seq1 = pF1KB9835.tfa, 1050 bp
seq2 = pF1KB9835/gi568815596r_218064162.tfa (gi568815596r:218064162_218265211), 201050 bp

>pF1KB9835 1050
>gi568815596r:218064162_218265211 (Chr2)

(complement)

1-1050  (100001-101050)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAAATATTACAGATCCACAGATGTGGGATTTTGATGATCTAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAAATATTACAGATCCACAGATGTGGGATTTTGATGATCTAAATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTGGCATGCCACCTGCAGATGAAGATTACAGCCCCTGTATGCTAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTGGCATGCCACCTGCAGATGAAGATTACAGCCCCTGTATGCTAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAGACACTCAACAAGTATGTTGTGATCATCGCCTATGCCCTAGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAGACACTCAACAAGTATGTTGTGATCATCGCCTATGCCCTAGTGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTGAGCCTGCTGGGAAACTCCCTGGTGATGCTGGTCATCTTATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTGAGCCTGCTGGGAAACTCCCTGGTGATGCTGGTCATCTTATACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGGGTCGGCCGCTCCGTCACTGATGTCTACCTGCTGAACCTGGCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGGTCGGCCGCTCCGTCACTGATGTCTACCTGCTGAACCTGGCCTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGACCTACTCTTTGCCCTGACCTTGCCCATCTGGGCCGCCTCCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGACCTACTCTTTGCCCTGACCTTGCCCATCTGGGCCGCCTCCAAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATGGCTGGATTTTTGGCACATTCCTGTGCAAGGTGGTCTCACTCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATGGCTGGATTTTTGGCACATTCCTGTGCAAGGTGGTCTCACTCCTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAAGTCAACTTCTACAGTGGCATCCTGCTGTTGGCCTGCATCAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAAGTCAACTTCTACAGTGGCATCCTGCTGTTGGCCTGCATCAGTGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCGTTACCTGGCCATTGTCCATGCCACACGCACACTGACCCAGAAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCGTTACCTGGCCATTGTCCATGCCACACGCACACTGACCCAGAAGCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACTTGGTCAAGTTTGTTTGTCTTGGCTGCTGGGGACTGTCTATGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACTTGGTCAAGTTTGTTTGTCTTGGCTGCTGGGGACTGTCTATGAATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTCCCTGCCCTTCTTCCTTTTCCGCCAGGCTTACCATCCAAACAATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTCCCTGCCCTTCTTCCTTTTCCGCCAGGCTTACCATCCAAACAATTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTCCAGTTTGCTATGAGGTCCTGGGAAATGACACAGCAAAATGGCGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTCCAGTTTGCTATGAGGTCCTGGGAAATGACACAGCAAAATGGCGGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGTTGCGGATCCTGCCTCACACCTTTGGCTTCATCGTGCCGCTGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGTTGCGGATCCTGCCTCACACCTTTGGCTTCATCGTGCCGCTGTTTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATGCTGTTCTGCTATGGATTCACCCTGCGTACACTGTTTAAGGCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATGCTGTTCTGCTATGGATTCACCCTGCGTACACTGTTTAAGGCCCACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGGGCAGAAGCACCGAGCCATGAGGGTCATCTTTGCTGTCGTCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGGGCAGAAGCACCGAGCCATGAGGGTCATCTTTGCTGTCGTCCTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCCTGCTTTGCTGGCTGCCCTACAACCTGGTCCTGCTGGCAGACACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCCTGCTTTGCTGGCTGCCCTACAACCTGGTCCTGCTGGCAGACACCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATGAGGACCCAGGTGATCCAGGAGAGCTGTGAGCGCCGCAACAACATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATGAGGACCCAGGTGATCCAGGAGAGCTGTGAGCGCCGCAACAACATCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCGGGCCCTGGATGCCACTGAGATTCTGGGATTTCTCCATAGCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCGGGCCCTGGATGCCACTGAGATTCTGGGATTTCTCCATAGCTGCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACCCCATCATCTACGCCTTCATCGGCCAAAATTTTCGCCATGGATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACCCCATCATCTACGCCTTCATCGGCCAAAATTTTCGCCATGGATTCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAGATCCTGGCTATGCATGGCCTGGTCAGCAAGGAGTTCTTGGCACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAGATCCTGGCTATGCATGGCCTGGTCAGCAAGGAGTTCTTGGCACGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATCGTGTTACCTCCTACACTTCTTCGTCTGTCAATGTCTCTTCCAACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATCGTGTTACCTCCTACACTTCTTCGTCTGTCAATGTCTCTTCCAACCTC