seq1 = pF1KB9749.tfa, 1677 bp
seq2 = pF1KB9749/gi568815579r_6113045.tfa (gi568815579r:6113045_6370762), 257718 bp

>pF1KB9749 1677
>gi568815579r:6113045_6370762 (Chr19)

(complement)

10-193  (100001-100184)   100% ->
194-276  (108453-108535)   100% ->
277-420  (140050-140193)   100% ->
421-546  (143661-143786)   100% ->
547-1110  (148079-148642)   100% ->
1111-1198  (152722-152809)   100% ->
1199-1307  (154250-154358)   100% ->
1308-1407  (156725-156824)   100% ->
1408-1479  (156966-157037)   100% ->
1480-1551  (157355-157426)   100% ->
1552-1677  (157593-157718)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     10 CAGTGCACCGTCCAGGTGAGGTTAGAGCTGGGGCATCGCGCCCAACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CAGTGCACCGTCCAGGTGAGGTTAGAGCTGGGGCATCGCGCCCAACTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     60 CAAGAAGCCCACCACGGAGGGGTTCACTCACGACTGGATGGTGTTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGAAGCCCACCACGGAGGGGTTCACTCACGACTGGATGGTGTTTGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    110 GCGGCCCCGAGCAATGTGACATCCAGCACTTCGTGGAGAAGGTGGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGCCCCGAGCAATGTGACATCCAGCACTTCGTGGAGAAGGTGGTCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    160 TGGCTGCACGACAGCTTCCCCAAGCCCAGACGCG         TGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100151 TGGCTGCACGACAGCTTCCCCAAGCCCAGACGCGGTG...TAGTGTGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGCCCCCCTACAAAGTAGAGGAGTCGGGGTACGCTGGCTTCATCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108460 GGAGCCCCCCTACAAAGTAGAGGAGTCGGGGTACGCTGGCTTCATCATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCATCGAGGTGCACTTCAAAAACAAG         GAGGAGCCGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108510 CCATCGAGGTGCACTTCAAAAACAAGGTA...CAGGAGGAGCCGAGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTCTGCTTCACCTACGACCTGTTCCTGAACCTGGAAGGCAACCCGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140065 GTCTGCTTCACCTACGACCTGTTCCTGAACCTGGAAGGCAACCCGCCCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAACCACCTGCGCTGCGAGAAGCTCACCTTCAACAACCCCACCACGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140115 GAACCACCTGCGCTGCGAGAAGCTCACCTTCAACAACCCCACCACGGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCGGTACAAGCTCCTGCGGGCCGGCGGG         GTGATGGTAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 140165 TCCGGTACAAGCTCCTGCGGGCCGGCGGGGTG...TAGGTGATGGTAATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCGAAGGAGCAGACACGGTGTCCAGGCCCAGTCCCGACTACCCCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143673 CCCGAAGGAGCAGACACGGTGTCCAGGCCCAGTCCCGACTACCCCATGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACCCACAATTCCACTCTCTGCCTTCTCTGACCCCAAGAAGACCAAACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143723 ACCCACAATTCCACTCTCTGCCTTCTCTGACCCCAAGAAGACCAAACCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCCACGGCTCCAAG         GACGCCAACAAGGAGAGCAGCAAGACC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 143773 CCCACGGCTCCAAGGTT...CAGGACGCCAACAAGGAGAGCAGCAAGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCCAAGCCACACAAGGTGACCAAGGAGCACCGGGAGCGGCCCCGCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148106 TCCAAGCCACACAAGGTGACCAAGGAGCACCGGGAGCGGCCCCGCAAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTCCGAGAGCAAGAGCTCCTCCAAGGAGCTGGAGCGTGAGCAGGCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148156 CTCCGAGAGCAAGAGCTCCTCCAAGGAGCTGGAGCGTGAGCAGGCCAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCTCCAAGGACACCTCGCGGAAGCTGGGCGAGGGCCGGCTGCCCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148206 GCTCCAAGGACACCTCGCGGAAGCTGGGCGAGGGCCGGCTGCCCAAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAGAAGGCGCCACCGCCCAAGGCTGCCTTCAAGGAACCCAAGATGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148256 GAGAAGGCGCCACCGCCCAAGGCTGCCTTCAAGGAACCCAAGATGGCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAAAGAGACCAAGCTGGAAAGCACGTCCCCCAAGGGTGGGCCCCCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148306 