seq1 = pF1KB9720.tfa, 1212 bp
seq2 = pF1KB9720/gi568815579r_17132355.tfa (gi568815579r:17132355_17345220), 212866 bp

>pF1KB9720 1212
>gi568815579r:17132355_17345220 (Chr19)

(complement)

1-278  (100001-100278)   100% ->
279-373  (104456-104550)   100% ->
374-940  (109156-109722)   100% ->
941-1212  (112595-112866)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCATGGTGACCGGCGGCTGGGGCGGCCCCGGCGGCGACACGAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCATGGTGACCGGCGGCTGGGGCGGCCCCGGCGGCGACACGAACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGGACAAGGCGGGCGGCTACCCGCGCGCGGCCGAGGACGACTCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTGGACAAGGCGGGCGGCTACCCGCGCGCGGCCGAGGACGACTCGGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCCCCCGGTGCCGCCAGCGACGCCGAGCCGGGCGACGAGGAGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCCCCCGGTGCCGCCAGCGACGCCGAGCCGGGCGACGAGGAGCGGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCTGCAGGTGGACTGCGTGGTGTGCGGGGACAAGTCGAGCGGCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGCTGCAGGTGGACTGCGTGGTGTGCGGGGACAAGTCGAGCGGCAAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTACGGTGTCTTCACCTGCGAGGGCTGCAAGAGCTTTTTCAAGCGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTACGGTGTCTTCACCTGCGAGGGCTGCAAGAGCTTTTTCAAGCGAAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCGCCGCAACCTCAGCTACACCTGCCG         GTCCAACCGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100251 TCCGCCGCAACCTCAGCTACACCTGCCGGTG...CAGGTCCAACCGTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCCAGATCGACCAGCACCACCGGAACCAGTGCCAGTACTGCCGTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104469 TGCCAGATCGACCAGCACCACCGGAACCAGTGCCAGTACTGCCGTCTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAGTGCTTCCGGGTGGGCATGAGGAAGGAGG         CGGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104519 GAAGTGCTTCCGGGTGGGCATGAGGAAGGAGGGTG...CAGCGGTGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCGGCCGCATCCCGCACTCGCTGCCTGGTGCCGTGGCCGCCTCCTCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109165 GCGGCCGCATCCCGCACTCGCTGCCTGGTGCCGTGGCCGCCTCCTCGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCCCCCCGGGCTCGGCGCTGGCGGCAGTGGCGAGCGGCGGAGACCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109215 AGCCCCCCGGGCTCGGCGCTGGCGGCAGTGGCGAGCGGCGGAGACCTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCCGGGGCAGCCGGTGTCCGAACTGATCGCGCAGCTGCTGCGCGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109265 CCCGGGGCAGCCGGTGTCCGAACTGATCGCGCAGCTGCTGCGCGCTGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTACCCTGCGGCGGCCGGACGCTTCGGCGCAGGGGGCGGCGCGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109315 CCTACCCTGCGGCGGCCGGACGCTTCGGCGCAGGGGGCGGCGCGGCGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCGGTGCTGGGCATCGACAACGTGTGCGAGCTGGCGGCGCGGCTGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109365 GCGGTGCTGGGCATCGACAACGTGTGCGAGCTGGCGGCGCGGCTGCTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CAGCACCGTGGAGTGGGCGCGCCACGCGCCCTTCTTCCCCGAGCTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109415 CAGCACCGTGGAGTGGGCGCGCCACGCGCCCTTCTTCCCCGAGCTGCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGGCCGACCAGGTGGCGCTGCTGCGCCTGAGCTGGAGCGAGCTCTTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109465 TGGCCGACCAGGTGGCGCTGCTGCGCCTGAGCTGGAGCGAGCTCTTCGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTGAACGCGGCGCAGGCGGCGCTGCCCCTGCACACGGCGCCGCTACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109515 CTGAACGCGGCGCAGGCGGCGCTGCCCCTGCACACGGCGCCGCTACTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CGCCGCCGGCCTCCACGCCGCGCCTATGGCCGCCGAGCGCGCCGTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109565 CGCCGCCGGCCTCCACGCCGCGCCTATGGCCGCCGAGCGCGCCGTGGCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TCATGGACCAGGTGCGCGCCTTCCAGGAGCAGGTGGACAAGCTGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109615 TCATGGACCAGGTGCGCGCCTTCCAGGAGCAGGTGGACAAGCTGGGCCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CTGCAGGTCGACTCGGCCGAGTATGGCTGCCTCAAGGCCATCGCGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109665 CTGCAGGTCGACTCGGCCGAGTATGGCTGCCTCAAGGCCATCGCGCTCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CACGCCCG         ACGCCTGTGGCCTCTCAGACCCGGCCCACGTTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109715 CACGCCCGGTG...TAGACGCCTGTGGCCTCTCAGACCCGGCCCACGTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGAGCCTGCAGGAGAAGGCGCAGGTGGCCCTCACCGAGTATGTGCGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112628 AGAGCCTGCAGGAGAAGGCGCAGGTGGCCCTCACCGAGTATGTGCGGGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CAGTACCCGTCCCAGCCCCAGCGCTTCGGGCGCCTGCTGCTGCGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112678 CAGTACCCGTCCCAGCCCCAGCGCTTCGGGCGCCTGCTGCTGCGGCTCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CGCCCTGCGCGCGGTCCCTGCCTCCCTCATCTCCCAGCTGTTCTTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112728 CGCCCTGCGCGCGGTCCCTGCCTCCCTCATCTCCCAGCTGTTCTTCATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GCCTGGTGGGGAAGACGCCCATTGAGACACTGATCAGAGACATGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112778 GCCTGGTGGGGAAGACGCCCATTGAGACACTGATCAGAGACATGCTGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1174 TCGGGGAGTACCTTCAACTGGCCCTACGGCTCGGGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112828 TCGGGGAGTACCTTCAACTGGCCCTACGGCTCGGGCCAG