seq1 = pF1KB9644.tfa, 537 bp
seq2 = pF1KB9644/gi568815578r_35853748.tfa (gi568815578r:35853748_36054284), 200537 bp

>pF1KB9644 537
>gi568815578r:35853748_36054284 (Chr20)

(complement)

1-537  (100001-100537)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTACGGAGCCGATCTTGGCGGCCACTGGGAGTCCCGCGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTACGGAGCCGATCTTGGCGGCCACTGGGAGTCCCGCGGCGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCACCGGAGAAACTGGAAGGAGCCGGTTCGAGCTCAGCCCCTGAGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCACCGGAGAAACTGGAAGGAGCCGGTTCGAGCTCAGCCCCTGAGCGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGTGTGGGCTCCTCGCTGCCAGAGGCCTCACCGCCTGCCCCTGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGTGTGGGCTCCTCGCTGCCAGAGGCCTCACCGCCTGCCCCTGAGCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCAGTCCCAACGCCGCGGTCCCTGAAGCCATCCCTACGCCCCGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCAGTCCCAACGCCGCGGTCCCTGAAGCCATCCCTACGCCCCGAGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCTCCGCGGCCCTGGAGCTGCCTCTCGGGCCCGCACCCGTGAGCGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCTCCGCGGCCCTGGAGCTGCCTCTCGGGCCCGCACCCGTGAGCGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCCTCAGGCCGAAGCTGAAGCGCGCTCCACACCAGGCCCCGCCGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCCTCAGGCCGAAGCTGAAGCGCGCTCCACACCAGGCCCCGCCGGCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGACTCGGTCCCGAGACGTTCCGCCAGCGTTTCCGGCAGTTCCGCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGACTCGGTCCCGAGACGTTCCGCCAGCGTTTCCGGCAGTTCCGCTACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGATGCGGCGGGTCCCCGGGAGGCTTTCCGGCAGCTGCGGGAGCTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGATGCGGCGGGTCCCCGGGAGGCTTTCCGGCAGCTGCGGGAGCTGTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCAGTGGCTGCGGCCTGACATCCGCACCAAGGAGCAGATCGTGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCAGTGGCTGCGGCCTGACATCCGCACCAAGGAGCAGATCGTGGAGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGTGCAAGAGCAGCTGCTCGCCATCCTGCCCGAGGCGGCTCGGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGTGCAAGAGCAGCTGCTCGCCATCCTGCCCGAGGCGGCTCGGGCCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .
    501 GCGGATCCGCCGCCGCACGGATGTGCGCATCACTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCGGATCCGCCGCCGCACGGATGTGCGCATCACTGGC