seq1 = pF1KB9637.tfa, 1233 bp
seq2 = pF1KB9637/gi568815592r_143841427.tfa (gi568815592r:143841427_144042659), 201233 bp

>pF1KB9637 1233
>gi568815592r:143841427_144042659 (Chr6)

(complement)

1-1233  (100001-101233)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTACCCATTCTCCCCAGAAATCTCACCAGTGTGCTCACTGTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTACCCATTCTCCCCAGAAATCTCACCAGTGTGCTCACTGTGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACGTTCAACCGGAAAGACCACCTGAAAAACCACCTCCAGACCCACGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACGTTCAACCGGAAAGACCACCTGAAAAACCACCTCCAGACCCACGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAACAAAATGGCCTTTGGGTGTGAGGAGTGTGGGAAGAAGTACAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAACAAAATGGCCTTTGGGTGTGAGGAGTGTGGGAAGAAGTACAACACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGCTGGGCTATAAGAGGCACCTGGCCCTCCATGCGGCCAGCAGTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGCTGGGCTATAAGAGGCACCTGGCCCTCCATGCGGCCAGCAGTGGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCACCTGTGGGGTCTGTGCCCTGGAGCTAGGGAGCACCGAGGTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCACCTGTGGGGTCTGTGCCCTGGAGCTAGGGAGCACCGAGGTGCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGACCACCTCAAAGCCCATGCGGAAGAGAAGCCCCCTAGCGGAACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGACCACCTCAAAGCCCATGCGGAAGAGAAGCCCCCTAGCGGAACCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAAAGAAGCACCAGTGCGACCACTGTGAAAGATGCTTCTACACCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAAAGAAGCACCAGTGCGACCACTGTGAAAGATGCTTCTACACCCGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGATGTGCGACGCCACCTGGTGGTCCACACAGGATGCAAGGACTTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGATGTGCGACGCCACCTGGTGGTCCACACAGGATGCAAGGACTTCCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCAGTTCTGTGCCCAGAGATTTGGGCGCAAGGATCACCTCACCCGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCAGTTCTGTGCCCAGAGATTTGGGCGCAAGGATCACCTCACCCGGCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACCAAGAAGACCCACTCACAGGAGCTGATGAAAGAGAGCTTGCAGACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACCAAGAAGACCCACTCACAGGAGCTGATGAAAGAGAGCTTGCAGACCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGACCTTCTGAGCACCTTCCACACCATCTCGCCTTCATTCCAACTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGACCTTCTGAGCACCTTCCACACCATCTCGCCTTCATTCCAACTGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGCTGCCTTGCCTCCTTTCCCTTTAGGAGCTTCTGCCCAGAACGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGCTGCCTTGCCTCCTTTCCCTTTAGGAGCTTCTGCCCAGAACGGGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCAAGTAGCTTGCCAGCTGAGGTCCATAGCCTCACCCTCAGTCCCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCAAGTAGCTTGCCAGCTGAGGTCCATAGCCTCACCCTCAGTCCCCCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACAAGCCGCCCAGCCTATGCAGCCGCTGCCAGAGTCCCTGGCCTCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ACAAGCCGCCCAGCCTATGCAGCCGCTGCCAGAGTCCCTGGCCTCCCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCCCTCGGTATCCCCTGGCTCTCCTCCGCCACCCCTTCCCAATCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCCCTCGGTATCCCCTGGCTCTCCTCCGCCACCCCTTCCCAATCACAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TACAACACCACTTCTACCTCATACTCCCCACTTGCAAGCCTGCCCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TACAACACCACTTCTACCTCATACTCCCCACTTGCAAGCCTGCCCCTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGCAGATACTAAAGGTTTTTGCAATATCAGTTTGTTTGAGGACTTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGCAGATACTAAAGGTTTTTGCAATATCAGTTTGTTTGAGGACTTGCCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCAAGAGCCTCAGTCACCTCAAAAGCTCAACCCAGGTTTTGATCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCAAGAGCCTCAGTCACCTCAAAAGCTCAACCCAGGTTTTGATCTGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAGGGAAATGCTGGTAAAGTAAACCTGCCCAAGGAGCTGCCTGCAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGGGAAATGCTGGTAAAGTAAACCTGCCCAAGGAGCTGCCTGCAGATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGTGAACCTAACAATACCTGCCTCTCTGGACCTGTCCCCCCTGTTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGTGAACCTAACAATACCTGCCTCTCTGGACCTGTCCCCCCTGTTGGGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCTGGCAGCTGCCCCCTCCTGCTACCCAAAATACCTTTGGGAATAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCTGGCAGCTGCCCCCTCCTGCTACCCAAAATACCTTTGGGAATAGCACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTTGCCCTGGGGCCTGGGGAATCTTTGCCCCACAGGTTAAGCTGTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTTGCCCTGGGGCCTGGGGAATCTTTGCCCCACAGGTTAAGCTGTCTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCAGCAGCAGCAAGAACCCCCACTTGCCATGGGCACTGTGAGCCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCAGCAGCAGCAAGAACCCCCACTTGCCATGGGCACTGTGAGCCTGGGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGCTCCCCCTGCCCCCCATCCCTCATGTGTTCTCAGCTGGCACTGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGCTCCCCCTGCCCCCCATCCCTCATGTGTTCTCAGCTGGCACTGGCTCT

   1200     .    :    .    :    .    :
   1201 GCCATCCTGCCTCATTTCCATCATGCATTCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GCCATCCTGCCTCATTTCCATCATGCATTCAGA