seq1 = pF1KB9614.tfa, 1506 bp
seq2 = pF1KB9614/gi568815581f_4991505.tfa (gi568815581f:4991505_5193010), 201506 bp

>pF1KB9614 1506
>gi568815581f:4991505_5193010 (Chr17)

1-1506  (100001-101506)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGACTGAGAACAAGGAGGTGATTCCCAAGGAAGAAATTTCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGACTGAGAACAAGGAGGTGATTCCCAAGGAAGAAATTTCTGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTGAGCCACATGGGTCATTATTAGAAAAATTTCCAAAAGTGGTTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCTGAGCCACATGGGTCATTATTAGAAAAATTTCCAAAAGTGGTTTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGTCATGAGTTTGGAGCAGGATGTGAAGAAGACATGTTGGAGGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGTCATGAGTTTGGAGCAGGATGTGAAGAAGACATGTTGGAGGGACAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGAGAGAGTCCATGGAAGAGGTTATAGAGCAGATGTCTCCTCAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGAGAGAGTCCATGGAAGAGGTTATAGAGCAGATGTCTCCTCAGGAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGACTTTCCATCAGGGTTGATGATCTTTAAGAAATCACCCTCAAGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGACTTTCCATCAGGGTTGATGATCTTTAAGAAATCACCCTCAAGTGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGACCGGGAGAATAATGAGAGTGAGAGAGGCTGCAGTCCCAGCCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGACCGGGAGAATAATGAGAGTGAGAGAGGCTGCAGTCCCAGCCCAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTTACACATCAGGGAGATACAACAGAGGGAGTTAGTGCATTTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGTTACACATCAGGGAGATACAACAGAGGGAGTTAGTGCATTTGCTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCTGGCCAAAACTTCCTAGAGATTTTAGAATCTAACAAAACACAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCTGGCCAAAACTTCCTAGAGATTTTAGAATCTAACAAAACACAGAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTTCTGTGGGAGAAAAGCCTCATACATGTAAAGAATGTGGGAAAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTTCTGTGGGAGAAAAGCCTCATACATGTAAAGAATGTGGGAAAGCCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AATCAGAACTCACATCTCATCCAGCATATGAGAGTTCATAGTGGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AATCAGAACTCACATCTCATCCAGCATATGAGAGTTCATAGTGGAGAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACCCTTTGAATGTAAAGAATGTGGAAAGACATTTGGAACTAATTCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACCCTTTGAATGTAAAGAATGTGGAAAGACATTTGGAACTAATTCAAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCGACGGCACCTGAGAATTCATGCTGGAGAAAAACCCTTTGCTTGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTCGACGGCACCTGAGAATTCATGCTGGAGAAAAACCCTTTGCTTGTAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAATGTGGAAAGGCCTTCATTCAGAGTTCACACCTTATTCACCATCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAATGTGGAAAGGCCTTCATTCAGAGTTCACACCTTATTCACCATCATAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AATTCATACTGGAGAGAGACCCTATAAATGTGAAGAATGTGGTAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AATTCATACTGGAGAGAGACCCTATAAATGTGAAGAATGTGGTAAAGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAGTCAAAATTCAGCCCTTATTCTACACCAGAGAATCCATACTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAGTCAAAATTCAGCCCTTATTCTACACCAGAGAATCCATACTGGAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAACCATATGAATGTAATGAATGTGGGAAGACCTTTAGGGTTAGTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAACCATATGAATGTAATGAATGTGGGAAGACCTTTAGGGTTAGTTCACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCTTATTCAGCATCAGAGAATTCATACTGAAGAAAGATACCATGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCTTATTCAGCATCAGAGAATTCATACTGAAGAAAGATACCATGAATGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGAGTGTGGCAAAGCCTTCAAGCATAGCTCAGGCCTTATTAGACACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGAGTGTGGCAAAGCCTTCAAGCATAGCTCAGGCCTTATTAGACACCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAAATTCATACTGGAGAAAAACCATATCTGTGTAATGAATGTGGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAAATTCATACTGGAGAAAAACCATATCTGTGTAATGAATGTGGGAAGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTTCGGGCAGAGTTCTGAGCTTATCCGGCATCAGAGAATTCATACAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTTCGGGCAGAGTTCTGAGCTTATCCGGCATCAGAGAATTCATACAGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGGGAAAACTTTTGGCCAGAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGGGAAAACTTTTGGCCAGAACTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGATTATTAGACATATTAGAATTCATACTGGTGAGAAGCCCTATGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGATTATTAGACATATTAGAATTCATACTGGTGAGAAGCCCTATGTATG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TAAGGAATGTGGGAAGGCCTTCAGGGGGAACTCAGAACTTCTTAGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TAAGGAATGTGGGAAGGCCTTCAGGGGGAACTCAGAACTTCTTAGACATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGCTTTGAGTGTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGCTTTGAGTGTGGAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GCTTTCAGGCGGACCTCTCACCTTATTGTCCACCAGAGAATTCATACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GCTTTCAGGCGGACCTCTCACCTTATTGTCCACCAGAGAATTCATACTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AGAGAAACCCCATCAATGTAATGAGTGTGCAAGAACCTTTTGGGATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGAGAAACCCCATCAATGTAATGAGTGTGCAAGAACCTTTTGGGATAATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CTGAGCTGCTTCTCCACCAGAAAATTCATATTGGAGAGAAACCTTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CTGAGCTGCTTCTCCACCAGAAAATTCATATTGGAGAGAAACCTTATGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TGTAGCGAGTGTGAGAAAACATTTAGCCAGCATTCCCAACTTATCATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TGTAGCGAGTGTGAGAAAACATTTAGCCAGCATTCCCAACTTATCATACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCTTATGAGTGCCAAGAATGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCTTATGAGTGCCAAGAATGTCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGACTTTTAGTCGGAGCTCTCACCTCCTCCGACATCAAAGTGTTCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGACTTTTAGTCGGAGCTCTCACCTCCTCCGACATCAAAGTGTTCACTGT

   1500     .
   1501 ATGGAG
        ||||||
 101501 ATGGAG