGCCCAGGAGGAAGCCCAGTGCCCTACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTGCATTTCCTGGAAGGTGGGGAGGACTCTGATTCAGACAGTGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTGCATTTCCTGGAAGGTGGGGAGGACTCTGATTCAGACAGTGAGGAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGACGATGAGGAAGAGGATGATGAAGATGAAGACGACGATGATGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGACGATGAGGAAGAGGATGATGAAGATGAAGACGACGATGATGATGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGGATGGTGATGAGGTGCCTGTACCCAGCTTTGGGGAGGCCATGGCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AGGATGGTGATGAGGTGCCTGTACCCAGCTTTGGGGAGGCCATGGCTTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TTTGCCATGGTCAAGAGGTACCTGACCTCCTTCCCCATTGATGACCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TTTGCCATGGTCAAGAGGTACCTGACCTCCTTCCCCATTGATGACCGCGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GCAGAGCCACATCCTCCACTTGGAACACGATCTGGTTCATGTGACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GCAGAGCCACATCCTCCACTTGGAACACGATCTGGTTCATGTGACCAGGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1751 AGAACCACGCCAGGCAGGCGGGAGTTCGAGGTCTTGGACATCAAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AGAACCACGCCAGGCAGGCGGGAGTTCGAGGTCTTGGACATCAAAGC