seq1 = pF1KB9656.tfa, 477 bp
seq2 = pF1KB9656/gi568815575f_103529917.tfa (gi568815575f:103529917_103730393), 200477 bp

>pF1KB9656 477
>gi568815575f:103529917_103730393 (ChrX)

1-477  (100001-100477)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAAACCACGCAAAGAAAATGAAGAAGAGCCGCAGAGCGCGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAAACCACGCAAAGAAAATGAAGAAGAGCCGCAGAGCGCGCCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCGATGAGGAGAGGCCTCCGGTGGAGCACTCTCCCGAAAAGCAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCGATGAGGAGAGGCCTCCGGTGGAGCACTCTCCCGAAAAGCAGTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGAGGAGCAGTCTTCGGAGGAGCAGTCCTCGGAGGAGGAGTTCTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGAGGAGCAGTCTTCGGAGGAGCAGTCCTCGGAGGAGGAGTTCTTTCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGAGCTCTTGCCTGAGCTCCTGCCTGAGATGCTCCTCTCGGAGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGAGCTCTTGCCTGAGCTCCTGCCTGAGATGCTCCTCTCGGAGGAGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCTCCGCAGGAGGGTCTTTCCAGGAAGGACCTGTTTGAGGGGCGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCTCCGCAGGAGGGTCTTTCCAGGAAGGACCTGTTTGAGGGGCGCCCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCATGGAGCAGCCTCCTTGTGGAGTAGGAAAACATAAGCTTGAAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCATGGAGCAGCCTCCTTGTGGAGTAGGAAAACATAAGCTTGAAGAAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCTTTAAAGAAAGGTTGGCTCGTTCTCGCCCGCAATTTAGAGGGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCTTTAAAGAAAGGTTGGCTCGTTCTCGCCCGCAATTTAGAGGGGACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACATGGCAGAAATTTAAGCAATGAGGAGATGATACAGGCAGCAGATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACATGGCAGAAATTTAAGCAATGAGGAGATGATACAGGCAGCAGATGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAGAAGAGATGAAAAGAGTAAGAAACAAACTGATGATAATGCACTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAGAAGAGATGAAAAGAGTAAGAAACAAACTGATGATAATGCACTGGAAG

    450     .    :    .    :    .
    451 GCAAAACGGAGCCGTCCTTATCCTATT
        |||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAAAACGGAGCCGTCCTTATCCTATT