GAAAGAGACCAAGCTGGAAAGCACGTCCCCCAAGGGTGGGCCCCCACCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CACCCCCACCCCCACCCCGGGCTTCCAGCAAGCGGCCGGCCACCGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148356 CACCCCCACCCCCACCCCGGGCTTCCAGCAAGCGGCCGGCCACCGCCGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TCGCCAAAGCCCAGCGCCAAGAAGCAGAAGAAGAGCAGCTCGAAGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148406 TCGCCAAAGCCCAGCGCCAAGAAGCAGAAGAAGAGCAGCTCGAAGGGGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCGGAGTGCTCCAGGCACCTCGCCCCGCACCTCCTCCTCCTCCTCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148456 CCGGAGTGCTCCAGGCACCTCGCCCCGCACCTCCTCCTCCTCCTCCTTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CGGACAAGAAGCCGGCCAAGGACAAGAGCAGCACCAGAGGGGAGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148506 CGGACAAGAAGCCGGCCAAGGACAAGAGCAGCACCAGAGGGGAGAAGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AAGGCCGAGAGTGAGCCCCGGGAGGCCAAAAAGGCCCTGGAGGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148556 AAGGCCGAGAGTGAGCCCCGGGAGGCCAAAAAGGCCCTGGAGGTGGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GTCCAACTCAGAGGACGAGGCCTCCTTCAAGTCCGAG         TCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 148606 GTCCAACTCAGAGGACGAGGCCTCCTTCAAGTCCGAGGTG...AAGTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CCCAGTCAAGCCCGTCCAACTCCAGCTCCAGCTCAGACTCCAGCTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152726 CCCAGTCAAGCCCGTCCAACTCCAGCTCCAGCTCAGACTCCAGCTCAGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TCAGACTTCGAGCCATCCCAGAACCACAGCCAAG         GACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 152776 TCAGACTTCGAGCCATCCCAGAACCACAGCCAAGGTG...CAGGACCCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GCGCTCCATGGTGGAGGACCTGCAGTCCGAGGAGTCCGACGAGGACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154257 GCGCTCCATGGTGGAGGACCTGCAGTCCGAGGAGTCCGACGAGGACGACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CTTCGTCAGGCGAGGAGGCTGCCGGCAAGACCAACCCGGGGAGGGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154307 CTTCGTCAGGCGAGGAGGCTGCCGGCAAGACCAACCCGGGGAGGGACTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 AG         GTTGAGCTTCAGCGACAGCGAGAGTGACAACAGCGCCGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154357 AGGTG...CAGGTTGAGCTTCAGCGACAGCGAGAGTGACAACAGCGCCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CTCCTCCCTGCCCAGCCGTGAGCCCCCACCCCCCCAGAAGCCACCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156764 CTCCTCCCTGCCCAGCCGTGAGCCCCCACCCCCCCAGAAGCCACCCCCGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 CCAACAGCAAG         GTGTCAGGCCGGAGGAGCCCCGAGTCCTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 156814 CCAACAGCAAGGTG...CAGGTGTCAGGCCGGAGGAGCCCCGAGTCCTGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 AGCAAGCCTGAGAAGATCCTCAAGAAGGGCACCTACGACAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 156996 AGCAAGCCTGAGAAGATCCTCAAGAAGGGCACCTACGACAAGGTG...CA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1480  GCCTACACGGATGAGCTGGTGGAGCTACACCGGAGGCTGATGGCGCTGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157354 GGCCTACACGGATGAGCTGGTGGAGCTACACCGGAGGCTGATGGCGCTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GGGAGCGCAACGTGCTGCAGCAG         ATTGTGAATCTGATCGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 157404 GGGAGCGCAACGTGCTGCAGCAGGTA...CAGATTGTGAATCTGATCGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GAGACTGGCCACTTCAATGTCACCAACACCACCTTCGACTTCGACCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157611 GAGACTGGCCACTTCAATGTCACCAACACCACCTTCGACTTCGACCTCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CTCCCTGGACGAGACCACCGTGCGCAAACTGCAGAGCTGCCTGGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157661 CTCCCTGGACGAGACCACCGTGCGCAAACTGCAGAGCTGCCTGGAGGCCG

   1750     .
   1670 TGGCCACA
        ||||||||
 157711 TGGCCACA