seq1 = pF1KB9653.tfa, 828 bp
seq2 = pF1KB9653/gi568815585r_94611222.tfa (gi568815585r:94611222_94812049), 200828 bp

>pF1KB9653 828
>gi568815585r:94611222_94812049 (Chr13)

(complement)

1-828  (100001-100828)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAAGCCGGTGGACCACGTCAAGCGGCCCATGAACGCCTTCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCAAGCCGGTGGACCACGTCAAGCGGCCCATGAACGCCTTCATGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGTCGCGGGCTCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGGTCGCGGGCTCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCTTGGGCGCCGAGTGGAAACTGCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCTTGGGCGCCGAGTGGAAACTGCTCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGTCGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCCAAGCGTCTACGCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGTCGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCCAAGCGTCTACGCGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCACATGAAGGAGCACCCCGACTACAAGTACCGGCCGCGGCGCAAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCACATGAAGGAGCACCCCGACTACAAGTACCGGCCGCGGCGCAAGCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGACGCTCCTCAAGAAGGACAAGTTCGCCTTCCCGGTGCCCTACGGCCTG
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGACGCTGCTCAAGAAGGACAAGTTCGCCTTCCCGGTGCCCTACGGCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGGCGTGGCGGACGCCGAGCACCCTGCGCTCAAGGCGGGCGCCGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGGCGTGGCGGACGCCGAGCACCCTGCGCTCAAGGCGGGCGCCGGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCACGCGGGGGCGGGCGGCGGCCTGGTGCCTGAGTCGCTGCTCGCCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCACGCGGGGGCGGGCGGCGGCCTGGTGCCTGAGTCGCTGCTCGCCAATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGAGAAGGCGGCCGCGGCCGCCGCCGCTGCCGCCGCACGCGTCTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGAGAAGGCGGCCGCGGCCGCCGCCGCTGCCGCCGCACGCGTCTTCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCGCAGTCGGCCGCTGCCGCCGCCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCGCAGTCGGCCGCTGCCGCCGCCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGCCCCTACTCGCTGCTCGACCTGGGCTCCAAAATGGCAGAGATCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGCCCCTACTCGCTGCTCGACCTGGGCTCCAAAATGGCAGAGATCTCGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGTCCTCGTCCGGCCTCCCGTACGCGTCGTCGCTGGGCTACCCGACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGTCCTCGTCCGGCCTCCCGTACGCGTCGTCGCTGGGCTACCCGACCGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCGCGGGCGCCTTCCACGGCGCGGCGGCGGCGGCTGCAGCGGCGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCGCGGGCGCCTTCCACGGCGCGGCGGCGGCGGCTGCAGCGGCGGCCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGCCGCCGGGGGGCACACGCACTCGCACCCCAGCCCGGGCAACCCGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGCCGCCGGGGGGCACACGCACTCGCACCCCAGCCCGGGCAACCCGGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACATGATCCCGTGCAACTGCAGCGCGTGGCCCAGCCCCGGGCTGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACATGATCCCGTGCAACTGCAGCGCGTGGCCCAGCCCCGGGCTGCAGCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCGCTCGCCTACATCCTGCTGCCGGGCATGGGCAAGCCCCAGCTGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCGCTCGCCTACATCCTGCTGCCGGGCATGGGCAAGCCCCAGCTGGACCC

    800     .    :    .    :    .
    801 CTACCCCGCGGCCTACGCTGCCGCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTACCCCGCGGCCTACGCTGCCGCGCTA