seq1 = pF1KB9794.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KB9794/gi568815594f_6616210.tfa (gi568815594f:6616210_6816860), 200651 bp

>pF1KB9794 651
>gi568815594f:6616210_6816860 (Chr4)

1-651  (100001-100651)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGGTAGCTTTTCGGATGGCGGAGCGCTGCCGGAGGGGCTCGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGGTAGCTTTTCGGATGGCGGAGCGCTGCCGGAGGGGCTCGCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGCCGAGCCGCAGGGCGCCGCCTGGAGCGGGGACAGTGGCACTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGGCCGAGCCGCAGGGCGCCGCCTGGAGCGGGGACAGTGGCACTGTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAGAGCCACAGCAGCGCCTCGGGGCCGTGGGAGGACGAGGGCGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCAGAGCCACAGCAGCGCCTCGGGGCCGTGGGAGGACGAGGGCGCGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGGCGCGCCGGGCCGCGACCTGCCGCTGCTTCGCCGCGCCGCTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGGCGCGCCGGGCCGCGACCTGCCGCTGCTTCGCCGCGCCGCTGCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACGCCGCCTGCCTGCTGCCCGGGGCCGGGGCGCGGCCCGAGGTCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACGCCGCCTGCCTGCTGCCCGGGGCCGGGGCGCGGCCCGAGGTCGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCTGGACGCGAGCCTAGAGGACCTGCTTACCAGAGTGGACGAGTTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCTGGACGCGAGCCTAGAGGACCTGCTTACCAGAGTGGACGAGTTCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCATGCTGGACATGCTTCGCGGCGACTCGTCCCACGTCGTCAGCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCATGCTGGACATGCTTCGCGGCGACTCGTCCCACGTCGTCAGCGAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTGCCGCGCATCCACGCGAAGGCCGCCGAGATGCGGCGCATCTACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTGCCGCGCATCCACGCGAAGGCCGCCGAGATGCGGCGCATCTACAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGATCGACCGGCTGGAGGCCTTCGTGAGGATGGTGGGGGGCCGCGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGATCGACCGGCTGGAGGCCTTCGTGAGGATGGTGGGGGGCCGCGTGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGGATGGAGGAGCAGGTCACCAAGGCCGAGGCCGAGCTGGGCACCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGATGGAGGAGCAGGTCACCAAGGCCGAGGCCGAGCTGGGCACCTTCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGGGCGTTCAAGAAGCTCCTGCACACGATGAACGTGCCCTCGCTCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGGGCGTTCAAGAAGCTCCTGCACACGATGAACGTGCCCTCGCTCTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAAGTCTGCTCCCTCGAGGCCACAGCAAGCCGGCTACGAAGCCCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAAGTCTGCTCCCTCGAGGCCACAGCAAGCCGGCTACGAAGCCCCCGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGTTTCGGACCGAAGACTACTTCCCTTGTTGCAGTGAAAGGCCTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGTTTCGGACCGAAGACTACTTCCCTTGTTGCAGTGAAAGGCCTCAGCT

    650 
    651 C
        |
 100651 C