seq1 = pF1KB9855.tfa, 1170 bp
seq2 = pF1KB9855/gi568815587r_17286922.tfa (gi568815587r:17286922_17488091), 201170 bp

>pF1KB9855 1170
>gi568815587r:17286922_17488091 (Chr11)

(complement)

1-1170  (100001-101170)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGTCCCGCAAGGGCATCATCCCCGAGGAATACGTGCTGACACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGTCCCGCAAGGGCATCATCCCCGAGGAATACGTGCTGACACGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCAGAGGACCCTGCCGAGCCCAGGTACCGTGCCCGCCAGCGGAGGGCCC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCAGAGGACCCTGCCAAGCCCAGGTACCGTGCCCGCCAGCGGAGGGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTTGTGTCCAAGAAAGGCAACTGCAACGTGGCCCACAAGAACATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTTGTGTCCAAGAAAGGCAACTGCAACGTGGCCCACAAGAACATCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCAGGGCCGCTTCCTGCAGGACGTGTTCACCACGCTGGTGGACCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCAGGGCCGCTTCCTGCAGGACGTGTTCACCACGCTGGTGGACCTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGGCCACACACATTGCTCATCTTCACCATGTCCTTCCTGTGCAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTGGCCACACACATTGCTCATCTTCACCATGTCCTTCCTGTGCAGCTGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTCTTCGCCATGGCCTGGTGGCTCATCGCCTTCGCCCACGGTGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTCTTCGCCATGGCCTGGTGGCTCATCGCCTTCGCCCACGGTGACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCCCCAGCGAGGGCACTGCTGAGCCCTGTGTCACCAGCATCCACTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCCCCAGCGAGGGCACTGCTGAGCCCTGTGTCACCAGCATCCACTCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCGTCTGCCTTCCTTTTCTCCATTGAGGTCCAAGTGACTATTGGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCGTCTGCCTTCCTTTTCTCCATTGAGGTCCAAGTGACTATTGGCTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGGGCGCATGGTGACTGAGGAGTGCCCACTGGCCATCCTGATCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGGGCGCATGGTGACTGAGGAGTGCCCACTGGCCATCCTGATCCTCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGCAGAACATCGTGGGGCTCATGATCAACGCCATCATGCTTGGCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGCAGAACATCGTGGGGCTCATGATCAACGCCATCATGCTTGGCTGCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCATGAAGACTGCCCAAGCCCACCGCAGGGCTGAGACCCTCATCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCATGAAGACTGCCCAAGCCCACCGCAGGGCTGAGACCCTCATCTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAAGCATGCGGTGATCGCCCTGCGCCACGGCCGCCTCTGCTTCATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAAGCATGCGGTGATCGCCCTGCGCCACGGCCGCCTCTGCTTCATGCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGTGTGGGTGACCTCCGCAAGAGCATGATCATCAGCGCCACCATCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGTGTGGGTGACCTCCGCAAGAGCATGATCATCAGCGCCACCATCCACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCAGGTGGTACGCAAGACCACCAGCCCCGAGGGCGAGGTGGTGCCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCAGGTGGTACGCAAGACCACCAGCCCCGAGGGCGAGGTGGTGCCCCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCAGGTGGACATCCCCATGGAGAACGGCGTGGGTGGCAACAGCATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCAGGTGGACATCCCCATGGAGAACGGCGTGGGTGGCAACAGCATCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGGTGGCCCCGCTGATCATCTACCATGTCATTGATGCCAACAGCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGGTGGCCCCGCTGATCATCTACCATGTCATTGATGCCAACAGCCCACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTACGACCTGGCACCCAGCGACCTGCACCACCACCAGGACCTCGAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTACGACCTGGCACCCAGCGACCTGCACCACCACCAGGACCTCGAGATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCGTCATCCTGGAAGGCGTGGTGGAAACCACGGGCATCACCACCCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCGTCATCCTGGAAGGCGTGGTGGAAACCACGGGCATCACCACCCAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGCACCTCCTACCTGGCCGATGAGATCCTGTGGGGCCAGCGCTTTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGCACCTCCTACCTGGCCGATGAGATCCTGTGGGGCCAGCGCTTTGTGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CATTGTAGCTGAGGAGGACGGACGTTACTCTGTGGACTACTCCAAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CATTGTAGCTGAGGAGGACGGACGTTACTCTGTGGACTACTCCAAGTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCAACACCATCAAAGTGCCCACACCACTCTGCACGGCCCGCCAGCTTGAT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCAACACCGTCAAAGTGCCCACACCACTCTGCACGGCCCGCCAGCTTGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGGACCACAGCCTACTGGAAGCTCTGACCCTCGCCTCAGCCCGCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGGACCACAGCCTACTGGAAGCTCTGACCCTCGCCTCAGCCCGCGGGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCTGCGCAAGCGCAGCGTGCCCATGGCCAAGGCCAAGCCCAAGTTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCTGCGCAAGCGCAGCGTGCCCATGGCCAAGGCCAAGCCCAAGTTCAGCA

   1150     .    :    .    :
   1151 TCTCTCCAGATTCCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||
 101151 TCTCTCCAGATTCCCTGTCC