seq1 = pF1KB9610.tfa, 1569 bp
seq2 = pF1KB9610/gi568815587f_94897373.tfa (gi568815587f:94897373_95098941), 201569 bp

>pF1KB9610 1569
>gi568815587f:94897373_95098941 (Chr11)

1-1569  (100001-101569)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAACTATGAAGTCTAAGGCCAACTGTGCCCAGAATCCAAATTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAACTATGAAGTCTAAGGCCAACTGTGCCCAGAATCCAAATTGTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATAATGATATTTCATCCAACCAAAGAAGAGTTTAATGATTTTGATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATAATGATATTTCATCCAACCAAAGAAGAGTTTAATGATTTTGATAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATATTGCTTACATGGAATCCCAAGGTGCACACAGAGCTGGCTTGGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATATTGCTTACATGGAATCCCAAGGTGCACACAGAGCTGGCTTGGCTAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATAATTCCACCCAAAGAATGGAAAGCCAGAGAGACCTATGATAATATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATAATTCCACCCAAAGAATGGAAAGCCAGAGAGACCTATGATAATATCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAAATCTTAATAGCCACTCCCCTCCAGCAGGTGGCCTCTGGGCGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAAATCTTAATAGCCACTCCCCTCCAGCAGGTGGCCTCTGGGCGGGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGTGTTTACTCAATACCATAAAAAAAAGAAAGCCATGACTGTGGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGTGTTTACTCAATACCATAAAAAAAAGAAAGCCATGACTGTGGGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TATCGCCATTTGGCAAACAGTAAAAAATATCAGACTCCACCACACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TATCGCCATTTGGCAAACAGTAAAAAATATCAGACTCCACCACACCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTCGAAGATTTGGAGCGAAAATACTGGAAGAACCGCATCTATAATTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTCGAAGATTTGGAGCGAAAATACTGGAAGAACCGCATCTATAATTCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGATTTATGGTGCTGACATCAGTGGCTCCTTGTTTGATGAAAACACTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGATTTATGGTGCTGACATCAGTGGCTCCTTGTTTGATGAAAACACTAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAATGGAATCTTGGGCACCTGGGAACAATTCAGGACCTGCTGGAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAATGGAATCTTGGGCACCTGGGAACAATTCAGGACCTGCTGGAAAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATGTGGGGTTGTCATAGAAGGCGTCAATACACCCTACTTGTACTTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATGTGGGGTTGTCATAGAAGGCGTCAATACACCCTACTTGTACTTTGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTGGAAAACCACGTTTGCTTGGCATACAGAGGACATGGACCTTTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTGGAAAACCACGTTTGCTTGGCATACAGAGGACATGGACCTTTACAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCAACTACCTGCACCTTGGGGAGCCCAAAACTTGGTATGTGGTGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCAACTACCTGCACCTTGGGGAGCCCAAAACTTGGTATGTGGTGCCCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGAACATGGCCAGCGCCTGGAACGCCTGGCCAGGGAGCTCTTCCCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGAACATGGCCAGCGCCTGGAACGCCTGGCCAGGGAGCTCTTCCCAGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTTCCCGGGGTTGTGGGGCCTTCCTGCGGCACAAGGTGGCCCTCATCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTTCCCGGGGTTGTGGGGCCTTCCTGCGGCACAAGGTGGCCCTCATCTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTACAGTTCTCAAGGAAAATGGGATTCCCTTCAATCGCATAACTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTACAGTTCTCAAGGAAAATGGGATTCCCTTCAATCGCATAACTCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCTGGAGAGTTCATGGTGACCTTTCCCTATGGCTACCATGCTGGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCTGGAGAGTTCATGGTGACCTTTCCCTATGGCTACCATGCTGGCTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCATGGTTTCAACTGCGCAGAGGCCATCAATTTTGCCACTCCGCGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCATGGTTTCAACTGCGCAGAGGCCATCAATTTTGCCACTCCGCGATGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATTGATTATGGCAAAATGGCCTCCCAGTGTAGCTGTGGGGAGGCAAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATTGATTATGGCAAAATGGCCTCCCAGTGTAGCTGTGGGGAGGCAAGGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GACCTTTTCCATGGATGCCTTCGTGCGCATCCTGCAACCTGAACGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GACCTTTTCCATGGATGCCTTCGTGCGCATCCTGCAACCTGAACGCTATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACCTGTGGAAACGTGGGCAAGACCGGGCAGTTGTGGACCACATGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACCTGTGGAAACGTGGGCAAGACCGGGCAGTTGTGGACCACATGGAGCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGGGTACCAGCCAGCCAAGAGCTGAGCACCCAGAAGGAAGTCCAGTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGGGTACCAGCCAGCCAAGAGCTGAGCACCCAGAAGGAAGTCCAGTTACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAGGAGAGCAGCGCTGGGCCTGAGACAACTCCCTTCCCACTGGGCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAGGAGAGCAGCGCTGGGCCTGAGACAACTCCCTTCCCACTGGGCCCGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ATTCCCCTTGGCCTATGGCTGCCCGCAGTGGGACACGGTGCCACACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ATTCCCCTTGGCCTATGGCTGCCCGCAGTGGGACACGGTGCCACACCCTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GTGTGCTCTTCACTCCCACGCCGATCTGCAGTTAGTGGCACTGCTACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GTGTGCTCTTCACTCCCACGCCGATCTGCAGTTAGTGGCACTGCTACGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCCCCGGGCTGCTGCTGTCCACAGCTCTAAGAAGCCCAGCTCAACTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GCCCCGGGCTGCTGCTGTCCACAGCTCTAAGAAGCCCAGCTCAACTCCAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CATCCACCCCTGGTCCATCTGCACAGATTATCCACCCGTCAAATGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CATCCACCCCTGGTCCATCTGCACAGATTATCCACCCGTCAAATGGCAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CGTGGTCGTGGTCGCCCTCCTCAGAAACTGAGAGCTCAGGAGCTGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CGTGGTCGTGGTCGCCCTCCTCAGAAACTGAGAGCTCAGGAGCTGACCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CCAGACTCCAGCCAAGAGGCCCCTCTTGGCGGGCACAACATGCACAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CCAGACTCCAGCCAAGAGGCCCCTCTTGGCGGGCACAACATGCACAGCTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CGGGCCCAGAACCTGAGCCCCTACCTGAGGATGGGGCTTTGATGGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CGGGCCCAGAACCTGAGCCCCTACCTGAGGATGGGGCTTTGATGGACAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CCTGTACCACTGAGCCCAGGGCTCCAGCATCCTGTCAAGGCTTCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CCTGTACCACTGAGCCCAGGGCTCCAGCATCCTGTCAAGGCTTCTGGGTG

   1550     .    :    .
   1551 CAGCTGGGCCCCTGTGCCC
        |||||||||||||||||||
 101551 CAGCTGGGCCCCTGTGCCC