seq1 = pF1KB9825.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KB9825/gi568815575f_151823665.tfa (gi568815575f:151823665_152024615), 200951 bp

>pF1KB9825 951
>gi568815575f:151823665_152024615 (ChrX)

1-951  (100001-100951)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTCTGAGCAGAAGAGTCAGCACTGCAAGCCTGAGGAAGGCGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTTCTGAGCAGAAGAGTCAGCACTGCAAGCCTGAGGAAGGCGTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCAAGAAGAGGCCCTGGGCCTGGTGGGTGCGCAGGCTCCTACTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100051 GGCCCAAGAAGAGGCCCTGGGCCTGGTGGGTGCACAGGCTCCTACTACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGCAGGAGGCTGCTGTCTCCTCCTCCTCTCCTCTGGTCCCTGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGCAGGAGGCTGCTGTCTCCTCCTCCTCTCCTCTGGTCCCTGGCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGAGGAAGTGCCTGCTGCTGAGTCAGCAGGTCCTCCCCAGAGTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGAGGAAGTGCCTGCTGCTGAGTCAGCAGGTCCTCCCCAGAGTCCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGAGCCTCTGCCTTACCCACTACCATCAGCTTCACTTGCTGGAGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGAGCCTCTGCCTTACCCACTACCATCAGCTTCACTTGCTGGAGGCAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAATGAGGGTTCCAGCAGCCAAGAAGAGGAGGGGCCAAGCACCTCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAATGAGGGTTCCAGCAGCCAAGAAGAGGAGGGGCCAAGCACCTCGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACGCAGAGTCCTTGTTCCGAGAAGCACTCAGTAACAAGGTGGATGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACGCAGAGTCCTTGTTCCGAGAAGCACTCAGTAACAAGGTGGATGAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCTCATTTTCTGCTCCGCAAGTATCGAGCCAAGGAGCTGGTCACAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCTCATTTTCTGCTCCGCAAGTATCGAGCCAAGGAGCTGGTCACAAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGAAATGCTGGAGAGAGTCATCAAAAATTACAAGCGCTGCTTTCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGAAATGCTGGAGAGAGTCATCAAAAATTACAAGCGCTGCTTTCCTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCTTCGGCAAAGCCTCCGAGTCCCTGAAGATGATCTTTGGCATTGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCTTCGGCAAAGCCTCCGAGTCCCTGAAGATGATCTTTGGCATTGACGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAGGAAGTGGACCCCACCAGCAACACCTACACCCTTGTCACCTGCCTGG
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAGGAAGTGGACCCCGCCAGCAACACCTACACCCTTGTCACCTGCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCTTTCCTATGATGGCCTGCTGGGTAATAATCAGATCTTTCCCAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCTTTCCTATGATGGCCTGCTGGGTAATAATCAGATCTTTCCCAAGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCCTTCTGATAATCGTCCTGGGCACAATTGCAATGGAGGGCGACAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCCTTCTGATAATCGTCCTGGGCACAATTGCAATGGAGGGCGACAGCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCTGAGGAGGAAATCTGGGAGGAGCTGGGTGTGATGGGGGTGTATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCTGAGGAGGAAATCTGGGAGGAGCTGGGTGTGATGGGGGTGTATGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAGGGAGCACACTGTCTATGGGGAGCCCAGGAAACTGCTCACCCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAGGGAGCACACTGTCTATGGGGAGCCCAGGAAACTGCTCACCCAAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGGGTGCAGGAAAACTACCTGGAGTACCGGCAGGTACCCGGCAGTAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGGGTGCAGGAAAACTACCTGGAGTACCGGCAGGTACCCGGCAGTAATCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGCGCGCTATGAGTTCCTGTGGGGTCCAAGGGCTCTGGCTGAAACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGCGCGCTATGAGTTCCTGTGGGGTCCAAGGGCTCTGGCTGAAACCAGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGTGAAAGTCCTGGAGCATGTGGTCAGGGTCAATGCAAGAGTTCGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGTGAAAGTCCTGGAGCATGTGGTCAGGGTCAATGCAAGAGTTCGCATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCTACCCATCCCTGCGTGAAGCAGCTTTGTTAGAGGAGGAAGAGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCTACCCATCCCTGCGTGAAGCAGCTTTGTTAGAGGAGGAAGAGGGAGT

    950 
    951 C
        |
 100951 C