seq1 = pF1KB9810.tfa, 741 bp
seq2 = pF1KB9810/gi568815587r_27557824.tfa (gi568815587r:27557824_27758564), 200741 bp

>pF1KB9810 741
>gi568815587r:27557824_27758564 (Chr11)

(complement)

1-741  (100001-100741)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCATCCTTTTCCTTACTATGGTTATTTCATACTTTGGTTGCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCATCCTTTTCCTTACTATGGTTATTTCATACTTTGGTTGCATGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGCCCCCATGAAAGAAGCAAACATCCGAGGACAAGGTGGCTTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGCCCCCATGAAAGAAGCAAACATCCGAGGACAAGGTGGCTTGGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCCAGGTGTGCGGACCCATGGGACTCTGGAGAGCGTGAATGGGCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCCAGGTGTGCGGACCCATGGGACTCTGGAGAGCGTGAATGGGCCCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGGTTCAAGAGGCTTGACATCATTGGCTGACACTTTCGAACACGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCAGGTTCAAGAGGCTTGACATCATTGGCTGACACTTTCGAACACGTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAAGAGCTGTTGGATGAGGACCAGAAAGTTCGGCCCAATGAAGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGAAGAGCTGTTGGATGAGGACCAGAAAGTTCGGCCCAATGAAGAAAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATAAGGACGCAGACTTGTACACGTCCAGGGTGATGCTCAGTAGTCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATAAGGACGCAGACTTGTACACGTCCAGGGTGATGCTCAGTAGTCAAGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTTTGGAGCCTCCTCTTCTCTTTCTGCTGGAGGAATACAAAAATTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCTTTGGAGCCTCCTCTTCTCTTTCTGCTGGAGGAATACAAAAATTACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGATGCTGCAAACATGTCCATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGATGCTGCAAACATGTCCATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCTGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCGAGGGGAGCTGAGCGTGTGTGACAGTATTAGTGAGTGGGTAACGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCGAGGGGAGCTGAGCGTGTGTGACAGTATTAGTGAGTGGGTAACGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCAGACAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCGGGCGGGACGGTCACAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAGACAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCGGGCGGGACGGTCACAGTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGAAAAGGTCCCTGTATCAAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGAAAAGGTCCCTGTATCAAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTACGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCAAGTGCAATCCCATGGGTTACACAAAAGAAGGCTGCAGGGGCATAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCAAGTGCAATCCCATGGGTTACACAAAAGAAGGCTGCAGGGGCATAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAAAGGCATTGGAACTCCCAGTGCCGAACTACCCAGTCGTACGTGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAAAGGCATTGGAACTCCCAGTGCCGAACTACCCAGTCGTACGTGCGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTTACCATGGATAGCAAAAAGAGAATTGGCTGGCGATTCATAAGGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTTACCATGGATAGCAAAAAGAGAATTGGCTGGCGATTCATAAGGATAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACACTTCTTGTGTATGTACATTGACCATTAAAAGGGGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACACTTCTTGTGTATGTACATTGACCATTAAAAGGGGAAGA