seq1 = pF1KB9879.tfa, 1752 bp
seq2 = pF1KB9879/gi568815579r_45784023.tfa (gi568815579r:45784023_45985774), 201752 bp

>pF1KB9879 1752
>gi568815579r:45784023_45985774 (Chr19)

(complement)

1-1752  (100001-101752)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCTGTGCAGGCGTCCCGCCGCCAGTGGTGCTACCTGTGCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCTGTGCAGGCGTCCCGCCGCCAGTGGTGCTACCTGTGCGACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCAAGATGCCGTGGGCCATGGTGTGGGACTTCAGCGAGGCCGTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCAAGATGCCGTGGGCCATGGTGTGGGACTTCAGCGAGGCCGTGTGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGCTGCGTGAACTTCGAGGGCGCGGACCGCATCGAACTGCTCATCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGCTGCGTGAACTTCGAGGGCGCGGACCGCATCGAACTGCTCATCGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGCCCGCCAGCTCAAGCGCAGCCACGTGCTCCCCGAGGGCCGCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGCCCGCCAGCTCAAGCGCAGCCACGTGCTCCCCGAGGGCCGCTCGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGGCCCCCGGCCCTTAAGCACCCGGCCACCAAGGACCTGGCGGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGGCCCCCGGCCCTTAAGCACCCGGCCACCAAGGACCTGGCGGCGGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGCACAGGGGCCCCAGCTGCCGCCCCCGCAGGCCCAGCCCCAGCCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGCACAGGGGCCCCAGCTGCCGCCCCCGCAGGCCCAGCCCCAGCCGTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGACCGGCGGCGGCGTGTCGGGCCAGGACCGCTATGACAGGGCCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGACCGGCGGCGGCGTGTCGGGCCAGGACCGCTATGACAGGGCCACATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATCAGGCCGCCTCCCCCTGCCCTCGCCCGCCCTGGAGTACACTCTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATCAGGCCGCCTCCCCCTGCCCTCGCCCGCCCTGGAGTACACTCTGGGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCGCCTGGCCAATGGGCTGGGCCGTGAGGAGGCCGTGGCTGAGGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCGCCTGGCCAATGGGCTGGGCCGTGAGGAGGCCGTGGCTGAGGGGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGAAGGGCCTTGCTTGGCTCCATGCCTGGCTTGATGCCCCCTGGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGAAGGGCCTTGCTTGGCTCCATGCCTGGCTTGATGCCCCCTGGGCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCAGCTGCAGTGTCTGGCCTGGGAAGCCGAGGCCTGACGCTGGCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCAGCTGCAGTGTCTGGCCTGGGAAGCCGAGGCCTGACGCTGGCACCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTTGAGTCCTGCCCGTCCCCTCTTCGGCTCCGATTTCGAGAAAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTTGAGTCCTGCCCGTCCCCTCTTCGGCTCCGATTTCGAGAAAGAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGCAGAGGAATGCGGACTGTCTGGCAGAACTGAACGAGGCCATGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAGCAGAGGAATGCGGACTGTCTGGCAGAACTGAACGAGGCCATGCGAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCGGGCAGAGGAATGGCACGGGCGCCCCAAAGCAGTGCGGGAACAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCGGGCAGAGGAATGGCACGGGCGCCCCAAAGCAGTGCGGGAACAGCTAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGCGCTGTCCGCCTGCGCCCCGTTCAATGTGCGCTTCAAGAAGGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGCGCTGTCCGCCTGCGCCCCGTTCAATGTGCGCTTCAAGAAGGATCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGCTGGTGGGGCGAGTGTTCGCCTTCGATGCTACTGCCCGTCCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGCTGGTGGGGCGAGTGTTCGCCTTCGATGCTACTGCCCGTCCTCCAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATACGAGTTCGAGCTGAAGCTCTTCACCGAATACCCCTGTGGTTCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATACGAGTTCGAGCTGAAGCTCTTCACCGAATACCCCTGTGGTTCCGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGTGTACGCCGGCGTCCTGGCAGTGGCTCGCCAGATGTTCCACGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGTGTACGCCGGCGTCCTGGCAGTGGCTCGCCAGATGTTCCACGATGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGCGGGAGCCGGGCAAGGCACTGGCTTCTTCGGGCTTCAAGTACCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGCGGGAGCCGGGCAAGGCACTGGCTTCTTCGGGCTTCAAGTACCTCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ATATGAACGCCGGCATGGATCAGGAGAATGGCGGCAGCTGGGCGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ATATGAACGCCGGCATGGATCAGGAGAATGGCGGCAGCTGGGCGAGCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTACCGACGGCGTCCGCAGCTTCCGCGAGCCAGCTCCCGCGGAGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTACCGACGGCGTCCGCAGCTTCCGCGAGCCAGCTCCCGCGGAGGCCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CCCCAGCAGTACCCAGAGCCGGCCCCTGCGGCTCTCTGTGGCCCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CCCCAGCAGTACCCAGAGCCGGCCCCTGCGGCTCTCTGTGGCCCACCCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCGAGCCCCATCCCGGAACCTGGCGCCCACGCCGCGCCGTCGCAAGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCGAGCCCCATCCCGGAACCTGGCGCCCACGCCGCGCCGTCGCAAGGCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCCCCGAGCCGGAGGGCGAGGCGGCTGGGAAGATGACCACCGAGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CCCCCGAGCCGGAGGGCGAGGCGGCTGGGAAGATGACCACCGAGGAGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CAGCAACGGCACTGGGTGGCACCCGGCGGCCCGTACTCCGCTGAGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CAGCAACGGCACTGGGTGGCACCCGGCGGCCCGTACTCCGCTGAGACCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGGTGTGCCCTCGCCCATTGCCGCCCTGAAGAATGTGGCCGAAGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGGTGTGCCCTCGCCCATTGCCGCCCTGAAGAATGTGGCCGAAGCCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCCACTCACCCAAGGACCCTGGCGGAGGCGGGGGGCCTGTGCGTGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GCCACTCACCCAAGGACCCTGGCGGAGGCGGGGGGCCTGTGCGTGCAGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGCGCCAGCCCTGCAGCCTCCTCCACGGCCCAGCCGCCAACCCAGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGCGCCAGCCCTGCAGCCTCCTCCACGGCCCAGCCGCCAACCCAGCATCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CCTTGTGGCCCGCAACGGCGAAGCAGAAGTCAGTCCCACAGCGGGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CCTTGTGGCCCGCAACGGCGAAGCAGAAGTCAGTCCCACAGCGGGGGCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AAGCTGTCAGCGGGGGTGGCAGCGGCACTGGGGCGACCCCTGGGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AAGCTGTCAGCGGGGGTGGCAGCGGCACTGGGGCGACCCCTGGGGCCCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTGTGCTGTACCCTGTGCAGGGAGCGGCTAGAAGACACCCACTTCGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTGTGCTGTACCCTGTGCAGGGAGCGGCTAGAAGACACCCACTTCGTCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GTGCCCCTCGGTGCCCGGACACAAGTTCTGCTTTCCCTGCTCCCGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GTGCCCCTCGGTGCCCGGACACAAGTTCTGCTTTCCCTGCTCCCGGGAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TCATCAAGGCGCAGGGCCCGGCCGGGGAGGTGTACTGCCCGAGCGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TCATCAAGGCGCAGGGCCCGGCCGGGGAGGTGTACTGCCCGAGCGGAGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AAGTGCCCGCTGGTCGGCTCCTCCGTGCCCTGGGCCTTCATGCAGGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AAGTGCCCGCTGGTCGGCTCCTCCGTGCCCTGGGCCTTCATGCAGGGCGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GATCGCCACCATCCTTGCTGGAGACATCAAAGTTAAGAAAGAACGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GATCGCCACCATCCTTGCTGGAGACATCAAAGTTAAGAAAGAACGGGACC

   1750 
   1751 CC
        ||
 101751 CC